【技术实现步骤摘要】
本申请涉及基因测序,特别是涉及一种基因与假基因共存下的基因突变识别方法和系统。
技术介绍
1、对于一些结构复杂且存在多个假基因(同源区域)的复杂基因(如pkd(polycystickidney disease,多囊肾病)1基因等)的变异位点的检测,通常是较为困难的。
2、例如,有一些是基于如lr-pcr(长读长-聚合酶链反应)、单链构像多态性分析、高效液相色谱等技术对这些复杂基因的突变进行全面分析,但是这些技术存在诸如影响因素较多、结果不稳定、准确性低、工作量巨大、效率低等局限性,限制了其临床应用。
3、还有一些是需要对这些复杂基因区域设计特异引物并进行扩增反应,来检测基因的突变,如中国专利cn104975081a中公开了一种检测pkd1基因突变的扩增引物、试剂盒及其检测方法,其中涉及一种检测pkd1基因突变方法,其利用pkd1基因的序列信息设计9对pcr引物,应用长链pcr技术靶向扩增pkd1基因,同时在扩增产物加上标签、pcr产物纯化、混合后直接建立测序文库(如连接哑铃测序接头),应用测序仪进行测序,通过生物
...【技术保护点】
1.一种基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述基因与假基因共存下的基因突变识别方法包括:
2.根据权利要求1所述的基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述获取基于所述测序数据识别得到的变异信息,包括:
3.根据权利要求2所述的基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述根据包括所述变异信息和所述特异性核苷酸位点,识别错误比对,以鉴别得到所述待检测样本中所述目标基因的突变信息,包括:
4.根据权利要求1所述的基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述基因与假基因共存下的基因突变识别方
<...【技术特征摘要】
1.一种基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述基因与假基因共存下的基因突变识别方法包括:
2.根据权利要求1所述的基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述获取基于所述测序数据识别得到的变异信息,包括:
3.根据权利要求2所述的基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述根据包括所述变异信息和所述特异性核苷酸位点,识别错误比对,以鉴别得到所述待检测样本中所述目标基因的突变信息,包括:
4.根据权利要求1所述的基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述基因与假基因共存下的基因突变识别方法还包括:
5.根据权利要求4所述的基因与假基因共存下的基因突变识别方法,其特征在于,所述根据包括所述变异信息和所述特异性核苷酸位点,识别错误比对,以鉴别得到...
【专利技术属性】
技术研发人员:黄颐,孙贇,何亚琼,张婷,钮怡超,
申请(专利权)人:上海交通大学医学院附属仁济医院,
类型:发明
国别省市:
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