注释模型的训练方法、细胞类型注释方法以及相关设备技术

技术编号:43661736 阅读:20 留言:0更新日期:2024-12-13 12:52
本申请实施例提供了一种注释模型的训练方法、细胞类型注释方法以及相关设备,属于生物信息分析技术领域。该方法包括:将获取到的空间转录组数据和单细胞测序数据输入初始注释模型中;以空间转录组数据为约束条件,根据单细胞测序数据确定样本组织数据每一空间位点内的各目标单细胞相应的参考注释信息;基于参考注释信息和空间转录组数据,确定各目标单细胞相应的预测注释信息;根据参考注释信息和预测注释信息,对各目标单细胞进行联合注释处理,得到样本组织数据相应的样本注释结果;根据样本注释结果调整初始注释模型的模型参数,得到训练后的注释模型。本申请能够提高生物样本组织的细胞类型注释精确度。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及生物信息分析,尤其涉及一种注释模型的训练方法、细胞类型注释方法以及相关设备


技术介绍

1、细胞类型注释(cell type annotation)是对生物样本中不同的细胞类型进行识别和分类的过程,细胞类型注释有助于对细胞进行研究、促进生物技术的发展。

2、相关技术中,利用空间转录组信息得到生物样本组织各空间位点的细胞位置,并基于该空间位置以及单细胞测序数据确定生物样本组织相应的细胞类型注释。然而,受设备资源限制,所获取得到的获取空间转录组信息的分辨率通常不高;当生物样本组织中的细胞聚集形成高密度细胞聚集区域时,会出现同一空间位点有多个细胞的情况,在这种情况下,单细胞测序数据难以准确地与空间转录组信息进行映射,从而造成了相关技术中对生物样本组织的细胞类型注释精确度较低。


技术实现思路

1、本申请实施例的主要目的在于提出一种注释模型的训练方法、细胞类型注释方法以及相关设备,旨在提高生物样本组织的细胞类型注释精确度。

2、为实现上述目的,本申请实施例的第一方面提出了一种注释模型的本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种注释模型的训练方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述以所述空间转录组数据为约束条件,根据所述单细胞测序数据确定所述样本组织数据每一空间位点内的各目标单细胞相应的参考注释信息,包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述参考注释信息和所述空间转录组数据,确定各所述目标单细胞相应的多模态先验信息,包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述根据所述多模态先验信息确定所述目标单细胞相应的预测注释信息,包括:

5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述根据所述目标单细...

【技术特征摘要】

1.一种注释模型的训练方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述以所述空间转录组数据为约束条件,根据所述单细胞测序数据确定所述样本组织数据每一空间位点内的各目标单细胞相应的参考注释信息,包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述参考注释信息和所述空间转录组数据,确定各所述目标单细胞相应的多模态先验信息,包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述根据所述多模态先验信息确定所述目标单细胞相应的预测注释信息,包括:

5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述根据所述目标单细胞相应的参考注释信息、以及所述目标单细胞的邻居单细胞相应的参考注释信息,确定所述目标单细胞在对应所述空间位点的细胞空间分布特征,包括:

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述根据所述...

【专利技术属性】
技术研发人员:肖家顺万晓萌万翔杨灿
申请(专利权)人:深圳市大数据研究院
类型:发明
国别省市:

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