【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及蛋白质组学。更具体地，本专利技术涉及交联质谱法。
技术介绍
1、质谱分析(mass spectrometry，ms)已成为快速鉴定蛋白质一级结构的重要工具，很大程度地改变了生物和病理现象的研究。其中化学交联质谱法(cross-linking massspectrometry，xl-ms)是一个重要的应用，有助于解析蛋白质的三维结构，并揭示蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions，ppis)。鉴于了解蛋白质结构和蛋白质-蛋白质相互作用在复杂的细胞机制中所起到的作用，化学交联质谱法在此领域中已成为不可或缺的工具。
2、在化学交联质谱实验中，其中一个重要的成分是交联剂，一种会被添加到蛋白质溶液中的化学试剂。交联剂通常具有两个官能团，能够连接氨基酸的特定侧链以形成共价键，并在蛋白质内或彼此相互作用的蛋白质之间建立空间连接。交联剂分为不可裂解或可裂解两类。在串联质谱法(tandem mass spectrometry，ms2)中，不可裂解的交联剂在解离过程中会保持完整，而可裂解的交...
【技术保护点】
1.一种检测蛋白质-蛋白质相互作用和探测蛋白质结构的系统，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的系统，其中所述系统进一步包括局部对齐模块，当所述待分析的串联质谱图中没有可用的特征离子时可提供一系列的补偿配对。
3.根据权利要求1所述的系统，其中所述前体质量优化模块选取并校准的所述完整同位素簇具有理论同位素簇，并通过皮尔逊相关系数获得单一同位素质量，其中所述相关系数具有以下公式：
4.根据权利要求1所述的系统，使用以下公式进行评分：
5.根据权利要求1所述的系统，其中所述与可裂解或不可裂解交联剂交联的蛋白质进一步被过...
【技术特征摘要】
1.一种检测蛋白质-蛋白质相互作用和探测蛋白质结构的系统，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的系统，其中所述系统进一步包括局部对齐模块，当所述待分析的串联质谱图中没有可用的特征离子时可提供一系列的补偿配对。
3.根据权利要求1所述的系统，其中所述前体质量优化模块选取并校准的所述完整同位素簇具有理论同位素簇，并通过皮尔逊相关系数获得单一同位素质量，其中所述相关系数具有以下公式：
4.根据权利要求1所述的系统，使用以下公式进行评分：
5.根据权利要求1所述的系统，其中所述与可裂解或不可裂解交联剂交联的蛋白质进一步被过滤、富集和消化以产生交联肽。
6.根据权利要求1所述的系统，其中所述生物系统包括细胞、组织、血液、血清、痰液。
7.根据权利要求2所述的系统，其中所述前体质量优化模块具有设置为0.9的预设相关性截断值，以准确计算出所述完整同位素簇。
8.根据权利要求1所述的系统，其中所述反...
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