当前位置: 首页 > 专利查询>清华大学专利>正文

基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法技术

技术编号:43476195 阅读:18 留言:0更新日期:2024-11-29 16:51
本发明专利技术提供一种基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,包括:利用所构建的特征提取模块从免疫表位数据库中提取肽段和I型人类白细胞抗原蛋白特征;将所述肽段和I型人类白细胞抗原蛋白特征输入至经过预训练的抗原呈递预测模型,基于所述抗原呈递预测模型获得抗原呈递的概率;将所述肽段和I型人类白细胞抗原蛋白特征及抗原呈递概率信息输入至免疫原性预测模型实现抗原呈递和免疫原性特征的融合,基于所述免疫原性预测模型获得表示肽段激活T细胞概率的免疫原性得分,从而实现对免疫表位的预测。本发明专利技术提高了免疫表位的预测精度。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及人工智能、生物信息学、生物医药和肿瘤免疫学,尤其涉及一种基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法


技术介绍

1、掌握t细胞介导的免疫应答过程的规律对治疗包括癌症在内的疾病有着十分重要的意义。抗原的识别是整个免疫应答过程中的第一步,也是非常关键的一步。它主要依赖于细胞的抗原呈递功能。抗原呈递能够将细胞合成或者摄取的各种抗原信息展示在细胞表面,供t细胞识别。其中,基于主要组织相容性复合物(major histocompatibilitycomplex,mhc)分子的呈递途径最为重要。与抗原呈递相关的mhc蛋白可以分为mhc i类和mhc ii类。mhc i类分子表达于有核细胞中,主要提呈内源性的抗原片段,可以激活cd8+t细胞;而mhc ii类分子表达于抗原呈递细胞(antigen-presenting cell,apc,如树突细胞、巨噬细胞、b细胞)中,主要提呈外源性的抗原片段,可以激活cd4+t细胞。人体中的mhc i蛋白也称为i型人类白细胞抗原(class i human leukocyte antigen,hla-i)蛋白。...

【技术保护点】

1.一种基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,所述利用构建的特征提取模块从免疫表位数据库中提取肽段和I型人类白细胞抗原蛋白特征,具体包括:

3.根据权利要求1所述的基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,所述抗原呈递预测模型和免疫原性预测模型的训练需要用到洗脱配体数据和免疫原性数据的阳性样本和阴性样本数据;

4.根据权利要求1所述的基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,所述免疫原性预测模型分...

【技术特征摘要】

1.一种基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,所述利用构建的特征提取模块从免疫表位数据库中提取肽段和i型人类白细胞抗原蛋白特征,具体包括:

3.根据权利要求1所述的基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,所述抗原呈递预测模型和免疫原性预测模型的训练需要用到洗脱配体数据和免疫原性数据的阳性样本和阴性样本数据;

4.根据权利要求1所述的基于抗原呈递和免疫原性特征融合的免疫表位预测方法,其特征在于,所述免疫原性预测模型分为抗原呈递分支和免疫原性分支;

5.根据权利要求4所述的基于抗原呈递和免疫原性特征...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘民邓俊涛
申请(专利权)人:清华大学
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1