【技术实现步骤摘要】
本申请涉及电数据处理领域,具体而言,涉及一种大气气溶胶微生物群落组成的分析方法、装置及电子设备。
技术介绍
1、随着现代生物技术的飞速发展,微生物群落组成的分析在环境科学、生态学研究、医疗健康等多个领域扮演着日益重要的角色。大气气溶胶作为环境中的一个重要组成部分,其携带的微生物群落结构不仅反映了环境的质量状况,还与人类健康密切相关。因此,准确、高效地分析大气气溶胶中的微生物群落组成成为了当前科学研究的重要课题。传统的微生物群落分析方法通常依赖于实验室培养技术和基于pcr(聚合酶链式反应)的分子鉴定技术。然而,这些方法存在操作复杂、耗时长、成本高等缺点,且往往无法全面覆盖所有微生物种类,尤其是对于那些难以在实验室条件下培养的微生物种类。近年来,高通量测序技术的兴起为微生物群落分析提供了新的途径,通过直接对微生物的dna进行测序,能够获取大量序列数据,进而通过生物信息学方法解析微生物群落的组成。
2、高通量测序数据的分析同样面临着诸多挑战。首先,测序数据的海量性要求分析算法必须具备高效的数据处理能力。其次,由于测序过程中存在的噪
...【技术保护点】
1.一种大气气溶胶微生物群落组成的分析方法,其特征在于,包括算法确定阶段和数据分析阶段,其中:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述监督训练样例的微生物物种标记,对所述高通量测序序列模板中各个训练样例的整体隐式表征数组进行群集分析,获得所述非监督训练样例对应的微生物物种标记,包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述高通量测序序列关联图谱包括各个训练样例对应的样例顶点、以及样例顶点间的连接线,所述连接线表示连接的两个样例顶点之间的相关关系;所述根据所述高通量测序序列关联图谱,对所述监督训练样例的微生物物种标记进行标
...【技术特征摘要】
1.一种大气气溶胶微生物群落组成的分析方法,其特征在于,包括算法确定阶段和数据分析阶段,其中:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述监督训练样例的微生物物种标记,对所述高通量测序序列模板中各个训练样例的整体隐式表征数组进行群集分析,获得所述非监督训练样例对应的微生物物种标记,包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述高通量测序序列关联图谱包括各个训练样例对应的样例顶点、以及样例顶点间的连接线,所述连接线表示连接的两个样例顶点之间的相关关系;所述根据所述高通量测序序列关联图谱,对所述监督训练样例的微生物物种标记进行标记扩散,获得非监督训练样例对应的微生物物种标记,包括:
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对于所述训练样例的各dna信息序列,根据所述dna信息序列对应的序列隐式表征数组和所述dna信息序列属于的训练样例的整体隐式表征数组,确定所述dna信息序列和其属于的的训练样例之间的匹配度,包括:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述根据所述dna信息序列的待定标记库、以及所述dna信息序列属于的训练样...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈彬,
申请(专利权)人:中国科学院大气物理研究所,
类型:发明
国别省市:
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