一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用，属于基因检测技术领域。本发明专利技术包括序列数据的预处理、比对、注释和功能分析等步骤，通过对古代宏基因组片段进行高效、准确的数据处理和分析，能够揭示古代生物群体的遗传信息及其演化历史，为考古学、遗传学和环境科学等领域提供重要的数据支持和技术指导。本发明专利技术不仅能够克服传统方法的局限性，适应不同类型的古代样本，还能提供更全面的遗传信息，推动古代宏基因组研究的深入发展。通过新方法的开发和应用，研究人员将能够更准确地解析古代微生物群落的结构和功能。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因检测，具体地说，尤其涉及一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用。

技术介绍

1、古代宏基因组研究旨在通过对古代生物遗留物中的dna进行分析，以重建其基因组信息并揭示其遗传背景和演化历史。这些研究对于了解古代生物多样性、生态系统变化以及人类迁徙和文化交流等具有重要意义。然而，古代dna研究面临许多独特的挑战。古dna往往因环境影响而高度降解，且通常与现代dna相比存在较低的浓度。此外，古dna样本易受现代污染物的干扰，这进一步增加了分析难度。

2、传统的古代dna鉴定方法主要依赖于与现代基因组的比对。这些方法通过比对结果进行dna损伤评估和年代鉴定。然而，由于这些技术主要针对人类dna设计，因此在处理非人类样本，特别是微生物样本时，表现出明显的局限性。微生物群体具有高度的多样性和快速的进化速度，无法像人类基因组那样使用标准参考基因组进行比对。这使得传统方法在微生物古代dna研究中的应用受限，难以准确鉴定和分析古代微生物群体的组成和功能。

3、因此，开发一种高效、准确的数据处理与分析方法，对于古代宏基因组片本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.如权利要求1所述的古代宏基因组片段鉴定方法，其特征在于，所述步骤（1）中，使用浓度为3%的双氧水冲洗样品表面，去除现代DNA污染；使用MGIEasy PCRFree DNA文库制备试剂套装进行双端150bp建库测序。

3.如权利要求1所述的古代宏基因组片段鉴定方法，其特征在于，所述步骤（2）具体包括

4.如权利要求1所述的古代宏基因组片段鉴定方法，其特征在于，所述步骤（4）中，古代DNA评估软件为pmdtool或pydamage。

5.权利要求1所述的古代宏基因...

【技术特征摘要】

1.一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.如权利要求1所述的古代宏基因组片段鉴定方法，其特征在于，所述步骤（1）中，使用浓度为3%的双氧水冲洗样品表面，去除现代dna污染；使用mgieasy pcrfree dna文库制备试剂套装进行双端150bp建库测序。

【专利技术属性】
技术研发人员：汪岷，杨阳，何海峰，陶乐，王传超，
申请(专利权)人：中国海洋大学，
类型：发明
国别省市：

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