【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本申请涉及用于预测在一种基因编辑系统，即引导编辑系统中的脱靶的方法。
技术介绍
1、crispr/cas系统进行的基因组编辑是一个活跃的研究领域。尽管已经对修饰的指导rna等进行了各种研究，并且已经开发了用于基因操纵的cas蛋白，但通过crispr/cas系统进行的基因编辑方法仍然存在问题。由通过crispr/cas系统进行的基因操纵方法产生的许多问题促使人们开发更复杂的基因组编辑技术。这种动机导致了碱基编辑的发展，这是一种更复杂的基因组编辑技术。然而，碱基编辑的应用范围仍然有限。
2、david r.liu等人开发了引导编辑技术，这是一种“搜索和替换”基因组编辑技术，可用于诱导基因组的插入、缺失、全部12个碱基到碱基的转换及其组合。
3、尽管david r.liu等人开发了一种称为“引导编辑”的基因组编辑新平台，但尚未开发出用于预测在通过引导编辑进行基因组编辑时可能发生的脱靶的方法。由于引导编辑这一基因组编辑新平台的发展，需要开发更适合引导编辑系统的预测脱靶的新方法。
技术实现思路<
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【技术保护点】
1.一种用于预测在通过引导编辑系统进行基因组编辑过程中发生的脱靶的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中，预测脱靶的方法还包括：
3.根据权利要求1所述的方法，其中，预测脱靶的方法还包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其中，预测脱靶的方法还包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其中，所述标签序列插入到基因组DNA中由tpegRNA的间隔区指定的区域中。
6.根据权利要求1所述的方法，其中，插入所述标签序列的区域与脱靶候选物区域或在靶标区域相关(对应)。
7.根据权利要求1所述的方法，其...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于预测在通过引导编辑系统进行基因组编辑过程中发生的脱靶的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中，预测脱靶的方法还包括：
3.根据权利要求1所述的方法，其中，预测脱靶的方法还包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其中，预测脱靶的方法还包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其中，所述标签序列插入到基因组dna中由tpegrna的间隔区指定的区域中。
6.根据权利要求1所述的方法，其中，插入所述标签序列的区域与脱靶候选物区域或在靶标区域相关(对应)。
7.根据权利要求1所述的方法，其中，插入所述标签序列的区域的信息包括所述标签序列所定位的染色体的信息，以及所述标签序列在染色体中存在的区域的信息。
8.根据权利要求2所述的方法，其中，脱靶候选物区域的信息包括脱靶候选物所定位的染色体的信息，以及脱靶候选物在染色体中存在的区域的信息。
9.根据权利要求1所述的方法，其中，所述标签化信息还包括：
10.根据权利要求2所述的方法，其中，所述脱靶信息还包括：
11.根据权利要求2所述的方法，其中，所述脱靶信息还包括：
12.根据权利要求1所述的方法，其中，通过包括以下的方法获得操纵细胞：
13.根据权利要求1所述的方法，其中，通过包括以下的方法获得操纵细胞：
14.根据权利要求1所述的方法，其中，所述方法还包括：
15.根据权利要求1所述的方法，其中，所述tpegrna包括：
16.根据权利要求15所述的方法，其中，所述tpegrna的逆转录模板包括编辑模板和同源区域。
17.根据权利要求15所述的方法，其中，所述操纵基因组dna包括编辑。
18.根据权利要求1所述的方法，其中，间隔区、grna核心和延伸区域在5’到3’方向上按间隔区、grna核心和延伸区域的顺序定位。
19.根据权利要求1所述的方法，其中，所述标签模板位于延伸区域中的引物结合位点和逆转录模板之间。
20.根据权利要求1所述的方法，其中，所述tpegrna还包括含有rna保护基序的3’工程化区域。
21.根据权利要求1所述的方法，其中，所述方法还包括：
22.根据权利要求21所述的方法，其中，所述预定的细胞与用于预测脱靶的方法中使用的细胞不同。
23.根据权利要求21所述的方法，其中，所述tpegrna的间隔区的序列与预定的pegrna的间隔区的序列相同，
24.根据权利要求21所述的方法，其中，所述tpegrna的间隔区的序列与预定的pegrna的间隔区的序列相同，
25.根据权利要求21所述的方法，其中，用于预测脱靶的方法中使用的引导编辑蛋白与预定的引导编辑蛋白相同或不同。
26.根据权利要求1所述的...
【专利技术属性】
技术研发人员：李政埈，权正训，金珉荣，曺岸那，金永湖，
申请(专利权)人：株式会社图尔金，
类型：发明
国别省市：
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