【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子动力学模拟,尤其是涉及一种计算原子间相互作用的方法、装置、终端、存储介质及产品。
技术介绍
1、分子动力学仿真(molecular dynamics simulation,简称md)是一种利用计算机模拟分子体系在一定条件下的运动和演化的方法。分子动力学仿真可以用来研究分子的结构、性质、相变、反应、输运等现象,从而揭示物质的微观机理和宏观规律,分子动力学仿真是分子模拟的一种重要方法,也是计算物理、计算化学、计算生物、计算材料等领域的基本工具。
2、在分子动力学仿真的过程中通常涉及到分子内原子作用力的计算,分子动力学计算中,需要计算大量原子间的相互作用。例如原子间的范德华、静电作用。每次计算需要两两遍历体系中的所有原子对,当体系较大时,计算量便十分庞大。但目前在进行原子作用力的过程中通常采用的是串行计算过程,而当计算设备的资源比较大时,采用这种计算方式会显著降低设备的利用率,并且使得计算效率很低。
技术实现思路
1、有鉴于此,本专利技术旨在提出一种计算原子间相互作
...【技术保护点】
1.一种计算原子间相互作用的方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述将所述分子立方体模型划分为若干等大小的子立方体单元,包括:
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述为每一个计算球体分配一个计算模块,包括:
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述为每一个计算球体分配一个计算模块,包括:
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述分配立方体单元内部计算单元,包括:
7.根据权利要求2所述的
...【技术特征摘要】
1.一种计算原子间相互作用的方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述将所述分子立方体模型划分为若干等大小的子立方体单元,包括:
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述为每一个计算球体分配一个计算模块,包括:
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述为每一个计算球体分配一个计算模块,包括:
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述分配立方体单元内部计算单元,包括:
7.根据权利要...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘君佩,
申请(专利权)人:上海思朗科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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