一种用于金秋砂糖橘鉴定的InDel标记及应用制造技术

本发明专利技术涉及分子生物学技术领域，公开了用于金秋砂糖橘鉴定的InDel标记，所述InDel标记位于砂糖橘基因2号染色体上存在InDel缺失片段的位点。其中，所述InDel缺失片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明专利技术目的还在于提出了所述的InDel标记在金秋砂糖橘鉴定中的应用。本发明专利技术提供的分子标记特异性好、适用性广，筛选出的ST‑10引物对‘金秋’品种扩增后可分别特异性的获得441bp和607bp两条多态性条带，可从16个现有的砂糖橘主栽品种/品系中对金秋砂糖橘进行鉴定。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子生物学，尤其涉及一种用于金秋砂糖橘鉴定的indel标记及应用。

技术介绍

1、金秋砂糖橘的品种名为‘中柑所5号’，是中国农业科学院柑橘研究所采用爱媛30号杂柑(母本)与砂糖橘(父本)进行杂交所育出的杂交品种。金秋砂糖橘是其商品名，并被广大消费者所熟知。金秋砂糖橘以其早熟、高糖低酸、无核丰产、细嫩化渣和强适应性等优点脱颖而出。其果实成熟期较早，可溶性固形物含量高且耐储运，这些特性使其在市场上具有显著的竞争优势。然而，市场上时常有假冒金秋砂糖橘苗木的现象，目前缺少高效的金秋砂糖橘品种特异分子标记鉴定技术，无法高效的与其他砂糖橘品种/品系进行鉴别，从而给柑橘产业发展带来了极大风险。

2、indel(insertion/deletion)标记是基于全基因组重测序的分子标记。已在柑橘、苹果、玉米等全种类园艺作物品种鉴定上得到了广泛的应用。indel分子标记技术是一种基于插入/缺失多态性的分子标记方法，在基因组研究和育种中具有广泛的应用。其优点如下：通过检测基因组中的插入和缺失变异，可以揭示丰富的遗传多样性，适用于不同物种和个体的基因组分本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.用于金秋砂糖橘鉴定的InDel标记，其特征在于，所述InDel标记位于砂糖橘基因2号染色体上存在缺失片段的InDel位点。

2.如权利要求1所述的InDel标记，其特征在于，所述缺失片段的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。

3.如权利要求1-2任一项所述的InDel标记在金秋砂糖橘鉴定中的应用。

4.一种用于检测权利要求1-2任一项InDel标记的引物对，其特征在于，上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，下游引物的的核苷酸序列如SEQ ID NO.3。

5.如权利要求4所述的引物对在金秋砂糖橘鉴定中的应用。

...

【技术特征摘要】

1.用于金秋砂糖橘鉴定的indel标记，其特征在于，所述indel标记位于砂糖橘基因2号染色体上存在缺失片段的indel位点。

2.如权利要求1所述的indel标记，其特征在于，所述缺失片段的核苷酸序列如seq idno.1所示。

3.如权利要求1-2任一项所述的indel标记在金秋砂糖橘鉴定中的应用。

4.一种用于检测权利要求1-2任一项indel标记的引物对，其特征在于，上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示，下游引物的的核苷酸序列...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴巨勋，程瀚远，伊华林，何超，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：