一种接头组合物和小RNA文库及其构建方法技术

技术编号:43359135 阅读:18 留言:0更新日期:2024-11-19 17:44
本发明专利技术公开了一种接头组合物和小RNA文库及其构建方法,涉及生物测序领域,该接头组合物包括3’接头和5’接头,3’接头和5’接头分别具有回文结构,末端均具有凸出的随机碱基,5’接头采用DNA和RNA的复合设计,这种全新的结构使得3’接头和5’接头与目的核酸能够实现同时连接,有效缩短文库构建的反应时间,仅需要30min即可完成文库连接反应,降低RNA降解的风险;此外,这种接头结构能够有效的避免接头自连接,可提高构建文库的纯度,将其应用于小RNA文库的构建,可基于超微量样本获得高纯度和高产量的小RNA文库。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物测序领域,具体而言,涉及一种接头组合物和小rna文库及其构建方法。


技术介绍

1、小rna是生物体内的一大类调控分子,包括micro rna、sirna、pirna、snrna、snorna和rsrna等,它们在生物体内发挥着重要的调控作用。近些年已有一些研究成功地将小rna的谱系作为特定疾病诊断的标志物。未来小rna的检测将会在疾病的早期诊断,分型和个体化检测治疗中得到广泛地应用。常用的小rna定量检测技术包括深度测序技术、芯片技术和qrt-pcr技术。后两者需要合成特异性探针,因此只能检测已知种类的小rna。高通量测序技术因其具有通量高、灵敏度高、无需任何预先的序列信息以及二级结构信息、可以发现新的小rna分子等优点,在小rna研究领域得到广泛应用。对于小rna深度测序的文库构建方法主要是两步接头连接反转录法。该方法适用于包括打断的长转录本rna在内的任何适合连接反应的rna深度测序文库的构建,例如,小rna测序、clip测序、rip测序、gro测序等。

2、现有小rna或rna片段的文库构建的步骤,首先需要在小rna 3本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种接头组合物,其特征在于,其包括:3’接头和5’接头;

2.根据权利要求1所述的接头组合物,其特征在于,所述第一随机序列位于所述5’接头序列的5’端;

3.根据权利要求1所述的接头组合物,其特征在于,所述RNA碱基部分的长度为2~6nt。

4.根据权利要求1所述的接头组合物,其特征在于,所述第一序列的长度为3~20nt;

5.一种试剂盒,其特征在于,其包括:权利要求1~4任一项所述的接头组合物。

6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:RNA双链连接酶;

7.一种小RNA文库构建方法,其特...

【技术特征摘要】

1.一种接头组合物,其特征在于,其包括:3’接头和5’接头;

2.根据权利要求1所述的接头组合物,其特征在于,所述第一随机序列位于所述5’接头序列的5’端;

3.根据权利要求1所述的接头组合物,其特征在于,所述rna碱基部分的长度为2~6nt。

4.根据权利要求1所述的接头组合物,其特征在于,所述第一序列的长度为3~20nt;

5.一种试剂盒,其特征在于,其包括:权利要求1~4任一项所述的接头组合物。

6...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘军章琼璐朱志虹
申请(专利权)人:新生命基因科技杭州有限公司
类型:发明
国别省市:

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