一种固相核酸合成方法技术

技术编号:43356756 阅读:23 留言:0更新日期:2024-11-19 17:42
本发明专利技术涉及核酸合成技术领域,本发明专利技术提供的一种固相核酸合成方法,采用固相亚磷酰胺法合成,包括合成反应循环步骤,每个合成反应循环包括去保护、偶联反应、加帽反应和氧化反应;所述偶联反应中,加入的核苷酸单体溶液终浓度为0.005‑0.025mol/L;本发明专利技术研究发现,通过控制加入的核苷酸单体浓度,在保证核酸合成质量的同时,有效降低DNA合成方法中核苷酸单体使用量,极大的降低了核酸合成成本。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及核酸合成,具体涉及一种固相核酸合成方法


技术介绍

1、目前,核酸高通量合成设备主要来源于进口,合成方案、合成试剂用量固定、单一,合成碱基成本较高,尤其是修饰探针、荧光标记核酸、rna及特殊结构的单体。核酸合成方法为固相亚磷酰胺法,其主要合成工艺为,一个合成循环(指的是一个碱基的延长)包括四个步骤,第一步是去保护,即用苯磺酸或三氯醋酸处理带有保护基的核苷,去除5'末端的二甲氧基三苯甲基(dmtr),暴露出5'oh。第二步是偶联反应,加入经四唑激活的核苷,使其与前一个核苷的5'oh耦联。第三步是加帽反应,加入醋酐和二甲基氨基吡啶,使未参加反应的寡核苷酸链乙酰化,这样有利于纯化所需的全长dna片段。第四步是氧化反应,加入碘液等氧化试剂,使亚磷酸三酯转变为更稳定的磷酸三酯。完成一个合成循环后,载体上的每一个核苷酸链都会增长一个碱基,且始终被固定在固相载体上。过量的未反应物或分解物通过过滤或洗涤除去。当整个链达到预定长度后,从固相载体上切下并脱去保护基(氨解),之后经过分离纯化得到所需的最终产物。上述柱法固相合成中,单体浓度默认为0.06-0.1m、本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种固相核酸合成方法,其特征在于,采用固相亚磷酰胺法合成,包括合成反应循环步骤,每个合成反应循环包括去保护、偶联反应、加帽反应和氧化反应;

2.根据权利要求1所述的固相核酸合成方法,其特征在于,所述偶联反应中,在加入核苷酸单体溶液的同时,还加入活化剂;所述活化剂为含ETT的浓度是0.25~0.6mol/L,BTT浓度是0.25~0.6mol/L,质量百分比0.1-1%氮甲基咪唑的溶液;

3.根据权利要求1或2所述的固相核酸合成方法,其特征在于,所述偶联反应的反应条件为:反应时间30s~2min,优选的40s。

4.根据权利要求1-3任一项所述的固相...

【技术特征摘要】

1.一种固相核酸合成方法,其特征在于,采用固相亚磷酰胺法合成,包括合成反应循环步骤,每个合成反应循环包括去保护、偶联反应、加帽反应和氧化反应;

2.根据权利要求1所述的固相核酸合成方法,其特征在于,所述偶联反应中,在加入核苷酸单体溶液的同时,还加入活化剂;所述活化剂为含ett的浓度是0.25~0.6mol/l,btt浓度是0.25~0.6mol/l,质量百分比0.1-1%氮甲基咪唑的溶液;

3.根据权利要求1或2所述的固相核酸合成方法,其特征在于,所述偶联反应的反应条件为:反应时间30s~2min,优选的40s。

4.根据权利要求1-3任一项所述的固相核酸合成方法,其特征在于,所述去保护步骤中,加入质量体积比为2.5-3.5%的dmt脱保护溶液3-8cv,反应20s-1min,重复该步骤1次;

5.根据权利要求1-4任一项所述的固相核酸合成方法,其特征在于,所述加帽反应中,加入capa溶液0.5-2cv和capb溶液0.5-2cv,反应10s-1min;所述capa溶液为含1-20v/v%醋酐的四氢呋喃溶液;所述capb溶液为四氢呋喃、吡啶和氮甲基咪唑按照体积比例64-84:1-20:6-26混合的溶液;

6.根据权利要求1-5任一项所述的固相核酸合成方法,其特征在于,所述氧化反应中,加入碘液1.5-4cv,反应10s-1min;所述碘液中碘的浓度为0.02-0.1mol/l,溶剂为吡啶、水和四氢呋喃按照体积比例15-25:5-15:65-75混合的溶液;

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【专利技术属性】
技术研发人员:陈园园崔树琴杜军赵春德王冰千
申请(专利权)人:北京擎科生物科技股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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