【技术实现步骤摘要】
本申请涉及生物信息学领域,具体涉及一种sanger测序引物组和试剂盒,更具体涉及一种omicron分型的sanger测序引物组合和检测试剂盒,本申请还提供一种omicron毒株分型的方法。
技术介绍
1、新型冠状病毒(sars-cov-2)是冠状病毒科的一种单链rna病毒,病毒的基因组全长约30kb,由编码多种非结构、结构和辅蛋白的基因组成。由于新冠病毒是为rna病毒,其在复制的过程中相较与dna更容易发生突变,以奥密克戎(omicron)为例,其包括的亚型超过了700种,这种突变就可能导致蛋白质的功能及其病毒传播和发病的机制发生改变,进而在临床的表型和治疗及其预后上有较大的差异,因此如何高效快速进行分型对临床和科学研究具有重大意义。
2、目前,市面上已经有大量的专门针对新冠病毒设计的试剂盒,利用这些试剂盒结合二代测序同样可以得到高质量的新冠分型结果。然而这种方法需要专门进行实验提取、建库、测序、分析等步骤,耗费了较多的人力物力。
3、二代测序的mngs技术,检测成本高,且需要每个菌种检测reads度达到3000
...【技术保护点】
1.一种引物组合,其特征在于,由Seq ID No:1-14所表示的引物组成。
2.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,所述引物组合中,Seq ID No:1-14所表示的每种引物具有相同的物质的量占比。
3.一种试剂盒,其特征在于,具有根据权利要求1或2所述的引物组合。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述引物形成三组引物组合物,
5.根据权利要求3或4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还具有液化试剂、提取试剂、逆转录试剂、扩增试剂和sanger测序试剂。
6.一种Omicron毒株分型
...【技术特征摘要】
1.一种引物组合,其特征在于,由seq id no:1-14所表示的引物组成。
2.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,所述引物组合中,seq id no:1-14所表示的每种引物具有相同的物质的量占比。
3.一种试剂盒,其特征在于,具有根据权利要求1或2所述的引物组合。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述引物形成三组引物组合物,
5.根据权利要求3或4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还具有液化试剂、提取试剂、逆转录试剂、扩增试剂和sanger测序试剂。
6.一种omicron毒株分型的方法,其特征在于,使用权利要求1或2所述的引物组合,或权利要求3-5中任一项所述的试剂盒对单链cdna模板进行pcr扩增和sanger测序,将测序结果与omicron毒株的序列进行比对,确定cdna模板对应的omicron毒株的分型。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述omicron毒株选自:ba...
【专利技术属性】
技术研发人员:丘祝君,金瑛,张紫阳,王勇斯,温韵洁,全智慧,裘宇容,张少华,
申请(专利权)人:广州华银医学检验中心有限公司,
类型:发明
国别省市:
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