基于宏基因组测序进行病毒分型的系统和计算机程序产品技术方案

本申请提供了一种基于宏基因组测序进行COVID‑19病毒分型的系统，包括：存储器，所述存储器存储可执行指令；以及一个或多个处理器，所述一个或多个处理器与所述存储器通信以执行可执行指令从而利用病毒宏基因组测序数据进行COVID‑19病毒分型。本申请还提供了能够实现以上功能的计算机程序产品。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及生物信息处理领域，具体地，涉及一种基于宏基因组测序进行covid-19病毒分型的系统，以及基于宏基因组测序进行covid-19病毒分型的计算机程序产品。

技术介绍

1、covid-19(coronavirus disease 2019，sars-cov-2)是冠状病毒科的一种单链rna病毒，病毒的基因组全长约30kb，由编码多种非结构、结构和辅蛋白的基因组成。由于covid-19病毒是为rna病毒，其在复制的过程中相较于dna更容易发生突变，这种突变就可能导致蛋白质的功能及其病毒传播和发病的机制发生改变，进而在临床的表型和治疗及其预后上有较大的差异，因此如何高效快速进行分型对临床和科学研究具有重大意义。

2、目前常见的covid-19病毒的变体进行命名方法有gisaid命名法、nextstrain命名法和pangolin命名法。其中pangolin命名法是依据gisaid数据库中不断更新的covid-19病毒基因组序列，利用最大似然法构建的covid-19病毒系统发育树，是目前最精细的分型方法，本申请采用本法对分型的病毒进行命名。co本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于宏基因组测序进行COVID-19分型的系统，其特征在于，包括：存储器，所述存储器存储可执行指令；以及一个或多个处理器，所述一个或多个处理器与所述存储器通信以执行可执行指令从而完成以下操作：

2.根据权利要求1所述的系统，其特征在于：

3.根据权利要求1所述的系统，其特征在于：

4.根据权利要求1所述的系统，其特征在于：

5.根据权利要求1所述的系统，其特征在于：

6.一种计算机程序产品，包括计算机可读指令，所述计算机可读指令被处理器执行时实现以下操作：

7.根据权利要求6所述的计算机程序产品，其特征在于：...

【技术特征摘要】

1.一种基于宏基因组测序进行covid-19分型的系统，其特征在于，包括：存储器，所述存储器存储可执行指令；以及一个或多个处理器，所述一个或多个处理器与所述存储器通信以执行可执行指令从而完成以下操作：

2.根据权利要求1所述的系统，其特征在于：

3.根据权利要求1所述的系统，其特征在于：

4.根据权利要求1所述的系统，其特征在于：

5.根据权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员：张紫阳，范文涛，王勇斯，姚泽彬，温韵洁，全智慧，裘宇容，王燎原，
申请(专利权)人：广州华银医学检验中心有限公司，
类型：发明
国别省市：