一种用于检测非小细胞肺癌MRD的探针组及其应用制造技术

本公开提供了一种用于检测非小细胞肺癌MRD的探针组及其应用，应用本公开所提供的筛选方法得到的探针组，纳入了非小细胞肺癌高证据等级的用药突变以及高频突变，能够用于非小细胞肺癌MRD监测。本公开所述的探针组能够起到监测肿瘤进化和新发耐药突变的作用，能够在一定程度上克服肿瘤的时空异质性，同时还可提高捕获效率，稳定实验体系，能够满足临床检测要求。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于核酸测序领域，具体地，本公开涉及一种用于检测非小细胞肺癌mrd的探针组及其应用。

技术介绍

1、微小残留病灶(minimal residue disease，mrd)是指肿瘤患者接受根治性治疗后疾病达到影像学完全缓解，但体内仍存在影像学方法无法检出的残留肿瘤细胞或者微小病灶，属于肿瘤进展的隐匿阶段。残留的肿瘤细胞数量可能很少，暂时不会引起任何的体征或症状，但可能导致未来肿瘤的进展或复发转移。循环肿瘤dna(ctdna)测序可以发现这种分子异常，用于预后评估、复发监测、疗效评价和辅助治疗决策，可以为临床治疗决策提供重要参考。

2、基于ctdna检测的mrd状态与非小细胞肺癌的复发风险密切相关。对于接受根治性手术的早期肺癌患者，ctdna阳性可比传统影像学提前预测复发。mrd阳性的非小细胞肺癌患者复发风险更高，并且mrd阳性的患者可从辅助治疗中获益。近年来，一些国内外的癌症诊疗指南和专家共识也逐步将ctdna作为预后的生物标志物。我国《非小细胞肺癌分子残留病灶专家共识》推荐“早期非小细胞肺癌患者根治性切除术后，mrd阳性提示复发风险高本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于检测非小细胞肺癌微小残留病灶的基因标志物，其特征在于，所述标志物包括以下基因中的任意一个或多个：EGFR、KRAS、ERBB2、BRAF、MET、ALK、TP53、PIK3CA、CTNNB1、SMAD4、CDKN2A或NFE2L2。

2.根据权利要求1所述基因标志物，其特征在于，所述基因标志物至少覆盖以下区域中的任意一个或多个：EGFR的外显子18、19、20、21；KRAS的外显子2、3、4；ERBB2的外显子20；BRAF的外显子11、15；MET的内含子13、外显子14；ALK的外显子23；TP53的外显子4-10；PIK3CA的外显子10、21；CTNNB...

【技术特征摘要】

1.一种用于检测非小细胞肺癌微小残留病灶的基因标志物，其特征在于，所述标志物包括以下基因中的任意一个或多个：egfr、kras、erbb2、braf、met、alk、tp53、pik3ca、ctnnb1、smad4、cdkn2a或nfe2l2。

2.根据权利要求1所述基因标志物，其特征在于，所述基因标志物至少覆盖以下区域中的任意一个或多个：egfr的外显子18、19、20、21；kras的外显子2、3、4；erbb2的外显子20；braf的外显子11、15；met的内含子13、外显子14；alk的外显子23；tp53的外显子4-10；pik3ca的外显子10、21；ctnnb1的外显子3；smad4的外显子9；cdkn2a的外显子1、2和nfe2l2的外显子2。

3.一种用于检测非小细胞肺癌微小残留病灶的探针组，其特征在于，所述探针组用于检测权利要求1或2所述的基因标志物。

4.根据权利要求3所述的探针组，其特征在于，所述探针组具有如seq id no:1～57任一项或多项所示的核苷酸序列，或与其具有至少85％序列...

【专利技术属性】
技术研发人员：何建行，刘利平，梁文华，梁恒瑞，曹务强，杜新华，易鑫，
申请(专利权)人：广州医科大学附属第一医院广州呼吸中心，
类型：发明
国别省市：