【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、数据可视化是基因组数据分析的基本组成部分。下一代测序(ngs)和基于阵列的表达分析方法产生大量不同类型的基因组数据，并且使得研究人员能够以前所未有的分辨率来研究基因组。尽管许多分析可以自动化，但是快速且直观的可视化所支持的人类解释和判断对于获得洞察力和阐明复杂的生物学关系是必要的。基因组浏览器是显示测序数据的应用程序(例如，浏览器应用程序)。基因组浏览器可以是用于显示测序数据的基于网络的浏览器。基因组浏览器显示来自多个样品的比对、变体和/或其他类型的基因组注释，以用于执行复杂的变体分析。尽管基因组浏览器通常用于查看来自公共源的基因组数据，但是基因组浏览器也可支持希望可视化和探索他们自己的数据集或来自同事的数据集的研究者。为此，基因组浏览器支持本地和远程数据集的灵活加载，并且被优化以在标准桌面系统上提供高性能数据可视化和探索。
2、当在全基因组视图或甚至基因组的相对大的部分下时，从整个基因组文件提取数据产生基因组浏览器所不支持的大量数据。这可能导致当用户选择要显示的一定量的信息时，基因组浏览器无法显示存储在基因...
【技术保护点】
1.一种方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述聚合文件包括标头，所述标头指示名称长度、基因组名称、参考长度或比例因子中的一者或多者。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述比例因子指示接近深度的多少个分组被包括在所述多个分组中的相应一个分组内。
4.根据权利要求2所述的方法，其中所述比例因子指示较低深度的多少个分组被组合到所述多个分组中的在下一较高深度处的相应一个分组中。
5.根据权利要求2所述的方法，其中所述比例因子指示所述第二组分组中的多少个分组被包括在所述第三组分组内，以及所述第一组分组中的多...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述聚合文件包括标头，所述标头指示名称长度、基因组名称、参考长度或比例因子中的一者或多者。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述比例因子指示接近深度的多少个分组被包括在所述多个分组中的相应一个分组内。
4.根据权利要求2所述的方法，其中所述比例因子指示较低深度的多少个分组被组合到所述多个分组中的在下一较高深度处的相应一个分组中。
5.根据权利要求2所述的方法，其中所述比例因子指示所述第二组分组中的多少个分组被包括在所述第三组分组内，以及所述第一组分组中的多少个分组被包括在所述第二组分组内。
6.根据权利要求2所述的方法，其中所述名称长度和所述基因组名称标识所述基因组。
7.根据权利要求2所述的方法，所述方法还包括：基于所述参考长度和所述比例因子来确定所述聚合文件的最小深度和最大深度。
8.根据权利要求1所述的方法，其中所述概要数据包括平均质量、平均深度或一个或多个核苷酸比例中的一者或多者。
9.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括：标识所述聚合文件中的与由所述用户选择的所述基因组区域对应的位置。
10.根据权利要求8所述的方法，其中所述聚合文件中的所述位置包括所述多个分组中的在所述多个深度中的特定深度处的特定分组。
11.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个分组中的每个分组占用相等大小的存储器空间。
12.根据权利要求1所述的方法，其中特定深度处的所述分组中的每个分组包括所述基因组的相等部分的概要数据。
13.根据权利要求1所述的方法，其中与所述多个分组中的两个分组重叠的读段基于所述读段与所述两个分组中的每个分组重叠多少而被指派给所述两个分组中的一个分组。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所显示的概要数据的部分对应于所述多个深度中的深度，所述方法还包括：基于由所述用户选择的所述基因组区域来确定所显示的概要数据的部分的所述深度。
15.根据权利要求14所述的方法，所述方法还包括：标识所确定的深度处的与由所述用户选择的所述基因组区域重叠的一个或多个分组。
16.根据权利要求1所述的方法，其中所述一个或多个显示条件包括颜色、不透明度或高度中的一者或多者。
17.根据权利要求1所述的方法，其中所述基因组数据是在比对映射文件中接收的。
<...【专利技术属性】
技术研发人员：A·沃伦，B·里维尔特，M·阿森诺特，
申请(专利权)人：因美纳有限公司，
类型：发明
国别省市：
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