滚环扩增的方法以及DNA纳米球的制备方法技术

技术编号:43281133 阅读:71 留言:0更新日期:2024-11-12 16:04
本申请涉及滚环扩增方法以及DNA纳米球的制备方法。该滚环扩增方法在恒温条件下进行的,包括如下步骤:将双链DNA与变性剂混合后进行变性,制备变性体系,其中双链DNA中至少一条链的5’端被磷酸化;DNA双链变性后,在变性体系中同时引入包括成环片段、连接酶和聚合酶的试剂,制备反应体系;在反应体系中,变性后的单链DNA两端与成环序列同时进行配对,连接酶使所述单链DNA两端连接,形成单链DNA环,聚合酶以成环片段为引物、以单链DNA环为模板进行滚环扩增。

【技术实现步骤摘要】

本申请属于高通量测序,具体涉及一种滚环扩增的方法以及dna纳米球的制备方法。


技术介绍

1、滚环扩增(rca)是一种在二代测序及原位测序等领域常见的文库扩增方法。通过环状dna为起始模板,在具有链置换功能的聚合酶的作用下,在等温环境中进行扩增。其产物是一根线性的,多个与环状dna序列反向互补的序列的连续。其产物的形态可以通过环状dna上的固定序列进行一定程度的调控。相对pcr而言,滚环扩增的扩增倍数较少,但是不需要频繁的变温,同时可以避免pcr带来的错误累积。因此在特定情况下,比pcr更有优势。

2、滚环扩增相对于其他扩增而言,最重要的是环状dna的制作。这一步骤极为繁琐。以常规pcr产生的双链dna为例,首先需要对其单链化,即选择一条链进行消化,同时对剩余单链的5’端要进行磷酸化。在获得单链状态,5’磷酸化后的dna单链模板后,要通过能与该dna单链首尾同时杂交的成环引物,将dna单链模板的3’端引导至5’端,且处于3’端碱基3’羟基与5’端碱基的5’磷酸基团处于相邻位置。之后在dna连接酶的作用下,将dna单链模板的3’端与5’端相连,形成本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.滚环扩增的方法,其特征在于,所述方法在恒温条件下进行的,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,引入的包括所述成环片段、所述连接酶和所述聚合酶的试剂总体积是所述变性体系体积的1-1000倍;

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述变性剂包括强碱和甲酰胺中的一种或多种;

4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,变性的时间不超过5min。

5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述恒温条件为40℃-80℃;

6.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述连接酶是耐热型的连接酶,所述...

【技术特征摘要】

1.滚环扩增的方法,其特征在于,所述方法在恒温条件下进行的,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,引入的包括所述成环片段、所述连接酶和所述聚合酶的试剂总体积是所述变性体系体积的1-1000倍;

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述变性剂包括强碱和甲酰胺中的一种或多种;

4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,变性的时间不超过5min。

5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述恒温条件为40℃-80℃;

6.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述连接酶是耐热型的连接酶,所述聚合酶是耐热型的聚合酶,所述连接酶和所述聚合酶适合的反应温度在20℃-100℃范围内。

7.根据权利要求1或2所述的方法...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈曦谢槟陈星羽肖育劲
申请(专利权)人:深圳市大道测序生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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