一种DNA-RNA共捕获杂交文库构建方法及试剂盒技术

本申请属于基因检测技术领域，涉及一种DNA‑RNA共捕获杂交文库构建方法及试剂盒，包括对阳性突变实验样本和阴性突变对照样本分别进行DNA和RNA共提取得到第一DNA、第一RNA、第二DNA和第二RNA，并构建对应的第一DNA文库、第一RNA文库、第二DNA文库以及第二RNA文库；将第一DNA文库、第二DNA文库、第一RNA文库和第二RNA文库进行混合，得到DNA‑RNA混合文库；使用融合基因捕获探针杂交捕获DNA‑RNA混合文库中的目标DNA和RNA，得到杂交产物；对杂交产物进行洗脱处理，得到DNA‑RNA洗脱文库；对DNA‑RNA洗脱文库中的所述目标DNA和RNA进行扩增、纯化，获得DNA‑RNA共捕获杂交文库。本申请提高了探针捕获效率，降低了杂交成本，更能通过调整DNA和RNA的杂交比例来减少测序数据量成本，可以稳定高效检出融合突变基因。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及基因检测，尤其涉及一种dna-rna共捕获杂交文库构建方法及试剂盒。

技术介绍

1、基因融合是由染色体的易位、插入、颠倒、缺失等重排导致的。基因融合引发癌症的机制主要有两种：一部分发生在肿瘤驱动基因上的基因融合使这些基因拥有强的启动子或增强子，或激活转录因子，使其异常表达；另一部分融合基因会产生有生物学作用(如激酶活性等)的嵌合体蛋白，使生物体紊乱。可用药的激酶融合在检测的单个癌症类型中检测到的频率为1％-9％，包括alk(anaplastic lymphoma kinase，间变性淋巴瘤激酶)、ros1、ret、ntrks和fgfr等。目前针对融合基因的肿瘤靶向药物已有多种，如针对alk、ros1基因融合的克唑替尼，以及针对ntrks基因融合的larotrectinib等。目前，融合基因的检测手段有高通量测序(next generation sequencing，ngs)、实时荧光定量pcr(rt-pcr)、荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization，fish)以及免疫组化(immunohistochem本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种DNA-RNA共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，包括下述步骤：

2.根据权利要求1所述的DNA-RNA共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，所述第一DNA文库或所述第二DNA文库通过以下步骤构建：

3.根据权利要求1所述的DNA-RNA共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，所述第一RNA文库或所述第二RNA文库通过以下步骤构建：

4.根据权利要求1所述的DNA-RNA共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，所述将所述第一DNA文库、所述第二DNA文库、所述第一RNA文库和所述第二RNA文库，按照预设比例进行文库混合，得到DNA-RNA混合文库的步骤包...

【技术特征摘要】

1.一种dna-rna共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，包括下述步骤：

2.根据权利要求1所述的dna-rna共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，所述第一dna文库或所述第二dna文库通过以下步骤构建：

3.根据权利要求1所述的dna-rna共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，所述第一rna文库或所述第二rna文库通过以下步骤构建：

4.根据权利要求1所述的dna-rna共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，所述将所述第一dna文库、所述第二dna文库、所述第一rna文库和所述第二rna文库，按照预设比例进行文库混合，得到dna-rna混合文库的步骤包括：

5.根据权利要求1所述的dna-rna共捕获杂交文库构建方法，其特征在于，所述使用融合基因捕获探针杂交捕获所述dna-rna混合文库中的目标dna和rna，得到杂交产物的步骤包括...

【专利技术属性】
技术研发人员：蒋析文，陈家慧，郑春婷，方鹏，周南，陈思远，
申请(专利权)人：广州达安基因股份有限公司，
类型：发明
国别省市：