一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具制造技术

本发明专利技术涉及一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具,包括数据预处理单元解析用户上传的Exce l文件，确定质粒文件名及目标基因和抗性基因的序列和位置；单点突变引物设计单元使用Pr imer3软件生成PCR引物和突变质粒文件；双点突变引物设计单元根据突变间距处理三种双点突变引物设计情况；测序验证引物设计单元生成测序所需引物；重组质粒图谱单元通过Bio工具包重组成新的质粒文件；数据检测收集单元检测并收集引物设计和质粒改造数据生成检测报告。有益效果：通过使用Pr imer3软件及BioPython工具包，自动解析用户序列数据设计PCR引物，并生成包含引物的突变质粒文件以及自动重组新的质粒文件。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因工程，具体地说，涉及一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具。

技术介绍

1、一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具是一个集成化的生物信息学平台，旨在简化和自动化质粒点突变引物设计过程，使用自动化数据处理和引物设计软件，能够实现高效、准确的引物设计和质粒改造。

2、现有的面向质粒点突变改造的引物设计工具只能进行单一的引物设计任务，且由于需要用户手动处理步骤繁多和引物设计的数据冗余复杂，会导致设计效率低下和错误率高的问题，因此，设计一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具。

技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，以解决上述
技术介绍
中提出的由于需要用户手动处理步骤繁多和引物设计的数据冗余复杂，会导致设计效率低下和错误率高的问题。

2、为实现上述目的，本专利技术目的在于提供了一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，包括：

3、数据预处理单元，所述数据预处理单元读取并解析用户上传的ex本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：包括：

2.根据权利要求1所述的面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：所述数据预处理单元(1)包括数据解析校验模块、序列提取模块和数据校验规范模块；

3.根据权利要求1所述的面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：所述单点突变引物设计单元(2)包括设计类型确定模块、突变内容检查模块和单点突变引物设计模块；

4.根据权利要求3所述的面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：所述单点突变引物设计模块通过结合Python的开源软件包Primer3与...

【技术特征摘要】

1.一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：包括：

2.根据权利要求1所述的面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：所述数据预处理单元(1)包括数据解析校验模块、序列提取模块和数据校验规范模块；

3.根据权利要求1所述的面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：所述单点突变引物设计单元(2)包括设计类型确定模块、突变内容检查模块和单点突变引物设计模块；

4.根据权利要求3所述的面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：所述单点突变引物设计模块通过结合python的开源软件包primer3与自动化数据预处理技术，根据用户输入的模板序列和设计参数，生成包含突变位点的上游和下游引物模板序列，并通过primer3软件包设计出上游和下游引物，利用bio工具包生成包含引物的突变质粒文件，其单点突变引物设计模块生成包含引物的突变质粒文件所涉及的具体步骤如下：

5.根据权利要求1所述的面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：所述双点突变引物设计单元(3)包括双点突变设计类型模块、第一种双点突变引物设计模块、第二种双点突变引物设计模块...

【专利技术属性】
技术研发人员：王猛，张悦，程海娇，毛雨丰，杨毅，杨春贺，许涛，赵募强，廖小平，马红武，
申请(专利权)人：中国科学院天津工业生物技术研究所，
类型：发明
国别省市：