使用纳米孔表征多肽的方法技术

技术编号:42872313 阅读:31 留言:0更新日期:2024-09-27 17:32
本文提供了在靶多肽相对于纳米孔移动时表征所述靶多肽的方法。还提供了用于进行此类方法的相关试剂盒、系统和设备。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本公开涉及通过形成靶多肽与多核苷酸的缀合物并使用多核苷酸处理蛋白来控制缀合物相对于纳米孔的移动来表征靶多肽的方法。本公开还涉及用于执行此类方法的试剂盒、系统和设备。


技术介绍

1、生物分子的表征在生物医学和生物技术应用中越来越重要。例如,核酸的测序允许研究基因组及其编码的蛋白质,并且例如允许核酸突变与可观察现象(诸如疾病适应症)之间的相关性。核酸测序可以用于进化生物学来研究生物体之间的关系。宏基因组学涉及鉴定样品中存在的生物体,例如微生物组中的微生物,其中核酸测序允许鉴定此类生物体。虽然表征多核苷酸(例如,对多核苷酸进行测序)的技术已得到广泛开发,但表征多肽的技术还不太先进,尽管具有非常重要的生物技术重要性。例如,了解蛋白质序列可以允许建立构效关系,并且对用于开发特异性受体的配体的合理药物开发策略具有影响。翻译后修饰的鉴定也是了解许多蛋白质的功能特性的关键。例如,在真核生物中,通常有30%至50%的蛋白质物种被磷酸化。一些蛋白质可能具有多个磷酸化位点,从而用来激活或灭活蛋白质、促进其降解或者调节与蛋白质配偶体的相互作用。因此,迫切需要表征蛋白质和其他多肽的本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种表征具有第一端和第二端的靶多肽的方法;

2.一种表征具有第一端和第二端的靶多肽的方法;

3.根据权利要求2所述的方法,其中在步骤(i)之前,所述多核苷酸处理蛋白与所述缀合物的在所述多肽与所述阻断部分之间的部分结合。

4.根据权利要求1所述的方法,其中所述多核苷酸的第二端包含用于阻止所述多核苷酸处理蛋白与所述缀合物脱离的阻断部分。

5.根据权利要求4所述的方法,其中在步骤(i)之前,所述多核苷酸处理蛋白与所述缀合物的在所述多肽与所述阻断部分之间的部分结合。

6.根据权利要求2或权利要求3所述的方法,其中所述多肽的第二端与前...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种表征具有第一端和第二端的靶多肽的方法;

2.一种表征具有第一端和第二端的靶多肽的方法;

3.根据权利要求2所述的方法,其中在步骤(i)之前,所述多核苷酸处理蛋白与所述缀合物的在所述多肽与所述阻断部分之间的部分结合。

4.根据权利要求1所述的方法,其中所述多核苷酸的第二端包含用于阻止所述多核苷酸处理蛋白与所述缀合物脱离的阻断部分。

5.根据权利要求4所述的方法,其中在步骤(i)之前,所述多核苷酸处理蛋白与所述缀合物的在所述多肽与所述阻断部分之间的部分结合。

6.根据权利要求2或权利要求3所述的方法,其中所述多肽的第二端与前导附接。

7.根据权利要求1、4或6所述的方法,其中在步骤(i)之前,所述多核苷酸处理蛋白与所述缀合物的在所述多肽与所述前导的游离端之间的部分结合。

8.根据权利要求7所述的方法,其中所述前导通过多核苷酸接头与所述多肽附接,并且在步骤(i)之前,所述多核苷酸处理蛋白与所述接头结合。

9.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其包括重复步骤(iii)和(iv)多次。

10.根据权利要求1或6至9中任一项所述的方法,其中步骤(i)包括在使得所述前导穿过所述第一开口和所述第二开口的条件下使所述第一开口与所述前导接触。

11.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中在步骤(iii)中,所述缀合物在从所述第一开口到所述第二开口的方向移动;并且其中在步骤(ii)和(iv)中,所述多核苷酸处理蛋白控制所述缀合物在从所述第二开口到所述第一开口的方向的移动。

12.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述检测器包括跨膜纳米孔,所述跨膜纳米孔跨越具有顺式侧和反式侧的膜,并且:

13.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述缀合物不与所述多核苷酸处理蛋白脱离。

14.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中修饰所述多核苷酸处理蛋白以阻止所述缀合物与所述多核苷酸处理蛋白脱离。

15.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中用闭合部分修饰所述多核苷酸处理蛋白,用于拓扑地闭合所述缀合物周围的所述多核苷酸处理蛋白的所述多核苷酸结合位点。

16.根据权利要求15所述的方法,其中修饰所述多核苷酸处理蛋白以便于所述闭合部分与所述多核苷酸处理蛋白的附接。

17.根据权利要求15或16所述的方法,其中:

18.根据权利要求15至17中任一项所述的方法,其中所述闭合部分具有约至约任选地约至约的长度。

19.根据前述权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:M·J·布鲁斯J·E·格雷厄姆E·雷蒙德奥J·S·萨巴瓦尔C·P·尤德M·S·斯特里查斯卡
申请(专利权)人:牛津纳米孔科技公开有限公司
类型:发明
国别省市:

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