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基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法、装置、设备及存储介质制造方法及图纸

技术编号:42790603 阅读:32 留言:0更新日期:2024-09-21 00:47
本申请涉及一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法、装置、设备及存储介质,属于基因检测技术领域,方法包括:基于第一转录组测序数据构建训练集;其中,第一转录组测序数据是基于健康泌乳奶牛和罹患乳腺炎泌乳奶牛所生产牛乳的第一乳体细胞RNA样本生成的;利用LASSO回归模型构建多个基于RNA的分类器;利用训练集对多个基于RNA的分类器进行训练,得到训练好的分类器;将第二转录组测序数据输入训练好的分类器中,输出分类结果;其中,第二转录组测序数据是基于待检测混管牛乳的第二乳体细胞RNA样本生成的;基于分类结果,确定待检测混管牛乳对应的待检测泌乳奶牛中是否存在罹患乳腺炎的泌乳奶牛。本申请能够改善奶牛乳腺炎检测成本高、效率低的问题。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及基因检测,尤其是涉及一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法、装置、设备及存储介质


技术介绍

1、奶牛乳腺炎是由常见的致病菌(例如葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、坏死杆菌和腐败菌等)诱发的传染性疾病,会导致乳汁分泌减少或停止,对胎儿的生长发育产生不利影响,影响奶牛的生产和哺乳能力,严重情况下可能增加癌变的风险,对种群健康造成极大的威胁,导致奶业产量下降和经济效益降低。因此,及时发现并治疗奶牛乳腺炎,对于保障奶牛的健康和生产效益具有重要意义。

2、目前,对于奶牛乳腺炎的检测,主要是通过对每头奶牛生产的牛乳(牛乳是指刚从牛体内挤出、未经任何加工的牛奶)分别进行单管采样检测。虽然在一定程度上提升了奶牛乳腺炎防治效率,但是,仍存在以下问题:单管检测的成本一般在25~30元,而大型奶牛场一般都有上百、甚至上千头奶牛,即使是小型奶牛场,一般也有20~50头奶牛,可见,其检测成本较高;并且,除去奶牛场正常的工作以外,还要额外对每头奶牛生产的牛乳进行采样,这无疑会导致人力成本的增加和工作效率的降低。


技术实现思路

本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用LASSO回归模型对所述训练集中的初步特征进行降维和筛选,得到目标细胞特征,基于所述目标细胞特征构建多个基于RNA的分类器包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述通过十次交叉验证确定惩罚参数λ的最佳值包括:

4.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第一转录组测序数据是由以下方法生成的:

5.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第二乳体细胞RNA样本是由以下方法生成的

6....

【技术特征摘要】

1.一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用lasso回归模型对所述训练集中的初步特征进行降维和筛选,得到目标细胞特征,基于所述目标细胞特征构建多个基于rna的分类器包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述通过十次交叉验证确定惩罚参数λ的最佳值包括:

4.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第一转录组测序数据是由以下方法生成的:

5.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第二乳体细胞rna样本是由以下方法生成的:

6.一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测装置,其特征在于,包括:

7.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述分类器构建模块包括:

8.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述十次交叉验证子模块,...

【专利技术属性】
技术研发人员:王迪铭蔡杰刘建新
申请(专利权)人:浙江大学
类型:发明
国别省市:

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