【技术实现步骤摘要】
本申请涉及基因检测,尤其是涉及一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法、装置、设备及存储介质。
技术介绍
1、奶牛乳腺炎是由常见的致病菌(例如葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、坏死杆菌和腐败菌等)诱发的传染性疾病,会导致乳汁分泌减少或停止,对胎儿的生长发育产生不利影响,影响奶牛的生产和哺乳能力,严重情况下可能增加癌变的风险,对种群健康造成极大的威胁,导致奶业产量下降和经济效益降低。因此,及时发现并治疗奶牛乳腺炎,对于保障奶牛的健康和生产效益具有重要意义。
2、目前,对于奶牛乳腺炎的检测,主要是通过对每头奶牛生产的牛乳(牛乳是指刚从牛体内挤出、未经任何加工的牛奶)分别进行单管采样检测。虽然在一定程度上提升了奶牛乳腺炎防治效率,但是,仍存在以下问题:单管检测的成本一般在25~30元,而大型奶牛场一般都有上百、甚至上千头奶牛,即使是小型奶牛场,一般也有20~50头奶牛,可见,其检测成本较高;并且,除去奶牛场正常的工作以外,还要额外对每头奶牛生产的牛乳进行采样,这无疑会导致人力成本的增加和工作效率的降低。
技术实现
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1.一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用LASSO回归模型对所述训练集中的初步特征进行降维和筛选,得到目标细胞特征,基于所述目标细胞特征构建多个基于RNA的分类器包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述通过十次交叉验证确定惩罚参数λ的最佳值包括:
4.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第一转录组测序数据是由以下方法生成的:
5.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第二乳体细胞RNA样本是由以下方法生成的
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【技术特征摘要】
1.一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用lasso回归模型对所述训练集中的初步特征进行降维和筛选,得到目标细胞特征,基于所述目标细胞特征构建多个基于rna的分类器包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述通过十次交叉验证确定惩罚参数λ的最佳值包括:
4.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第一转录组测序数据是由以下方法生成的:
5.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述第二乳体细胞rna样本是由以下方法生成的:
6.一种基于混管奶样的奶牛乳腺炎检测装置,其特征在于,包括:
7.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述分类器构建模块包括:
8.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述十次交叉验证子模块,...
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