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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及动物分子育种,尤其涉及绵羊全基因组分子探针组合、基因芯片及其应用。
技术介绍
1、绵羊是重要的家畜之一,可为人类提供肉、毛、奶和皮革等生活物资,具有重要的经济价值、生态价值和社会文化价值。中国绵羊品种资源丰富,不仅具有风味好、耐粗饲、抗逆等优良特性,而且还具有丰富的遗传变异基础,是进行品种(系)培育及品种改良的优异素材。当前,地方品种遗传多样性精准评价及育种效率的提高是绵羊产业发展面临的主要挑战。全基因组遗传变异检测是开展基因组育种和遗传多样性精准评价的前提。
2、基因组选择育种技术作为一种新的育种技术手段,具有准确性高、世代间隔短、可对低遗传力性状进行选择等优点,已越来越普遍地应用于动植物的新品种培育并取得了较好的效果(李诚兰,郭婷婷,岳耀敬.基因组选择及其在羊育种中的应用研究进展[j].中国畜牧兽医,2023,50(02):616-625.doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.02.019;johnsson,m.genomics in animal breeding from the perspectives of matrices andmolecules.hereditas 160,20(2023).https://doi.org/10.1186/s41065-023-00285-w;mcgowan,m.;wang,j.;dong,h.;liu,x.;jia,y.;wang,x.;iwata,h.;li,y.;lipka,a.e.;zhang,z.ideas in
技术实现思路
1、本专利技术提供绵羊全基因组分子探针组合、基因芯片及其应用。
2、本专利技术通过世界范围内具有代表性的绵羊品种的重测序数据分析与繁殖性能、生长发育、环境适应性、尾型等性状相关的snp位点,并收集公开数据库、文献已报道的与绵羊重要性状关联snp位点,经snp位点筛选、组合和优化,获得包含50000个snp位点的snp位点集合,并基于此开发了包含中国和其他国家绵羊品种的50000个snp位点为检测对象的绵羊全基因组基因芯片。该芯片可用于绵羊基因组选择育种、遗传多样性评估、基因组关联分析、品种定等,可助力绵羊种质资源保护、改良及育种等,为绵羊产业高质量
3、发展提供高效精准的技术平台。
4、具体地,本专利技术提供以下技术方案:
5、第一方面,本专利技术提供绵羊全基因组snp分子标记组合,所述snp分子标记组合包括绵羊全基因组中的50000个snp分子标记,其物理位置和突变类型如表1所示(表1中位置的表示方式为染色体编号:在该染色体上的位置),所述物理位置的参考基因组为oar_rambouillet_v1.0。
6、表1
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【技术保护点】
1.绵羊全基因组分子探针组合,其特征在于,所述分子探针组合检测绵羊全基因组SNP分子标记组合;
2.权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合在制备绵羊全基因组基因芯片中的应用。
3.绵羊全基因组基因芯片,其特征在于,所述芯片的基因分型对象包括绵羊全基因组中的50000个SNP分子标记,其物理位置和突变类型如表1所示,所述物理位置的参考基因组为Oar_rambouillet_v1.0。
4.绵羊全基因组基因芯片,其特征在于,所述芯片负载有权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合。
5.用于绵羊基因分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因组基因芯片。
6.绵羊全基因组SNP分子标记组合或权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因组基因芯片或权利要求5所述的用于绵羊基因分型的试剂盒在绵羊基因组选择中的应用;
7.绵羊全基因组SNP分子标记组合或权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因
8.绵羊全基因组SNP分子标记组合或权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因组基因芯片或权利要求5所述的用于绵羊基因分型的试剂盒在绵羊全基因组关联分析或性状相关基因定位中的应用;
9.绵羊全基因组SNP分子标记组合或权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因组基因芯片或权利要求5所述的用于绵羊基因分型的试剂盒在绵羊遗传多样性分析中的应用;
10.绵羊全基因组SNP分子标记组合或权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因组基因芯片或权利要求5所述的用于绵羊基因分型的试剂盒在绵羊种质资源分析、种质资源改良、种质资源保护或系谱重构中的应用;
...【技术特征摘要】
1.绵羊全基因组分子探针组合,其特征在于,所述分子探针组合检测绵羊全基因组snp分子标记组合;
2.权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合在制备绵羊全基因组基因芯片中的应用。
3.绵羊全基因组基因芯片,其特征在于,所述芯片的基因分型对象包括绵羊全基因组中的50000个snp分子标记,其物理位置和突变类型如表1所示,所述物理位置的参考基因组为oar_rambouillet_v1.0。
4.绵羊全基因组基因芯片,其特征在于,所述芯片负载有权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合。
5.用于绵羊基因分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因组基因芯片。
6.绵羊全基因组snp分子标记组合或权利要求1所述的绵羊全基因组分子探针组合或权利要求3或4所述的绵羊全基因组基因芯片或权利要求5所述的用于绵羊基因分型的试剂盒在绵羊基因组选择中的应用;
<...【专利技术属性】
技术研发人员:赵倩君,黄畅,马月辉,陈倩,浦亚斌,张嘉良,
申请(专利权)人:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,
类型:发明
国别省市:
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