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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物医学分离(ipc分类号:c12q),尤其涉及一种生医分离用光响应dna微球的制备方法及应用。
技术介绍
1、mrna可以广泛用于分子生物学的各种下游实验中,例如rt-pcr、cdna文库的构建、northern blot分析、cdna微阵列、亲和纯化、引物延伸、消减杂交引物延伸、race(rapid-amplification of cdnaends通过pcr进行cdna末端快速克隆)、基因表达分析等方向。而如何对mrna进行高效、准确的提取,成为了生医分离领域仍在探究的课题。
2、在目前的分离提取方法中,磁珠表面共价偶联oligo(dt)越来越受到关注,通过磁珠表面共价偶联修饰,能够与真核生物mrna尾部的poly a互补配对,从而高效地从真核生物总rna或直接从动植物组织或细胞裂解物中快速分离出完整、高纯度的mrna。而其他rna种类(rrna和trna)不包含poly a序列,因此不会与oligo(dt)磁珠结合。磁珠表面共价偶联方法具有捕获效率高、使用方便等特点;但实际应用时,对于目标物质的特异性识别仍有待提升,加热洗脱、多次洗涤引入杂质甚至破坏目标物质的影响难以消除。
3、中国专利cn112126643b公开了一种基于磁珠分离外泌体中ecdna的方法,通过磁珠法高选择性地分离外泌体中ecdna,无需使用超速离心等复杂操作,也避免使用氯化铯等有毒试剂,能够适应自动化操作分离得到较高纯度ecdna产物。中国专利cn114196668a公开了一种用于捕获poly a(+)rna的磁珠
技术实现思路
1、本专利技术人在先研究发现一种偶氮苯光敏单体,能够插入任意dna序列任意位置得到掺杂偶氮苯的光敏dna(kou b,guo x,xiao s,et al.highly efficient room-temperature photoresponsive dna tethering azobenzene through backbone-inserted glycerol via ether bond[j].small,2013,9(23):3939-3943)。光敏dna在可见光下可与序列互补的天然dna链、rna链杂交,也能正常与相应特定蛋白和酶作用;紫外光照后双链打开,生物功能消失;由此可实现目标物质的提取与分离。在这样的思路下,如将光敏dna修饰在微球表面,可得到光响应分离用微球,除具备正常表面功能化微球性能外,还增加了光控分离、可重复使用等功能,具备简化操作步骤、节约试剂消耗、节能安全无污染等特点,可用于药物筛选、生物医用分子分离提纯、医疗检测等领域。本申请旨在将微球分离和光控dna双链解链相结合,为生医分离提供一种全新的实践思路。
2、光敏dna最早是由日本合成(asanuma h,liang x,nishioka h,et al.synthesisof azobenzene-tethered dna for reversible photo-regulation of dna functions:hybridization and transcription[j].nature protocols.2007,2(1):203-212.),但其光控效率低,无法完成光洗脱。另外日本合成的光敏dna价格高昂,限制了应用推广。本申请改进合成的光敏解链dna与日本相比,光控效率至少提高30%,成本至少降低50%,使得光洗脱产业化未来可期,实用价值高。
3、本专利技术第一方面提供了一种生医分离用光响应dna微球的制备方法,制备步骤包括:
4、(1)取掺杂偶氮苯的dna分子配制光敏dna溶液;
5、(2)取表面修饰nhs基团的微球或磁珠,清洗后富集;
6、(3)将光敏dna溶液与nhs修饰微球混合,制备光响应dna微球。
7、(4)对光响应dna微球进行封闭、洗涤,溶于缓冲溶液备用。
8、参见图1,本项技术将掺杂偶氮苯序列的光敏dna链与表面带有nhs酯官能团的微球以共价键连接,用于分离提纯目标溶液中的特定物质。所得光响应dna微球结构中,光敏dna链位于微球的表面,通过序列设计可与目标物质产生“特异性结合”。通过优化操作工艺,可提升光敏dna链和微球的结合率,进一步提高光响应dna微球的提取效率。
9、优选的,所述步骤(1)具体为,用nahco3溶液(100-300mm)溶解氨基修饰的偶氮苯掺杂光敏dna分子(专利技术人提供光敏单体,设计光敏3’nh2-或5’nh2-光敏dna序列,交由引物合成公司代合成),配置光敏dna溶液。所述光敏dna溶液中光敏dna分子的浓度为0.1-10mg/ml。
10、优选的,所述步骤(2)具体为,将表面修饰nhs基团的微球悬浮液(1~20mg/ml)加入带盖塑料离心管(下称ep管)中富集去除上清液(普通微球采用高速离心机,磁珠采用磁性分离架富集分离)。然后加入0.1-1.5mm的盐酸水溶液于ep管中,清洗富集去除上清液备用。
11、优选的,所述步骤(3)具体为,向ep管中加入步骤(1)制备得到的光敏dna溶液,涡旋10-60s混合均匀;将ep管置于垂直混合仪上,室温混合0.5-4h后富集微球。
12、为了促进光敏dna链和微球的结合效果,进一步优选的,所述步骤(3)具体为,向ep管中加入步骤(1)制备得到的光敏dna溶液,涡旋30s混合均匀;将ep管置于垂直混合仪上,室温混合1~2h,每隔15min,取下ep管涡旋15s后富集。
13、优选的,所述步骤(4)具体为,向ep管中加入封闭缓冲液(100mm tris-hcl,150mmnacl,ph 8.0)进行涡旋,将ep管置于垂直混合仪中室温反应2h。然后富集弃上清液。加入超纯水,洗涤富集弃上清液。加入te缓冲液(10mm tris-hcl,1mm edta,ph 7.5)于ep管中,富集上清液2次,加入te缓冲液配制1~20mg/ml的光响应dna微球,4℃保存备用。进一步优选的,所得光响应dna微球的浓度为5~10mg/ml。
14、本专利技术第二方面提供了一种如上所述光响应dna微球的制备方法在生物医用分子分离提纯中的应用。所述生物医用分子包括dna,rna,蛋白质,酶等能够与天然dna结合的物质。所述光响应dna微球的应用方法具体为:
15、s1.将光响应dna微球富集洗涤后悬浮于结合缓冲液;
16、s2.将生物样本加入到光响应磁珠悬浮液中进行孵育,使目标物质与光响应dna微球相结合,得到目标物质-微球结合物;
17、s3.本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种生医分离用光响应DNA微球的制备方法,其特征在于,所述光响应DNA微球的制备步骤包括:
2.根据权利要求1所述的生医分离用光响应DNA微球的制备方法,其特征在于,所得光响应DNA微球的浓度为1~20mg/mL;优选的,混合后光响应DNA微球的浓度为5~10mg/mL。
3.一种根据权利要求1或2所述光响应DNA微球的制备方法的应用,其特征在于,可应用于生物医用分子的分离提纯领域。
4.根据权利要求3所述光响应DNA微球的制备方法的应用,其特征在于,所述生物医用分子为可与天然DNA结合的生物医用分子,包括DNA,RNA,蛋白质,酶。
5.根据权利要求4所述光响应DNA微球的制备方法的应用,其特征在于,所述光响应DNA微球的应用方法具体为:
6.根据权利要求5所述光响应DNA微球的制备方法的应用,其特征在于,所述步骤S3洗脱纯化步骤是通过紫外光洗脱得到。
7.根据权利要求6所述光响应DNA微球的制备方法的应用,其特征在于,所述紫外光洗脱,可以使用的光源包括紫外灯管、LED光源或氙灯光源及滤光片组合,照射时
8.根据权利要求5所述光响应DNA微球的制备方法的应用,其特征在于,洗脱纯化分离后的光响应DNA微球可以进行再生利用;所述再生方法为,取步骤S3分离后的光响应DNA微球,洗涤后通过可见光照射进行再生处理;处理后的光响应DNA微球能够再次重复S1~S3步骤,从而实现循环使用。
9.一种根据权利要求1或2所述光响应DNA微球的制备方法在药物筛选、基因测序、医疗检测领域的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种生医分离用光响应dna微球的制备方法,其特征在于,所述光响应dna微球的制备步骤包括:
2.根据权利要求1所述的生医分离用光响应dna微球的制备方法,其特征在于,所得光响应dna微球的浓度为1~20mg/ml;优选的,混合后光响应dna微球的浓度为5~10mg/ml。
3.一种根据权利要求1或2所述光响应dna微球的制备方法的应用,其特征在于,可应用于生物医用分子的分离提纯领域。
4.根据权利要求3所述光响应dna微球的制备方法的应用,其特征在于,所述生物医用分子为可与天然dna结合的生物医用分子,包括dna,rna,蛋白质,酶。
5.根据权利要求4所述光响应dna微球的制备方法的应用,其特征在于,所述光响应dna微球的应用方法具体为:
6.根据权利要求5所述光响应d...
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