【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及水稻育种领域，特别是一种用于检测水稻香味基因fgr特定突变的parms引物组及应用。
技术介绍
1、水稻是中国重要的粮食作物，伴随着人们生活水平的不断提高，人们对水稻的需求不仅停留在量上，也在寻求质的提高。香味是衡量水稻品质的标准之一，香米由于具有独特香味，同时也具有很高的营养价值，富含多种维生素、氨基酸，深受消费者青睐，生产和市场价值较高。因此，香味性状也成为育种家们研究的热点，是水稻品质改良的重要研究内容。
2、传统人工品尝鉴定水稻香味种质资源具有耗时长、主观性强等缺点，鉴定结果容易造成误差，费时费力。利用分子标记辅助选择育种简单有效，可以节约人工成本，缩短选育周期，亦可进行有目的的多基因聚合，提高育种效率，带来巨大的社会经济效益。
技术实现思路
1、为了解决上述技术问题，本专利技术提供了一种用于检测水稻香味基因fgr特定突变的parms引物组及应用。
2、为达到上述目的，本专利技术是按照以下技术方案实施的：
3、本专利技术的目的之一是要提供一种用于检测水稻香味基因fgr特定突变的parms引物组，所述引物组包括特异性引物和通用引物，其中，所述特异性引物包括核苷酸序列如seq id no.1所示的primer seq fgr-m8fa和核苷酸序列如seq id no.2所示的primerseqfgr-m8ft，所述通用引物为核苷酸序列如seq id no.3所示的primer fgr-m8r；所述特定突变位点位于水稻日本晴msu
4、进一步地，所述primer seqfgr-m8fa的5’端连接fam荧光序列，primer seq fgr-m8ft的5’端连接hex荧光序列；或所述primer seq fgr-m8fa的5’端连接hex荧光序列，primer seq fgr-m8ft的5’端连接fam荧光序列。
5、本专利技术的目的之二是要提供一种引物组在鉴定水稻fgr基因型中的应用，包括如下步骤：
6、s1、从水稻叶片中提取基因组dna；
7、s2、以步骤s1中提取的基因组dna为模板，利用检测水稻香味基因fgr的parms分子标记的引物组，用parms技术对fgr-m8ft分子标记进行检测；若fgr-m8ft的序列为t插入，判定测试的水稻样品为fgr功能型，纯合的香味fgr基因型；若fgr-m8ft的序列为t缺失，判定测试的水稻样品为纯合的非香fgr基因型；若fgr-m8ft的多态位点同时检测到t/-，判断待测水稻为杂合的fgr基因型。
8、与现有技术相比，通过对本专利技术的检测水稻香味基因fgr特定突变的parms引物组，应用parms技术反应对水稻材料进行fgr基因检测，可在籼稻、粳稻等不同种质资源中快速、精准的检测水稻香味基因fgr。本专利技术利用parms技术对fgr基因进行分型，相比于目前最常用的基于pcr+电泳的ssr技术，parms检测技术免去了耗时费力的电泳技术，采用荧光扫描的方式直接读取等位基因的基因型信号，配合数据分析软件，可快速完成基因型分析工作，工作效率具有数量级的提升；parms技术非常适用于检测自动化，配合genematrix高通量基因分型系统，可以做到每天十万个数据点的超高通量的fgr基因鉴定和香味资源筛选。parms完美兼容lgc kasp snp检测硬件体系以及引物，可做到无缝转换。本专利技术在检测过程中不需要酶切、电泳及测序等繁琐的程序，减少pcr产物气溶胶的污染以及eb等有毒物的使用，同时可在分子标记辅助育种的早期进行前景选择，减小育种群体的规模，加快育种进程。
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1.一种用于检测水稻香味基因Fgr特定突变的PARMS引物组，其特征在于：所述引物组包括特异性引物和通用引物，其中，所述特异性引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的Primer Seq Fgr-M8Fa和核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的Primer Seq Fgr-M8Ft，所述通用引物为核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的Primer Fgr-M8R；所述特定突变位点位于水稻日本晴msu7.0第8号染色体的Fgr基因第20380297位碱基处，存在一个碱基T的插入。
2.根据权利要求1所述的用于检测水稻香味基因Fgr特定突变的PARMS引物组，其特征在于：所述Primer Seq Fgr-M8Fa的5’端连接FAM荧光序列，Primer Seq Fgr-M8Ft的5’端连接HEX荧光序列；或所述Primer Seq Fgr-M8Fa的5’端连接HEX荧光序列，Primer Seq Fgr-M8Ft的5’端连接FAM荧光序列。
3.一种如权利要求2所述的引物组在鉴定水稻Fgr基因型中的应用。
4.根据权利要求3所述的引物组
...【技术特征摘要】
1.一种用于检测水稻香味基因fgr特定突变的parms引物组，其特征在于：所述引物组包括特异性引物和通用引物，其中，所述特异性引物包括核苷酸序列如seq id no.1所示的primer seq fgr-m8fa和核苷酸序列如seq id no.2所示的primer seq fgr-m8ft，所述通用引物为核苷酸序列如seq id no.3所示的primer fgr-m8r；所述特定突变位点位于水稻日本晴msu7.0第8号染色体的fgr基因第20380297位碱基处，存在一个碱基t的插入。
2.根据权利要求1...
【专利技术属性】
技术研发人员：郑文静，闫博文，马作斌，王丽丽，高虹，唐志强，张丽颖，何娜，付亮，隋国民，王辉，王昌华，陈宏伟，
申请(专利权)人：辽宁省水稻研究所，
类型：发明
国别省市：
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