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胶原蛋白的亲和配基及其仿生设计方法技术

技术编号:42632113 阅读:33 留言:0更新日期:2024-09-06 01:32
本发明专利技术涉及生物技术的计算机模拟领域,特别涉及胶原蛋白的亲和配基及其仿生设计方法。本发明专利技术公开了利用分子动力学(MD)模拟等技术仿生设计目标蛋白的亲和配基的技术以及通过该技术获得的胶原蛋白亲和肽配基,实验证明所述亲和肽配基可以有效地特异性结合胶原蛋白,能够实现胶原蛋白的亲和分离纯化。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物技术中的计算机模拟领域,特别涉及胶原蛋白亲和配基仿生设计。


技术介绍

1、糖蛋白vi(gpvi)是一种含有58 kda的i型跨膜蛋白。其胞外区含有2个免疫球蛋白样结构域(d1、d2),是其二聚化状态下与胶原蛋白紧密结合的重要部位。胶原蛋白通过甘氨酸-脯氨酸-羟脯氨酸(gpo)序列与gpvi结合。如果仿照gpvi的结合细节设计肽配基,预期可以特异性结合胶原蛋白实现其亲和分离纯化。

2、含有结合作用的关键氨基酸的短肽可以模拟蛋白质的结合位点,故亲和肽配基适用于靶向胶原蛋白的结合。仿生设计的多肽亲和配基具有高亲和性、高稳定性、不易降解及制备简便等优点,具有重要的开发前景。近年来,随着分子模拟技术的飞速发展,通过模拟已存在的目标蛋白-抗体的相互作用以设计筛选高特异性亲和配基成为可能,筛选效率及准确性也不断提高。


技术实现思路

1、有鉴于此,本专利技术提供了胶原蛋白亲和配基仿生设计方法,通过该设计方法获得的胶原蛋白亲和配基可以有效地特异性结合胶原蛋白,实现胶原蛋白的亲和分离纯化。

<本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.计算机模拟获得胶原蛋白的亲和配基的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述筛选包括:分子对接筛选、均方根偏差比较、结合位点对比或疏水残基分析中的一种或多种;

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,包括以下步骤:

4.胶原蛋白的亲和配基,其特征在于,具有如SEQ ID NO: 15或SEQ ID NO: 16所示的氨基酸序列。

5.如权利要求4所述的亲和配基,其特征在于,其氨基酸序列如SEQ ID NO: 1至SEQ IDNO: 14任一所示。

6.如权利要求5所述的亲和配基,其特征在于...

【技术特征摘要】

1.计算机模拟获得胶原蛋白的亲和配基的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述筛选包括:分子对接筛选、均方根偏差比较、结合位点对比或疏水残基分析中的一种或多种;

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,包括以下步骤:

4.胶原蛋白的亲和配基,其特征在于,具有如seq id no: 15或seq id no: 16所示的氨基酸序列。

5.如权利要求4所述的亲和配基,其特征在于,其氨基酸序列如seq id no: 1至...

【专利技术属性】
技术研发人员:张麟吉昱帆刘琦
申请(专利权)人:天津大学
类型:发明
国别省市:

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