一种联合外显子测序和代谢组学建立的胃癌的分子分型系统技术方案

本发明专利技术公开了一种联合外显子测序和代谢组学建立的胃癌的分子分型系统，属于计算医学和肿瘤临床医学技术领域。本发明专利技术是首个大规模临床样本中完成多组学数据分析和整理，并建立了基于多组学数据分析的中国胃癌分子分型系统，丰富了对中国胃癌患者的基因组特征和独特的代谢表现的理解；本发明专利技术建立的胃癌分子分型系统将胃癌划分为四种分子差异明显的亚型，并详细具体地分析了四种亚型的代谢特征、预后、基因组改变，有助于临床的精确医疗的实施；本发明专利技术还根据提出的胃癌分子分型系统，相关研究结果也解释了胃癌异质性原因，并讨论了四种亚型对应的可能分子治疗靶点，为胃癌的精准靶向治疗提供了可靠理论依据。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于计算医学和肿瘤临床医学，具体涉及一种联合外显子测序和代谢组学建立的胃癌的分子分型系统。

技术介绍

1、胃癌(gastric cancer，gc)是一种全世界最常见的恶性肿瘤之一，也是导致人类恶性肿瘤死亡的重要原因。据世界卫生组织国际癌症研究机构(international agencyfor research on cancer，iarc)最新发布的数据显示，胃癌是我国发病率和死亡率均高居第三的恶性肿瘤。胃癌防治是我国恶性肿瘤防控面临的重大挑战。目前临床上胃癌的治疗模式已逐渐从手术±放化疗的较为单一治疗模式转变为手术、放化疗、分子靶向治疗及免疫治疗等相结合的综合个体化治疗模式，但由于胃癌早期症状隐匿等原因导致其5年生存率仅为35.9％。更重要的是，胃癌是高度异质性肿瘤，涉及组织病理学、遗传、表观遗传学和转录组学方面，这对准确诊断和个性化治疗提出了严峻的挑战。因此缺乏有效的疗效预测标记物来筛选出胃癌化疗、靶向及免疫等治疗的优势获益人群是目前制约胃癌临床研究进展的瓶颈。

2、在过去的数十年中，人们致力于将胃癌分类为几种亚型用以指导治疗本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种联合外显子测序和代谢组学建立的胃癌的分子分型系统，其特征在于，所述分子分型系统包括：

2.根据权利要求1所述胃癌的分子分型系统，其特征在于，所述基因组特征包括：TP53、FAT3、CTNNB1、FGFR2、LATS1、MAP2K1、NRAS、RNF43、TCF7L2、AXIN1、FGFR2、LATS1、NRAS、RNF43、TCF7L2、AXIN1、FGFR2、LATS1、NRAS、RNF43、TCF7L2；

3.根据权利要求1所述胃癌的分子分型系统，其特征在于，在胃癌分子分型的模块中，通过R语言中的mogsa包中的mbpca函数将基因组特征和代谢特征进行...

【技术特征摘要】

1.一种联合外显子测序和代谢组学建立的胃癌的分子分型系统，其特征在于，所述分子分型系统包括：

2.根据权利要求1所述胃癌的分子分型系统，其特征在于，所述基因组特征包括：tp53、fat3、ctnnb1、fgfr2、lats1、map2k1、nras、rnf43、tcf7l2、axin1、fgfr2、lats1、nras、rnf43、tcf7l2、axin1、fgfr2、lats1、nras、rnf43、tcf7l2；

3.根据权利要求1所述胃癌的分子分型系统，其特征在于，在胃癌分子分型的模块中，通过r语言中的mogsa包中的mbpca函数将基因组特征和代谢特征进行降维，获得主成分；

4.根据权利要求1所述胃癌的分子分型系统，其特征在于，胃癌分为四个具有不同代谢特征、预后、基因组改变的异质性聚类即四个分子分型，命名为亚型1、亚型2、亚型3和亚型4；

5.根据权利要求1所述胃癌的分子分型系统，其特征在于，所述癌旁组织来自以肿瘤组织为中心、半径为2cm范围内的区域。

6.一种联合...

【专利技术属性】
技术研发人员：俞珊珊，陈明，陈铖，周东辉，
申请(专利权)人：浙江大学，
类型：发明
国别省市：