抗体序列的获取与抗体设计模型的训练方法、装置制造方法及图纸

技术编号:42616723 阅读:38 留言:0更新日期:2024-09-03 18:22
本公开提供一种抗体序列的获取与抗体设计模型的训练方法。获取方法包括:根据抗原MSA序列与抗体MSA序列的拼接序列、抗原MSA序列与抗体MSA序列,得到不同序列位置处的氨基酸的第一特征;根据参考抗原抗体复合体所构建的图Graph,得到不同三维坐标处的氨基酸的第二特征;将不同序列位置处的氨基酸的第一特征与对应不同序列位置的三维坐标处的氨基酸的第二特征融合,根据融合特征得到每个氨基酸在不同位置处的概率信息;根据氨基酸与氨基酸在同位置处的概率信息得到目标抗体序列。训练方法包括:获取多个数据样本;构建包含第一特征提取模块、第二特征提取模块与特征融合模块的神经网络模型;使用多个数据样本对神经网络模型进行训练,得到抗体设计模型。

【技术实现步骤摘要】

本公开涉及人工智能,具体涉及生物计算,尤其设计一种抗体序列的获取与抗体设计模型的训练方法、装置、电子设备与可读存储介质。


技术介绍

1、大分子药物具有高度的靶向性和特异性,大分子药物设计旨在开发具有治疗潜力的生物大分子,如蛋白质、抗体、核酸等。但目前对于抗体药物的设计依赖于湿实验发,研发成本较高,且效率低下。


技术实现思路

1、根据本公开的第一方面,提供了一种抗体序列的获取方法,包括:分别对抗原序列与初始抗体序列进行多序列比对msa,得到抗原msa序列与抗体msa序列;将所述抗原msa序列与所述抗体msa序列进行拼接,根据拼接序列、所述抗原msa序列与所述抗体msa序列中各氨基酸的属性特征,得到所述拼接序列中不同序列位置处的氨基酸的第一特征;根据参考抗原抗体复合体中的氨基酸与氨基酸之间的连接关系构建图graph,根据所述graph中各氨基酸的属性特征,得到所述参考抗原抗体复合体中不同三维坐标处的氨基酸的第二特征;将不同序列位置处的氨基酸的第一特征与对应不同序列位置的三维坐标处的氨基酸的第二特征进行融合,根据融本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种抗体序列的获取方法,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据拼接序列、所述抗原MSA序列与所述抗体MSA序列中各氨基酸的属性特征,得到所述拼接序列中不同序列位置处的氨基酸的第一特征包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据所述Graph中各氨基酸的属性特征,得到所述参考抗原抗体复合体中不同三维坐标处的氨基酸的第二特征包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据氨基酸以及氨基酸在抗体序列中不同位置处的概率信息,得到目标抗体序列包括:

5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述将所述抗原MSA序列与所述抗体M...

【技术特征摘要】

1.一种抗体序列的获取方法,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据拼接序列、所述抗原msa序列与所述抗体msa序列中各氨基酸的属性特征,得到所述拼接序列中不同序列位置处的氨基酸的第一特征包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据所述graph中各氨基酸的属性特征,得到所述参考抗原抗体复合体中不同三维坐标处的氨基酸的第二特征包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据氨基酸以及氨基酸在抗体序列中不同位置处的概率信息,得到目标抗体序列包括:

5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述将所述抗原msa序列与所述抗体msa序列进行拼接,根据拼接序列、所述抗原msa序列与所述抗体msa序列中各氨基酸的属性特征,得到所述拼接序列中不同序列位置处的氨基酸的第一特征包括:

6.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据参考抗原抗体复合体中的氨基酸与氨基酸之间的连接关系构建图graph,根据所述graph中各氨基酸的属性特征,得到所述参考抗原抗体复合体中不同三维坐标处的氨基酸的第二特征包括:

7.根据权利要求1所述的方法,其中,所述将不同序列位置处的氨基酸的第一特征与对应不同序列位置的三维坐标处的氨基酸的第二特征进行融合,根据融合特征得到每个氨基酸在抗体序列中不同位置处的概率信息包括:

8.一种抗体设计模型的训练方法,包括:

9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述将所述样本抗原msa序列、所述样本抗体msa序列、所述样本抗原抗体复合体输入所述神经网络模型,根据所述神经网络模型的输出结果,得到预测抗体序列包括:

10.一种抗体序列的获取装置,包括:

11.根据权利要求10所述的装置,其中,所述第一特征提取单元在根据拼接序列、所述抗原msa序列与所述抗体msa序列中各氨基酸的属性特征,得到所述拼接序列中不同序列位置处的氨基酸的第一特征时,具体...

【专利技术属性】
技术研发人员:郜杰胡靖方晓敏张肖男
申请(专利权)人:北京百度网讯科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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