一种肿瘤新抗原肽的筛选方法及新抗原疫苗抗癌应用方法技术

本发明专利技术提出了一种肿瘤新抗原肽的筛选方法及新抗原疫苗抗癌应用方法，本发明专利技术拟通过虚拟筛选手段结合常用预测方法，发现高HLA‑A*24:02结合力的抗原锚定残基的特征参数；进一步基于晚期免疫治疗耐药的结直肠癌患者的基因分析，结合本发明专利技术中的特征参数及已报道的结直肠癌高频突变基因、HLA分型、T/B细胞抗原表位预测等参数，筛选得到高HLA‑A*24:02结合力的限制性肿瘤新抗原，联合甘露寡糖作为佐剂，组成新抗原疫苗，显著增强DC和CTL免疫细胞的抗肿瘤作用。本发明专利技术经体外特异性CTL细胞活化试验验证新抗原疫苗杀灭肿瘤细胞的有效性，并采用转录组测序以发现相关作用机制，该机制有望成为克服晚期结直肠癌免疫耐药的关键途径。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医药，具体涉及一种高hla结合力的肿瘤新抗原肽的筛选方法及新抗原疫苗抗癌应用方法

技术介绍

1、结直肠癌(crc)位居恶性肿瘤发病率前列，晚期患者的5年生存率低于20％。既往的晚期一线治疗方式是化疗联合抗血管内皮生长因子(vegf)或抗表皮生长因子受体(egfr)抗体，但大多数患者在1年内病情进展迅速。le等发现具有错配修复基因缺陷(dmmr)或高度微卫星不稳定(msi-h)分子表型的晚期crc能从免疫检查点抑制剂——程序性死亡受体(pd-1)单抗pembrolizumab免疫治疗中显著获益，因此开启了crc免疫治疗时代。然而，抗pd-1单抗的临床疗效及应用被高发的耐药所限制，大部分肿瘤治疗后的缓解率(orr)不超过40％。脾胃湿热证和脾气亏虚证是晚期结直肠癌患者最常见的两种中医证型，且各具不同的免疫特征，目前尚缺乏创造性地研究肿瘤新抗原肽对上述两种中医证型的免疫治疗耐药晚期结直肠癌的各异的抗肿瘤免疫作用。

2、癌症基因组的不稳定性导致突变的积累，这些突变可产生使t细胞免疫耐受豁免的肿瘤特异性新抗原。这些新抗原被认为是t细胞抗本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，所述HLA与抗原具体为HLA-A*24:02等位基因型和来源于HPV基因组保守区域E6和E7的抗原九肽CYSLYGTTL和HYNIVTFCC；HLA-A*2402晶体结构(PDB ID:7JYV)来源于RCSB数据库。

3.根据权利要求1所述的一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，步骤S1中多肽结构由rosetta产生，使用pymol检查结构，转换为pdb格式。

4.根据权利要求1所述的一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，步...

【技术特征摘要】

1.一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，所述hla与抗原具体为hla-a*24:02等位基因型和来源于hpv基因组保守区域e6和e7的抗原九肽cyslygttl和hynivtfcc；hla-a*2402晶体结构(pdb id:7jyv)来源于rcsb数据库。

3.根据权利要求1所述的一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，步骤s1中多肽结构由rosetta产生，使用pymol检查结构，转换为pdb格式。

4.根据权利要求1所述的一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，步骤s6中所述数据收集的具体方法为：采用薛定谔软件进行多肽-hla的界面分析；进一步载入复合物，将peptide识别为配体，将hla识别为受体；随后选择task菜单中的protein interactionanalysis进行分析，导出csv格式文件。

5.根据权利要求1所述的一种肿瘤新抗原肽的筛选方法，其特征在于，步骤s7中抗原与hla的亲和力和稳定性分别采用netmhcpan和netm...

【专利技术属性】
技术研发人员：朱影，姚庆华，
申请(专利权)人：中国科学院基础医学与肿瘤研究所筹，
类型：发明
国别省市：