用于增强对DIA数据的完整数据提取的方法技术

将DIA方法的n个谱与产物离子谱库进行比较，以识别对应于l个谱的初始的i种化合物。执行强化学习算法(RLA)。(a)RLA的代理执行动作A<subgt;t</subgt;，包括在一个或多个化合物数据库中搜索与该i种化合物相关的化合物，从而产生j种相关化合物，以及应用一种或多种深度学习预测算法来预测这i+j种化合物的k个谱。(b)RLA的环境将该k个谱与该n个谱进行比较，从而产生状态S<subgt;t</subgt;，其中i+j种化合物产生m种匹配化合物，并且如果m>i则为该代理产生奖励R<subgt;t</subgt;。(c)如果产生了R<subgt;t</subgt;，则将该i种化合物设置为该m种化合物以及将该l个谱设置为该k个谱，并重复步骤(a)‑(c)。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本文的教导涉及用于从数据非依赖采集(dia)质谱法实验中提取附加信息的系统和方法。更具体地，本文的教导涉及其中使用强化学习算法从dia数据提取附加化合物的系统和方法，在强化学习算法中使用先前识别的化合物的相关化合物来增加从dia数据识别的化合物的数量。本文的系统和方法可以结合处理器、控制器或计算机系统(诸如图1的计算机系统)来执行。

技术介绍

1、dia数据提取

2、如下所述，数据非依赖采集(dia)是一种无目标且非特异性的碎裂方法。在传统的dia方法中，串联质谱仪的动作没有基于先前的前体或产物离子扫描中采集的数据而在ms/ms扫描之间变化。相反，选择前体离子质量范围。然后使前体离子质量选择窗步进跨越前体离子质量范围。对前体离子质量选择窗中的所有前体离子进行碎裂，并且对前体离子质量选择窗中的所有前体离子的所有产物离子进行质量分析。

3、dia数据的信息非常丰富，并且在大多数情况下，数据处理是利用谱库进行的。该库提供了样品中可能存在的化合物的谱，并且使得能够提取它们的定量信息。目前，如果谱库中不存在某种化合物，则没有解决方案能够从di本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于从数据非依赖采集(DIA)质谱法实验中提取附加信息的系统，包括：

2.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中所述处理器：

3.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中所述处理器将所述n×t个产物离子谱和从所述n×t个产物离子谱得到的保留时间与产物离子质谱库进行比较，并且在步骤(b)中，将所述i+j种化合物的预测谱和保留时间与所述n×t个产物离子谱和从所述n×t个产物离子谱得到的保留时间进行比较。

4.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中所述处理器进一步在步骤(a)-(c)之前使用从所述n个谱与库的比较中找到的所述i种...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种用于从数据非依赖采集(dia)质谱法实验中提取附加信息的系统，包括：

2.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中所述处理器：

3.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中所述处理器将所述n×t个产物离子谱和从所述n×t个产物离子谱得到的保留时间与产物离子质谱库进行比较，并且在步骤(b)中，将所述i+j种化合物的预测谱和保留时间与所述n×t个产物离子谱和从所述n×t个产物离子谱得到的保留时间进行比较。

4.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中所述处理器进一步在步骤(a)-(c)之前使用从所述n个谱与库的比较中找到的所述i种化合物和对应的l个谱来重新训练所述一种或多种dlpa。

5.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中所述样品的所述一种或多种化合物包括一种或多种肽，库包括已知肽的产物离子质谱库，所述i种化合物包括i种肽，所述i种化合物包括i种肽，所述m种化合物包括m种肽，所述一个或多个化合物数据库包括一个或多个肽数据库。

6.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中在步骤(a)中，所述处理器使用i种肽中的至少一种肽的序列来在一个或多个肽数据库中搜索与所述至少一种肽相关的肽。

7.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中在步骤(a)中，所述处理器使用i种肽中的至少一种肽的关键字来在一个或多个肽数据库中搜索与所述至少一种肽相关的肽。

8.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，其中在步骤(a)中，所述处理器使用i种肽中的至少一种肽的保留时间来在一个或多个肽数据库中搜索与所述至少一种肽相关的肽。

9.根据前述系统权利要求的任意组合所述的系统，...

【专利技术属性】
技术研发人员：S·A·泰特，
申请(专利权)人：DH科技发展私人贸易有限公司，
类型：发明
国别省市：