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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及水产品品种鉴定领域,特别是涉及一种快速鉴定松浦鲤的分子标记组合、引物组及其方法和应用。
技术介绍
1、鲤(cypriuscarpio),隶属于鲤形目、鲤科,是我国重要的淡水养殖鱼类,其年产量约占我国淡水养殖鱼类的11.3%,且在长期人工培育下形成多个具有特色、经济价值较高的品种,积累了丰富的鲤种质资源。松浦鲤是以黑龙江鲤、荷包红鲤、散鳞镜鲤和德国镜鲤为亲本,经杂交选育获得的具有生长速度快、抗寒、耐低氧等优势的鲤鱼品种,在北方和高寒地区广泛养殖。然而,在养殖的引种育种过程中,对于外观相似鲤品种的鱼苗和亲鱼,难以通过外观进行准确的品种区分,导致不同来源的鲤鱼种质造成品种渐渗、种质混杂的现象,影响松浦鲤的保种育种,也影响养殖户和消费者的利益。因此,亟需开发周期短、成本低、操作简单、能批量化操作的新方法用于松浦鲤及其相似品种的快速鉴定。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种快速鉴定松浦鲤的分子标记组合、引物组及其方法和应用,以解决上述现有技术存在的问题,本专利技术筛选到包含4个snp位点的snp分子标记组合,可以快速、特异性地鉴定待测鲤鱼是否为松浦鲤。
2、为实现上述目的,本专利技术提供了如下方案:
3、本专利技术提供了一种鉴定松浦鲤的snp分子标记组合,包括位于鲤基因组上的4个snp位点snp1-snp4;
4、所述snp1-snp4的位点信息如下所示:
5、
6、所述鲤基因组在ncbi上的注册登录号为gc
7、本专利技术还提供了一种扩增所述的snp分子标记组合的引物组,包括序列如下所示的引物:
8、
9、
10、本专利技术还提供了所述的引物组在制备鉴定松浦鲤的试剂盒中的应用。
11、本专利技术还提供了一种鉴定松浦鲤的试剂盒,包含所述的引物组。
12、本专利技术还提供了所述的snp分子标记组合、所述的引物组或所述的试剂盒在以下任一项中的应用:
13、(1)鉴定松浦鲤;
14、(2)筛选鲤鱼苗苗种;
15、(3)筛选鲤鱼高纯度亲本。
16、优选的是,所述鉴定松浦鲤为在松浦鲤、建鲤、黄河鲤和呆鲤4种外观相似的鲤鱼中确定待测鲤是否为松浦鲤。
17、本专利技术还提供了一种鉴定松浦鲤的方法,包括以下步骤:
18、提取待测鲤的基因组dna;
19、以所述基因组dna为模板,使用所述的引物组进行pcr扩增;
20、测序,对所述的snp分子标记组合的4个snp位点进行基因分型,获取4个snp位点的基因型;
21、根据基因分型的结果判定所述待测鲤是否为松浦鲤。
22、优选的是,所述鉴定松浦鲤为在松浦鲤、建鲤、黄河鲤和呆鲤4种外观相似的鲤鱼中确定待测鲤是否为松浦鲤。
23、优选的是,所述判定的标准为,仅在所述基因分型的结果表现为snp1位点基因型为aa、snp2位点基因型为aa、snp3位点基因型为tt以及snp4位点基因型为tt时,判定所述待测鲤为松浦鲤。
24、本专利技术还提供了一种筛选鲤鱼苗苗种的方法,包括以下步骤:
25、对于小型鱼苗,进行全组织取样,使用所述鉴定松浦鲤的方法鉴定是否为松浦鲤;
26、或者,对于大型鱼苗,采集鳍条,使用所述鉴定松浦鲤的方法鉴定是否为松浦鲤;
27、仅保留鉴定为松浦鲤的鱼苗苗种。
28、本专利技术公开了以下技术效果:
29、本专利技术提供了一种快速鉴定松浦鲤的分子标记组合、相应的引物及其鉴定方法,并通过检测所述分子标记组合,能够快速、准确、批量化地在苗种期和亲本期鉴定和筛选松浦鲤苗种和亲本,尤其适用于小规格鱼苗的品种鉴定,解决外观相似品种难以区分的问题,提高引种育种质量,保证养殖户和消费者的利益,具有广阔的应用前景。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种鉴定松浦鲤的SNP分子标记组合,其特征在于,包括位于鲤基因组上的4个SNP位点SNP1-SNP4;
2.一种扩增权利要求1所述的SNP分子标记组合的引物组,其特征在于,包括序列如下所示的引物:
3.如权利要求2所述的引物组在制备鉴定松浦鲤的试剂盒中的应用。
4.一种鉴定松浦鲤的试剂盒,其特征在于,包含权利要求2所述的引物组。
5.如权利要求1所述的SNP分子标记组合、权利要求2所述的引物组或权利要求4所述的试剂盒在以下任一项中的应用:
6.如权利要求3或权利要求5所述的应用,其特征在于,所述鉴定松浦鲤为在松浦鲤、建鲤、黄河鲤和呆鲤4种外观相似的鲤鱼中确定待测鲤是否为松浦鲤。
7.一种鉴定松浦鲤的方法,其特征在于,包括以下步骤:
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述鉴定松浦鲤为在松浦鲤、建鲤、黄河鲤和呆鲤4种外观相似的鲤鱼中确定待测鲤是否为松浦鲤。
9.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述判定的标准为,仅在所述基因分型的结果表现为SNP1位点基因型为AA、SNP2位点
10.一种筛选鲤鱼苗苗种的方法,其特征在于,包括以下步骤:
...【技术特征摘要】
1.一种鉴定松浦鲤的snp分子标记组合,其特征在于,包括位于鲤基因组上的4个snp位点snp1-snp4;
2.一种扩增权利要求1所述的snp分子标记组合的引物组,其特征在于,包括序列如下所示的引物:
3.如权利要求2所述的引物组在制备鉴定松浦鲤的试剂盒中的应用。
4.一种鉴定松浦鲤的试剂盒,其特征在于,包含权利要求2所述的引物组。
5.如权利要求1所述的snp分子标记组合、权利要求2所述的引物组或权利要求4所述的试剂盒在以下任一项中的应用:
6.如权利要求3或权利要求5所述的应用,其特征在于,所述鉴定松浦鲤为在松...
【专利技术属性】
技术研发人员:张瀚元,李炯棠,王琦,赵然,侯明喜,曹逸铭,
申请(专利权)人:中国水产科学研究院,
类型:发明
国别省市:
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