【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及疾病疗效预测装置领域，尤其涉及一种基于单细胞转录组技术的肿瘤免疫治疗疗效预测装置。
技术介绍
1、研究显示，具有不同免疫微环境细胞类型构成特征的患者对同一种治疗方案往往具有不同的反应。目前肿瘤治疗疗效预测可以分为两类，一类是基于块转录数据的，一类是基于单细胞数据的。基于块转录组数据的方法可以进一步分为两类，一类是基于基因标志物表达量的，一类是基于反卷积算法的从块数据中推测细胞构成。基于块转录组数据的方法受到基因标志物细胞类型特异性的影响，因此不能十分精准地估计细胞类型构成特征。单细胞rna测序(scrna-seq)在帮助人们理解不同类型细胞对免疫疗法的响应方面取得了显著进展。因此，基于单细胞数据构建的模型应该会有助于提高疗效预测的可靠性。目前已有的研究都是基于治疗前已知细胞亚型的比例特征或者已知的免疫因子特征。
2、目前的方法都是基于已有的先验知识，如何充分利用单细胞转录组数据中大量的隐藏信息构建更加可靠的免疫治疗预测模型是一个仍待解决的问题。
3、因此，本领域的技术人员致力于开发一种更准确预测肿瘤...
【技术保护点】
1.一种基于单细胞转录组技术的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，包括单细胞数据获取装置和处理装置，所述单细胞数据获取装置用于获取免疫治疗前后的单细胞数据，处理装置用于进行数据分析，进行肿瘤免疫治疗疗效预测，所述单细胞数据是指单细胞转录表达矩阵，其中每一行代表一个基因，每一列代表一个细胞。
2.如权利要求1所述的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，所述免疫治疗前后的单细胞数据包括治疗前的数据和治疗后的数据，所述治疗后的数据分别来自于病理判定为免疫治疗响应的患者和不响应的患者。
3.如权利要求2所述的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，所述...
【技术特征摘要】
1.一种基于单细胞转录组技术的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，包括单细胞数据获取装置和处理装置，所述单细胞数据获取装置用于获取免疫治疗前后的单细胞数据，处理装置用于进行数据分析，进行肿瘤免疫治疗疗效预测，所述单细胞数据是指单细胞转录表达矩阵，其中每一行代表一个基因，每一列代表一个细胞。
2.如权利要求1所述的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，所述免疫治疗前后的单细胞数据包括治疗前的数据和治疗后的数据，所述治疗后的数据分别来自于病理判定为免疫治疗响应的患者和不响应的患者。
3.如权利要求2所述的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，所述处理装置首先对单细胞数据获取装置获取的单细胞数据进行处理，使用ogfsc工具包去掉噪声污染基因。
4.如权利要求3所述的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，进行治疗疗效预测前，所述处理装置对单细胞数据获取装置获取的所有单细胞数据一起进行主成分分析降维，保留前5个主成分。
5.如权利要求4所述的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于，所述处理装置分别比较治疗前和治疗后响应的样本数据，以及治疗前和治疗后不响应的样本数据，用于进行肿瘤免疫治疗疗效预测。
6.如权利要求5所述的肿瘤免疫治疗疗效预测装置，其特征在于...
【专利技术属性】
技术研发人员：曹静琪，
申请(专利权)人：上海谷艾生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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