一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选及应用制造技术

技术编号:42061343 阅读:28 留言:0更新日期:2024-07-19 16:46
本发明专利技术涉及一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选及应用,包括高通量测序、SSR序列的筛选与鉴定、SSR引物的设计及合成、引物的筛选和引物在台湾白甲鱼放流亲本种群中的遗传多样性分析等步骤;属于鱼类育种、分子标记技术和增殖放流效果评估领域,本发明专利技术利用高通量随机测序的方法对台湾白甲鱼进行了微卫星标记挖掘,并利用多态微卫星标记对一个台湾白甲鱼亲鱼群体进行种群遗传学特征评价,以期为台湾白甲鱼的分子辅助育种提供帮助,为培育优质、高产、抗逆、抗病的台湾白甲鱼优良品种奠定基础。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于鱼类育种、分子标记技术和增殖放流效果评估领域,具体涉及一种台湾白甲鱼微卫星标记引物筛选和应用。


技术介绍

1、台湾白甲鱼(onychostoma barbatulus)又名台湾铲颌鱼,俗称苦花、鲴鱼、苦偎、齐头偎,广泛分布于长江、珠江、九龙江、闽江、韩江和台湾各河流上游和支流,浙江主要分布于钱塘江、瓯江、灵江、飞云江等水系,尤其浙西南山区较为多见。台湾白甲鱼属溪流性鱼类,栖息于水系上游水质清冷的大溪和高山峡谷的山涧中,有的生活于海拔千米以上的高山的山涧中,是浙江淡水鱼类生态分布海拔最高的鱼类。该鱼肉质细嫩、鲜美、营养丰富、肌间刺少,颇受消费者喜爱,在浙南地区市场销售价格一般在200元/kg左右。

2、微卫星dna又称为简单序列重复(simple sequence repeats,ssr)或短串联重复序列(short tandem repeats,str),一般由1~6 bp 的核心重复单位和重复区域两端的保守序列两部分组成,不同的重复数目和重复位置是形成微卫星位点多态性的基础,微卫星分子标记其诸多优点和巨大的应用前景,被广泛应用于本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

3.根据权利要求2所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

4.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

5.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

6.根据权利要求4所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于,步骤S4对所有设计得到的引物进行筛选,...

【技术特征摘要】

1.一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

3.根据权利要求2所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

4.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

5.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于:

6.根据权利要求4所述的一种基于高通量测序的台湾白甲鱼微卫星引物筛选,其特征在于,步骤s4对所有设计得到的引物进行筛选,筛选标准如下...

【专利技术属性】
技术研发人员:练青平郭爱环盛鹏程原居林陈伟陈欢孟周武瑞陈光美
申请(专利权)人:浙江省淡水水产研究所
类型:发明
国别省市:

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