肠道微生物样本中蛋白质乳酸化修饰的数据非依赖性检测方法技术

技术编号:42003168 阅读:16 留言:0更新日期:2024-07-12 12:25
本发明专利技术提供了一种肠道微生物样本中蛋白质乳酸化修饰的数据非依赖性检测方法,首先选择了合适的糖酚抽液抽提肠道微生物样本中的蛋白,再经酶解,富集乳酸化肽段,再通过离子淌度质谱仪进行4D‑DIA检测,并通过乳酸化谱图库进行乳酸化肽段的鉴定,提高了定量的灵敏度和准确性,实现更大的定量动态范围、更高的鉴定重复性,极大地提升检测的灵敏度和深度。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于肽段富集,涉及一种用于肠道微生物样本中蛋白质乳酸化修饰的数据非依赖性检测方法


技术介绍

1、乳酸长期以来被认为是一种代谢废物,但是近年来的研究表明它不仅可以被肿瘤组织再利用提供能量,还能作为修饰底物介导发生组蛋白赖氨酸乳酸化。在人类hela细胞和小鼠骨髓来源的巨噬细胞(bmdms)中的核心组蛋白如h3、h4、h2a和h2b上鉴定到28个赖氨酸乳酸化(kla)位点。从小鼠的黑色素瘤及肺癌组织中分离得到的致癌型的m2型巨噬细胞与乳酸化水平显著正相关,暗示巨噬细胞中高乳酸和高组蛋白乳酸化水平可能有助于肿瘤的形成和恶性进展。但由于乳酸化修饰自身的复杂性,且依赖于传统乳酸化定量技术以及较低采集速度、灵敏度的质谱仪通常存在鉴定深度有限和重复性低的问题。因此如何提高乳酸化修饰的鉴定深度是目前亟待解决的问题。

2、在蛋白提取方法方面,目前对于肠道微生物样本中蛋白的提取,大多数采用的是sds提取的方法,该方法虽然操作简单,但会存在乳酸化修饰蛋白提取率低,最终乳酸化鉴定深度偏低,从而导致一些丰度较低的乳酸化修饰蛋白无法提取出来,已不能满足目前对于乳本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种肠道微生物样本中乳酸化修饰肽段的数据非依赖性检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述糖酚抽液,含蔗糖浓度为1.0M。

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述糖酚抽液包括1M蔗糖、1%Triton X100和抑制剂,所述抑制剂包括烟酰胺和曲古抑菌素A。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述抑制剂包括50mM的烟酰胺和3uM的曲古抑菌素A。

5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述糖酚抽提液包括1%的抑制剂。

6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(...

【技术特征摘要】

1.一种肠道微生物样本中乳酸化修饰肽段的数据非依赖性检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述糖酚抽液,含蔗糖浓度为1.0m。

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述糖酚抽液包括1m蔗糖、1%triton x100和抑制剂,所述抑制剂包括烟酰胺和曲古抑菌素a。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述抑制剂包括50mm的烟酰胺和3um的曲古抑菌素a。

5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述糖酚抽提液包括1%的抑制剂。

6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(3)所述4d-dia检测包括m...

【专利技术属性】
技术研发人员:程仲毅朱俊易亚雄金鑫戚鲁豫
申请(专利权)人:杭州景杰生物科技股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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