蛋白质主链结构生成方法、装置、电子设备和存储介质制造方法及图纸

技术编号:41966413 阅读:19 留言:0更新日期:2024-07-10 16:48
本发明专利技术涉及计算机技术领域,提供一种蛋白质主链结构生成方法、装置、电子设备和存储介质,其中方法包括:确定待处理蛋白质主链结构中的已知蛋白质结构;基于自编码器的编码模块,对所述已知蛋白质结构进行编码,得到前部残基的残差表示位置;基于语言模型和所述前部残基的残差表示位置,预测所述前部残基的后续残基的残差表示位置;基于所述自编码器的解码模块,所述前部残基的残差表示位置以及所述后续残基的残差表示位置,确定所述待处理蛋白质主链结构的重构主链结构。本发明专利技术提供的蛋白质主链结构生成方法、装置、电子设备和存储介质,能够提高蛋白质主链结构的生成效率和质量。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及计算机,尤其涉及一种蛋白质主链结构生成方法、装置、电子设备和存储介质


技术介绍

1、蛋白质主链生成任务目的是生成具有可设计性且多样的蛋白质主链结构模型。现有的蛋白质主链生成方法包括基于统计能量模型方法和基于深度学习的方法。

2、基于统计能量模型的方法其统计能量函数由于受限于机器学习方法自身建模准确率,且建模目标由于依赖专家知识以及样本数量,因此无法对高阶特征进行建模;现有的大部分深度学习模型架构复杂度较高或训练难度较高,且生成的蛋白质主链结构过于规整,即倾向于生成包含大量二级结构组成的单一结构域,导致蛋白质主链结构生成效率和质量都较低。


技术实现思路

1、本专利技术提供一种蛋白质主链结构生成方法、装置、电子设备和存储介质,用以解决现有技术中蛋白质主链结构生成效率和质量都较低的缺陷。

2、本专利技术提供一种蛋白质主链结构生成方法,包括:

3、确定待处理蛋白质主链结构中的已知蛋白质结构;

4、基于自编码器的编码模块,对所述已知蛋白质结构进行编码,得到本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,所述基于自编码器的编码模块,对所述已知蛋白质结构进行编码,得到前部残基的残差表示位置,包括:

3.根据权利要求2所述的蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,所述自编码器的模型损失函数基于解码损失函数和/或残差离散编码损失函数确定;

4.根据权利要求1所述的蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,所述基于语言模型和所述前部残基的残差表示位置,预测所述前部残基的后续残基的残差表示位置,包括:

5.根据权利要求4所述的蛋白质主链结构生成方法,...

【技术特征摘要】

1.一种蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,所述基于自编码器的编码模块,对所述已知蛋白质结构进行编码,得到前部残基的残差表示位置,包括:

3.根据权利要求2所述的蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,所述自编码器的模型损失函数基于解码损失函数和/或残差离散编码损失函数确定;

4.根据权利要求1所述的蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,所述基于语言模型和所述前部残基的残差表示位置,预测所述前部残基的后续残基的残差表示位置,包括:

5.根据权利要求4所述的蛋白质主链结构生成方法,其特征在于,所述基于所述语言模型的序列生成模块和所述前部残基的残差表示位置,预测所...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈凌辉刘宇枫徐景明
申请(专利权)人:安徽元构生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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