【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，具体而言，涉及一种高通量筛选核酸适配体的方法。
技术介绍
1、核酸适配体(aptamer)是指通过指数富集的配体系统进化技术(selex)筛选分离得到的dna或者rna分子，具有特定和复杂的三维形状，其特征是茎、环、凸起、发夹、假结、三倍体或四倍体。基于其三维结构，这些分子可以以高亲和力和特异性与多种靶分子结合，如蛋白质、肽、核苷酸、抗生素、毒素和小分子。从单个分子到复杂的目标混合物或整个生物体。适配体与靶标的结合是由于结构相容性、芳香环的堆叠、静电和范德华相互作用以及氢键作用，或这些效应的组合。与传统抗体相比，核酸适体具有体积小、稳定性高、易化学修饰、低免疫性、高亲和性、高特异性等优点，因此在生物成像，环境监测，临床诊断，新药合成等方面展示广阔的前景。
2、随着生物技术的发展，尤其是高通量测序技术的进步，为核酸适配体筛选提供了新的手段。借助高通量测序技术，我们可以获得筛选过程中得到的每一轮次级文库的序列信息，快速评估序列富集程度；同时，高通量测序以其高输出量与高解析度的特性，不仅为我们提供了丰富的遗传学...
【技术保护点】
1.一种高通量筛选核酸适配体的方法，其特征在于，从富集文库筛选核酸适配体时，同时从核酸适配体与靶标蛋白的亲和力和特异性两方面进行筛选；
2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，包括以下步骤：
3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，步骤(2)为：针对次级文库，进行二次筛选，高通量测序，建立三级文库；将三级文库与次级文库进行匹配，删除出错序列，作为目标文库，从核酸适配体与靶标蛋白的亲和力和特异性两方面筛选核酸适配体。
4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，所述同时从核酸适配体与靶标蛋白的亲和力和特异性两方面进行筛选的方法通过归一化计
【技术特征摘要】
1.一种高通量筛选核酸适配体的方法，其特征在于，从富集文库筛选核酸适配体时，同时从核酸适配体与靶标蛋白的亲和力和特异性两方面进行筛选；
2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，包括以下步骤：
3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，步骤(2)为：针对次级文库，进行二次筛选，高通量测序，建立三级文库；将三级文库与次级文库进行匹配，删除出错序列，作为目标文库，从核酸适配体与靶标蛋白的亲和力和特异性两方面筛选核酸适配体。
4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，所述同时从核酸适配体与靶标蛋白的亲和力和特异性两方面进行筛选的方法通过归一化计算相对丰度获得。
5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述归一化计算公式为：
6.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述一次筛选包括多轮筛选，所述多轮筛选的次数根据cq值确定，当cq值较前一轮筛选降低时，一次筛选结束，次级文库富集成功。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述一次筛选、二次筛选为selex筛选。
8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，次级文库的制备包含两条技术路线：
9.一种同时检测核酸适配体的亲和力和特异性的方法，其特征在于，核酸适配体的亲和力和特异性通过归一化计算相对丰度获得，所述归一化计算公式为：
10.一种用于高通量筛选核酸适配体的系统，其特征在于，所述系统包括富集文库、数据分析模块；所述数据分析模块从富集文库筛选核酸适配体，同时从核酸适配体与靶标蛋白的亲和力和特异性两方面进行筛...
【专利技术属性】
技术研发人员：谭蔚泓，吕少康，罗昭锋，刁寒，徐晶，吴金梦，张峥，张翔，
申请(专利权)人：中国科学院杭州医学研究所，
类型：发明
国别省市：
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