一种环状RNA在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法技术

技术编号:41880807 阅读:26 留言:0更新日期:2024-07-02 00:34
本发明专利技术公开的是一种环状RNA在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,设计4种目的片段,将上述4种目的片段分别连接至II型内含子D1和D6之间,得到4种环状RNA的编码DNA序列,插入T7启动子序列,得到4种环状RNA的编码DNA分子,将四种片段分别插入到pET28a载体的XhoI及BglII位点之间,得到的重组质粒,转化至感受态细胞中,经筛选培养诱导后,利用酚/氯仿进行裂解抽提,得到目的RNA粗提物,本发明专利技术具有可灵活、高效地生产多种片段长度及不同序列的环状RNA,且生产的环状RNA具有与体外合成环状RNA相当的荧光表达能力等技术特点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种rna在的设计及制备方法,更具体一点说,涉及一种环状rna在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,属于生物基因工程领域。


技术介绍

1、环状rna是一种不暴露末端碱基且完全闭环的rna分子与线性rna相比,环状rna分子具有更高的稳定性和细胞内半衰期,无论在rna疫苗领域和rnai药物领域都具有巨大的应用潜力。目前环状rna多以体外方式合成,存在大规模生产纯化成本高,操作繁琐,且较易引发免疫原性等诸多问题从而限制了环状rna的大规模应用,因此体内合成环状rna的策略得到了广泛关注。

2、目前,体内合成环状rna方法是将核酶作为环化元件,以细胞和大肠杆菌为载体,通过体内转录的方式大量表达目的环状rna,该方法仅需简单的rna提取及纯化步骤即可实现环状rna富集。与体外合成相比,体内合成环状rna具有操作简便、生产纯化成本低、可大规模生产等优点。目前常用的体内合成方法一般是使用i型内含子或alu序列作为环化元件,这些元件只能对特定环状rna进行环化,无法实现对任意环状rna序列的环化,同时还会引入一小段非预期序列,导致最终制备的环本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种环状RNA在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,其特征在于,所述环状RNA包括四种目的片段:c1700、c1400、c500、c64,其中,c1700的片段为随机序列;c1400的片段被设计用于荧光检测,首先将IRES序列分为两段,反向拼接于GFP序列两端,生成一个ES-GFP-IR的序列;c500的片段是从IRES序列中选取;c64的环状序列是由一个23bp的双链和两端各9bp的茎环组成。

2.根据权利要求1所述的一种环状RNA在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,其特征在于该方法包括如下步骤:

3.根据权利要求2所述的一种环状RNA在大肠杆菌体内精...

【技术特征摘要】

1.一种环状rna在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,其特征在于,所述环状rna包括四种目的片段:c1700、c1400、c500、c64,其中,c1700的片段为随机序列;c1400的片段被设计用于荧光检测,首先将ires序列分为两段,反向拼接于gfp序列两端,生成一个es-gfp-ir的序列;c500的片段是从ires序列中选取;c64的环状序列是由一个23bp的双链和两端各9bp的茎环组成。

2.根据权利要求1所述的一种环状rna在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,其特征在于该方法包括如下步骤:

3.根据权利要求2所述的一种环状rna在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,其特征在于:将目的rna粗提物经licl纯化后,能够通过rnase r、rt-pcr、荧光表达检测实现检测目的rna是否环化。

4.根据权利要求2或3所述的一种环状rna在大肠杆菌体内精确合成的设计及制备方法,其特征在于:步骤4)具体为:将四种重组质粒转化进入大肠杆菌ht115(de3),并将转入了pet-28a原始质粒的菌作为对照组,在含0.1mg/ml硫酸卡那霉素的液体lb培养基中...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵夏阳吕崇润金伟波
申请(专利权)人:浙江理工大学绍兴生物医药研究院有限公司
类型:发明
国别省市:

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