一种AML患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法技术

本发明专利技术涉及生物信息技术领域，公开了一种AML患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，包括：基于收集的PCD相关基因，通过单因素Cox回归分析，确定PCD相关预后基因，构建训练队列TCGA‑AML；结合多种机器学习算法进行随机组合，得到多种不同组合方式的整合算法，基于训练队列TCGA‑AML拟合预测模型，采用GSE106291、GSE146173和BeatAML三个验证集验证预测模型，并计算三个验证集的一致性指数C‑index，反映每种整合算法下预测模型的判别能力；选取C‑index平均值较高且包含PCD相关预后基因数目最少的一个预测模型，作为最佳的程序性细胞死亡相关预后模型，预测每个AML患者的PCD‑index。本发明专利技术应用多种生物信息学和机器学习算法构建预后模型，在肿瘤患者预后预测和靶向药物设计过程中具有重要价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息，特别是涉及一种aml患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法。

技术介绍

1、急性骨髓性白血病（acute myeloid leukemia，aml）是由髓细胞异常增殖和分化引起的一种异质性造血肿瘤。由于细胞遗传学和分子异常的范围很广，急性髓性白血病有不同的亚型。化疗一直是急性髓细胞性白血病的标准治疗方法，但10%-40%的新诊断急性髓细胞性白血病患者无法通过强化化疗获得完全缓解（cr），约50%获得缓解的急性髓细胞性白血病患者会在初始治疗后2-3年内复发。近年来，随着基础研究，尤其是大规模基因组分析，促进了aml诊断、风险分层和靶向治疗的发展。近年来，fda（美国食品和药物管理局）已批准吉特替尼用于r/rflt3突变的aml，伊伐替尼和恩那替尼分别用于r/ridh1和idh2突变的aml，这些抑制剂在一线治疗中已显示出良好的临床疗效。然而，现有的急性髓细胞性白血病标志物远不能满足临床需求，迫切需要进一步研究急性髓细胞性白血病的潜在生物标志物，将更多的预后因素纳入临床指南，从而改进风险分层模型，探索急性髓细胞性白血病靶向治疗的疗效和潜本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种AML患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的AML患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，所述收集PCD相关基因，具体包括：

3.根据权利要求1所述的AML患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，所述PCD相关基因，包括：

4.根据权利要求1所述的AML患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，所述基于收集的PCD相关基因，通过单因素Cox回归分析，确定PCD相关预后基因，构建训练队列TCGA-AML，包括：

5.根据权利要求1所述的AML患者程...

【技术特征摘要】

1.一种aml患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的aml患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，所述收集pcd相关基因，具体包括：

3.根据权利要求1所述的aml患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，所述pcd相关基因，包括：

4.根据权利要求1所述的aml患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，所述基于收集的pcd相关基因，通过单因素cox回归分析，确定pcd相关预后基因，构建训练队列tcga-aml，包括：

5.根据权利要求1所述的aml患者程序性细胞死亡相关预后模型构建方法，其特征在于，所述结合多种机器学习算法进行随机组合，...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘松柏，鲍协炳，陈苏宁，邱博闻，花京剩，杜佳慧，陈瑶，
申请(专利权)人：苏州卫生职业技术学院，
类型：发明
国别省市：