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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及医疗信息学领域,特别涉及用于辅助诊断甲状腺恶性肿瘤和良性肿瘤的数据处理装置。
技术介绍
1、甲状腺癌为一种常见的内分泌系统恶性肿瘤,可分为甲状腺乳头状癌、滤泡性甲状腺癌、未分化甲状腺癌和髓样癌。其中乳头状癌(papillary thyroid cancer,ptc)最为常见,占所有甲状腺恶性肿瘤的90%以上[xing,mingzhao;haugen,bryan r;schlumberger,martin(2013).progress in molecular-based management ofdifferentiated thyroid cancer.the lancet,381(9871),1058–1069.]。根据统计,成年人甲状腺结节的患病率约为5-10%,其中60岁以上的人群最为严重,可高达50-70%[guths,theune u,aberle j,et al.very high prevalence of thyroid nodules detected byhigh frequency(13mhz)ultrasound examination.eur j clin invest 2009;39:699-706.]。影像学检查是一种比较普遍的甲状腺诊断方法,该方法大多依靠医生经验判断,存在一定的结果误差,而且影像学对人身体有一定的辐射伤害。细针穿刺活检也是一种临床上常见的甲状腺癌诊断技术,该方法根据穿刺物的细胞学形态对结节的良恶性进行评估。因为甲状腺良恶性肿瘤的细胞学特征经常发生重叠,所以约有10
2、表观遗传学为一种不涉及dna序列改变但可遗传的基因表达调控方式,而且能够遗传给下一代[nicoglou a,merlin f.epigenetics:a way to bridge the gap betweenbiological fields.stud hist philos biol biomed sci.2017;66:73-82]。dna甲基化是表观遗传调控的重要方式之一,是指在dna甲基化转移酶的作用下,在基因组cpg二核苷酸的胞嘧啶5’碳位共价键结合一个甲基基团[bird a.perceptions ofepigenetics.nature.2007;447:396-398]。大量的研究表明,dna甲基化能引起染色质结构、dna构象、dna稳定性及dna与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制了基因表达[mooreld,le t,fan g.dna methylation and its basic function.neuropsychopharmacology.2013;38:23-38]。
3、dna甲基化标志物为现阶段最佳的肿瘤体外早诊分子标志物,目前临床上关于甲状腺癌诊断标志物的灵敏度和特异性很有限,尤其是缺乏早期诊断的标志物,因此更为敏感、特异的早期分子标记物亟待发掘。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供用于辅助诊断甲状腺恶性肿瘤和良性肿瘤的数据处理装置。
2、第一方面,本专利技术要求保护一种用于辅助区分a类型样本和b类型样本的数据处理装置。
3、本专利技术要求保护的用于辅助区分a类型样本和b类型样本的数据处理装置包括单元x和单元y;
4、所述单元x用于建立数学模型,包括数据采集模块、数据分析处理模块和模型输出模块;
5、所述数据采集模块被配置为采集n1个所述a类型样本和n2个所述b类型样本的mreg基因甲基化水平数据;
6、其中,n1和n2均可为10以上正整数,如100以上。
7、所述数据分析处理模块被配置为接收来自于所述数据采集模块的所述n1个所述a类型样本和n2个所述b类型样本的mreg基因甲基化水平数据,按照a类型和b类型的分类方式,通过二分类逻辑回归法建立数学模型,确定分类判定的阈值;
8、在本专利技术的具体实施方式中,所述阈值设为0.5。大于0.5归为一类,小于0.5归为另外一类,等于0.5作为不确定的灰区。其中a类型和b类型为相对应的两分类,二分类的分组,哪一组是a类型,哪一组是b类型,要根据具体的数学模型来确定,无需约定。
9、在实际应用中,所述阈值也可根据最大约登指数确定(具体可为最大约登指数对应的数值)。大于阈值归为一类,小于阈值归为另外一类,等于阈值作为不确定的灰区。其中a类型和b类型为相对应的两分类,二分类的分组,哪一组a类型,哪一组是b类型,要根据具体的数学模型来确定,无需约定。
10、所述模型输出模块被配置为接收来自于所述数据分析处理模块建立的所述数学模型,并进行输出;
11、所述单元y用于确定待测样本类型,包括数据输入模块、数据运算模块、数据比较模块和结论输出模块;
12、所述数据输入模块被配置为输入待测者的mreg基因甲基化水平数据;
13、所述数据运算模块被配置为接收来自于所述数据输入模块的所述待测者的mreg基因甲基化水平数据,并将所述待测者的mreg基因甲基化水平数据代入所述单元x中的所述数据分析处理模块建立的所述数学模型,计算得到检测指数;
14、所述数据比较模块被配置为接收来自于所述数据运算模块计算得到的检测指数,并将所述检测指数与所述单元x中的所述数据分析处理模块中确定的所述阈值进行比较;
15、所述结论输出模块被配置为接收来自于所述数据比较模块的比较结果,并根据所述比较结果输出所述待测样本的类型是a类型还是b类型的结论。
16、所述a类型样本和所述b类型样本为如下任一种:
17、(c1)甲状腺良性肿瘤和甲状腺恶性肿瘤;
18、(c2)甲状腺良性肿瘤和不同亚型的甲状腺恶性肿瘤;
19、(c3)甲状腺良性肿瘤和不同分期的甲状腺恶性肿瘤;
20、(c4)不同亚型的甲状腺恶性肿瘤;<本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于辅助区分A类型样本和B类型样本的数据处理装置,所述A类型样本和所述B类型样本为如下任一种:
2.一种系统,包括:
3.一种计算机可读存储介质,其特征在于:所述计算机可读存储介质存储有用于执行下述步骤的计算机程序:
4.根据权利要求1所述的数据处理装置或权利要求2所述的系统或权利要求3所述的计算机可读存储介质,其特征在于:
5.根据权利要求2或4所述的系统,其特征在于:所述用于检测MREG基因甲基化水平的试剂包含用于扩增MREG基因全长或部分片段的引物组合;
6.甲基化MREG基因作为标志物在制备产品中的应用;所述产品的用途为如下中的至少一种:
7.用于检测MREG基因甲基化水平的物质在制备产品中的应用;所述产品的用途为如下中的至少一种:
8.用于检测MREG基因甲基化水平的物质和储存有数学模型建立方法和/或使用方法的介质在制备产品中的应用;所述产品的用途为如下中的至少一种:
9.储存有数学模型建立方法和/或使用方法的介质在制备产品中的应用;所述产品的用途为如下中的至少一种:
10.根据权利要求6-9中任一所述的应用,其特征在于:所述MREG基因甲基化水平为MREG基因中如下(E1)-(E4)所示片段中全部或部分CpG位点的甲基化水平;
...【技术特征摘要】
1.一种用于辅助区分a类型样本和b类型样本的数据处理装置,所述a类型样本和所述b类型样本为如下任一种:
2.一种系统,包括:
3.一种计算机可读存储介质,其特征在于:所述计算机可读存储介质存储有用于执行下述步骤的计算机程序:
4.根据权利要求1所述的数据处理装置或权利要求2所述的系统或权利要求3所述的计算机可读存储介质,其特征在于:
5.根据权利要求2或4所述的系统,其特征在于:所述用于检测mreg基因甲基化水平的试剂包含用于扩增mreg基因全长或部分片段的引物组合;
6.甲基化mreg基因作为标志物在制备产品中的应用;...
【专利技术属性】
技术研发人员:张筝,狄飞飞,
申请(专利权)人:腾辰生物科技上海有限公司,
类型:发明
国别省市:
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