基于混合积的手性构型表示方法技术

技术编号:41565650 阅读:21 留言:0更新日期:2024-06-06 23:47
本发明专利技术公开了基于混合积的手性构型表示方法,涉及化学技术领域,包括以下步骤:基于开源化学信息学数据库获取目标分子内所有不对称原子的列表cAtoms;遍历列表cAtoms内所有的不对称原子,计算得到其手性积与手性矩阵;遍历目标分子,根据专利“基于子结构搜索与阻转判别的手性轴寻找算法”,寻找所述目标分子所包含的手性轴;对所得手性轴,计算其手性积与手性矩阵;所得到的与分子内不对称原子与手性轴所一一对应的手性矩阵与手性积,基于手性矩阵与手性积表征所述目标分子手性信息的局部表征;实现对原子手性的表征,更填补了轴手性构型表征这一空白。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及化学,具体涉及基于混合积的手性构型表示方法


技术介绍

1、计算机技术与化学的交叉融合正推动着化学领域的变革。欲通过人工智能等手段分析化学分子,需以将化学分子用机器能识别的方式进行表征。因此,化学分子的计算机表征是计算机技术能应用于分子科学的基础。

2、目前已有不少对于化学分子的表征方法。如2022年daniel s.weigh等人在“areview of molecular representation in the age of machine learning”一文中总结的,现在常用的表征方法有smiles码、ecfp分子指纹、分子连接表(mdl)等。同时,目前也有基于机器学习的方法对分子进行表征,如2022年connor w.coley等人在“learning 3drepresentations of molecular chirality with invariance to bond rotations”中通过神经网络模型进行了原子手性的表征。

3、然而,现有的全局表征方法虽能描述分子的部分重要信息,却并非本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.基于混合积的手性构型表示方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于混合积的手性构型表示方法,其特征在于:基于开源化学信息学数据库识别分子中的手性中心并返回其相关信息的方法查找手性中心,并遍历返回的结果来打印每个手性中心的原子索引和手性标签;

3.根据权利要求1所述的基于混合积的手性构型表示方法,其特征在于:所述步骤S2中计算手性积与手性矩阵的步骤包括:

4.根据权利要求1所述的基于混合积的手性构型表示方法,其特征在于:寻找所述目标分子所包含的手性轴包括以下步骤:

5.根据权利要求4所述的基于混合积的手性构型表示方法,...

【技术特征摘要】

1.基于混合积的手性构型表示方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于混合积的手性构型表示方法,其特征在于:基于开源化学信息学数据库识别分子中的手性中心并返回其相关信息的方法查找手性中心,并遍历返回的结果来打印每个手性中心的原子索引和手性标签;

3.根据权利要求1所述的基于混合积的手性构型表示方法,其特征在于:所述步骤s2中计算手性积与手性矩阵的步骤包括:

4.根据权利要求1所述的基于混合积的手性构型表示方法,...

【专利技术属性】
技术研发人员:张驰石润晗余谷风杨旸
申请(专利权)人:上海交通大学
类型:发明
国别省市:

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