一种蛋白质-DNA-RNA三联体及其功能的计算机预测方法及系统技术方案

本申请实施例提供了一种蛋白质‑DNA‑RNA三联体及其功能的计算机预测方法及系统，属于生物技术领域。该方案从目标细胞系中获取目标细胞；获取目标细胞的DNA‑RNA相互作用数据；获取目标细胞的蛋白质‑DNA相互作用数据；获取目标细胞的蛋白质‑RNA相互作用数据；对目标细胞的DNA‑RNA相互作用数据进行处理，得到目标细胞的DNA‑RNA相互作用分数、蛋白质‑DNA‑RNA相互作用评分、蛋白质‑DNA‑RNA三联体的预测结果；根据预测结果，得到蛋白质‑DNA‑RNA三联体互作的调控下游靶基因的功能信息。本发明专利技术能够探索DNA、RNA与蛋白质互作在细胞中的功能与作用，提供一种新型的相互作用组数据。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及生物，尤其涉及一种蛋白质-dna-rna三联体及其功能的计算机预测方法及系统。

技术介绍

1、核酸结合蛋白在许多疾病发生发展中发挥着不容忽视的作用。数十年来，dna结合蛋白和rna结合蛋白作为两种不同的蛋白质被分别研究，但越来越多的证据表明，这些蛋白质可能包括可以同时与dna和rna结合的dna和rna双重结合蛋白(dna and rna bindingprotein，drbp)，完成复杂的基因调控功能。然而，尚无有效的方法在整体层面检测细胞内源性蛋白质-dna-rna相互作用，drbp在复杂疾病的发生发展过程中的作用目前仍知之甚少。

技术实现思路

1、本申请实施例的主要目的在于提供一种蛋白质-dna-rna三联体及其功能的计算机预测方法及系统。

2、本专利技术所采取的技术方案是：

3、一方面，本专利技术实施例提供了一种蛋白质-dna-rna三联体及其功能的计算机预测方法，包括以下步骤：

4、从目标细胞系中获取目标细胞；所述目标细胞系是一组经过培养和筛选的细胞；<本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蛋白质-DNA-RNA三联体及其功能的计算机预测方法，其特征在于，所述方法包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取所述目标细胞的DNA-RNA相互作用数据，包括：

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述DNA-RNA相互作用分数、所述蛋白质-DNA相互作用数据和所述蛋白质-RNA相互作用数据，得到蛋白质-DNA-RNA相互作用评分，包括：

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述根据所述DNA-RNA杂交片段中的蛋白质结合位点进行计算，得到保守性得分，包括：

5.根据权利要求3所述的方法，其特...

【技术特征摘要】

1.一种蛋白质-dna-rna三联体及其功能的计算机预测方法，其特征在于，所述方法包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取所述目标细胞的dna-rna相互作用数据，包括：

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述dna-rna相互作用分数、所述蛋白质-dna相互作用数据和所述蛋白质-rna相互作用数据，得到蛋白质-dna-rna相互作用评分，包括：

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述根据所述dna-rna杂交片段中的蛋白质结合位点进行计算，得到保守性得分，包括：

5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述对所述保守性得分进行筛选，得到蛋白质-dna-rna相互作用的置信水平得分，所使用的公式包括：

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：覃静，梁誉允，梁伟德，胡耀华，邓文斌，
申请(专利权)人：中山大学·深圳，
类型：发明
国别省市：