一种用于带叶兜兰物种鉴定的CAPS分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于带叶兜兰物种鉴定的CAPS分子标记及其应用。本发明专利技术通过对已发表的兜兰遗传图谱中带叶兜兰和同色兜兰的转录组序列进行分析比对，得到用于区分鉴定带叶兜兰与其他物种兜兰物种的SNP位点，基于该SNP位点，本发明专利技术开发了区分鉴定带叶兜兰和兜兰属其它物种的SNP‑CAPS分子标记以及检测分子标记的引物对。利用本发明专利技术提供的分子标记引物可实现对带叶兜兰的快速、准确检测鉴定，与现有技术中只有在开花的时候才能进行物种区分的方法相比，本发明专利技术提供的鉴定方法更加准确有效，为区分带叶兜兰与兜兰属其他物种提供了可靠的检测方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因工程领域，具体涉及一种用于带叶兜兰物种鉴定的caps分子标记及其应用。

技术介绍

1、兜兰(paphiopedilum spp.)为兰科(orchidaceae)兜兰属植物，花形奇特，具有极高的观赏价值。兜兰拥有丰富的表型性状，属于奇花异草。随着我国经济的发展，兜兰越来越受到各国兰花爱好者的喜爱，拥有广阔的市场前景。

2、兜兰属拥有80多个原种，广泛分布于多个地区。不同兜兰物种间的根、茎、叶片相似度较高，种间的差异主要靠花来鉴定，因此，在非开花时期，很难仅凭根茎叶对其进行物种鉴定。如图1所示，带叶兜兰(p.hirsutissimum)和海伦兜兰(p.helenae)植株高度相似，只有在开花的时候才能进行物种区分。这给带叶兜兰的种质资源收集和保护工作带来很大的困难。

3、因此亟需开发一种分子标记，能快速、经济、稳定地对带叶兜兰进行物种鉴定。

技术实现思路

1、本专利技术的目的在于通过开发一种仅在带叶兜兰种具有酶切位点的物种特异性snp-caps标记，可用于带叶兜兰资源收本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于鉴定带叶兜兰的SNP位点，所述SNP包括SNP14、SNP20、SNP48中的至少一种；

2.一种用于鉴定带叶兜兰的CAPS标记，包括权利要求1所述的用于鉴定带叶兜兰的SNP标记；优选地，所述CAPS标记为SEQ ID NO.1所示序列的第1326碱基处C突变为A和1328碱基处G突变为T，SEQ ID NO.1所示序列第1324-1329碱基处的突变位点序列为GAATTC；

3.一种引物对，其特征在于，所述引物对为用于鉴定权利要求1所述SNP位点的CAPS分子标记引物对；优选地，所述引物对包括SEQ ID NO.4～SEQ ID NO.6至少一项所示...

【技术特征摘要】

1.一种用于鉴定带叶兜兰的snp位点，所述snp包括snp14、snp20、snp48中的至少一种；

2.一种用于鉴定带叶兜兰的caps标记，包括权利要求1所述的用于鉴定带叶兜兰的snp标记；优选地，所述caps标记为seq id no.1所示序列的第1326碱基处c突变为a和1328碱基处g突变为t，seq id no.1所示序列第1324-1329碱基处的突变位点序列为gaattc；

3.一种引物对，其特征在于，所述引物对为用于鉴定权利要求1所述snp位点的caps分子标记引物对；优选地，所述引物对包括seq id no.4～seq id no.6至少一项所示的上游引物和seq id no.7～seq id no.9至少一项所示的下游引物。

4.一种试剂盒，所述试剂盒包含权利要求3所述的引物对。

5.权利要求1所述snp位点或权利要求2所述caps标记或权利要求3所述的引物对或权利要求4所述试...

【专利技术属性】
技术研发人员：龚海光，刘国锋，郭贝怡，贺漫媚，刘仔龙，陈秀萍，王伟，阮琳，代色平，
申请(专利权)人：广州市林业和园林科学研究院，
类型：发明
国别省市：