System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法技术_技高网
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一种基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法技术

技术编号:41314313 阅读:4 留言:0更新日期:2024-05-13 14:56
本发明专利技术提供了一种基于改进卷积神经网络的龋齿PS‑OCT病变区域分割提取方法。该方法可以预标注龋齿数据集、自动分割龋齿图像以及三维重建龋损区域。通过预训练的模型对龋齿数据集进行粗分割,再进行人工增删改的细分割,基于平移窗口注意力(ShiftedWindows TransformerAttention)机制模块改进的U2NET网络实现了偏振敏感光学相干断层龋齿成像进行自动分割,实现对龋齿偏振敏感光学相干断层二维图像(B‑scan)的三维重建,用于辅助医生精细化诊断患者的龋齿损坏程度,减轻医生诊断负担,为患者龋齿检测提供了一种更充分的诊断。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及龋齿病变自动分割领域,具体地说是一种基于改进卷积神经网络的龋齿ps-oct病变区域分割提取方法。


技术介绍

1、在牙科疾病的诊断过程中,初期的龋齿病变的诊断和辨识是一项具有挑战性的任务。人们日常摄入碳水化合物的食物和饮料,口腔中的细菌会利用这些碳水化合物残余物进行代谢,产生酸性代谢物对牙釉质进行酸蚀形成龋洞,如果不能早期发现并干预治疗,龋洞会逐步扩大,蔓延到牙本质和牙髓处,从而形成龋齿,危害牙齿健康,伴随着牙釉质缺失还有牙疼和牙齿敏感症状。因此,临床医生需要尽早且准确地检测和描述这些病变,以便通过非手术方法阻止或逆转病变的发展。

2、目前,在临床上评估咬合面龋齿病变的工具存在一些不足,无法准确检测到早期的龋损,有时需要进行切片实验。因此,为了精确确定病变的程度,迫切需要一种新的、更复杂的诊断工具,以更准确地表征早期的龋损情况。光学相干层析成像(optical coherencetomography,oct)作为一种非入侵、无创、非电离、无辐射的诊断方法,在牙齿硬组织诊断上已经进行了广泛的研究,特别是在龋齿检测方面。而偏振敏感光学相干层析成像(polarization-sensitive optical coherence tomography,ps-oct)是oct的功能扩展,除了传统的强度信号外,还能提供多种具有双折射特性的偏振信息,如相位延迟、光轴夹角和偏振均匀度(degree of polarization uniformity,dopu)。在被口腔中的酸性物质酸蚀过程中,牙釉质和牙本质的光学特性会发生显著变化,即牙釉质的主要成分羟基磷灰石(hap)是双折射晶体,脱矿会使得双折射特性发生改变。结合牙釉质的双折射特性,已有研究证明了去极化程度可以清晰地辨别近端龋齿,即可使用dopu来表征龋齿的严重程度。

3、传统的dopu图像分割方法采用基于阈值的分割,然而噪声的存在会对分割精度产生不良影响。虽然可通过滤波算法对图像背景噪声进行滤除,但由于系统产生的不可避免的散斑噪声,导致c-scan(三维图像)数据切片的b-scan(二维图像)仍带有少量散斑噪声。传统图像分割方法难以忽视散斑噪声,因其强度值难以准确预测。这可能导致将散斑噪声错误地定义为有效信息,导致不足分割,或者将有效信息的阈值设定得太低,虽然可去除散斑噪声,但同时也剔除了有效信息,导致过分割情况。


技术实现思路

1、本专利技术的目的是提供一种基于改进卷积神经网络的龋齿ps-oct病变区域分割提取方法,该方法可以准确自动识别和量化评估牙齿病变区域,包括牙齿龋损和脱矿区域,为牙科医生在诊治过程中提供更为有效的支持。

2、本专利技术是这样实现的:

3、一种基于改进卷积神经网络的龋齿ps-oct病变区域分割提取方法,包括以下步骤:

4、(a)采集龋齿ps-oct三维图像数据(c-scan);

5、(b)对采集到的ps-oct三维图像数据进行滤波降噪并获取二维数据集;

6、(c)从二维数据集中选取设定比例的数据进行人工标注,获得小批次人工标注数据集;

7、(d)将小批次人工标注数据集输入到u2net网络进行预训练,保存预训练结果最好的权重;

8、(e)使用预训练结果最好的权重对所有二维数据集进行预标注;

9、(f)人工审查预标注是否有错误或遗漏,并针对错误或遗漏之处进行修改,得到标注数据集;

10、(g)通过设定随机种子,对标注数据集进行随机打乱;

11、(h)通过基于平移窗口注意力机制模块改进的u2net网络,实现对二维图像的龋损区域的自动分割;

12、(i)针对同一颗龋齿的所有二维图像(b-scan)的龋病区域进行三维重建。

13、本专利技术步骤(a)中,ps-oct三维图像数据的获取过程包括以下步骤:使用ps-oct设备获取龋齿的三维图像数据。本专利技术实验中所采用的ps-oct仪器生成的图像大小为z*x*y(根据牙齿病变区域的具体情况确定)。每个像素点的尺寸对应为pixelz、pixelx、pixely。

14、本专利技术步骤(b)中,对获取到的ps-oct三维图像数据进行滤波降噪,获取b-scan数据集。具体步骤为:

15、第一步:采用3×3滤波核,对ps-oct三维图像数据进行散斑降噪处理。公式如下:

16、

17、其中,iout(x)表示滤波后的像素值,i(x+i)是原始三维数据在位置x+i处的像素值,w(i)是高斯权值,计算方式为:其中σ为标准差,k是滤波核的大小,表示在每个像素点周围考虑的邻域范围,此处取k=3。

18、第二步:针对获取得到的斯托克斯参量q、u、v数据进行均值平滑,平滑窗口设置为9×9。

19、第三步:将平滑后的斯托克斯参量数据归一化,然后使用公式计算dopu值,并保存为dopu三维数据。

20、第四步:对dopu三维数据进行二维图像切片操作,沿着y轴切片,获取z-x方向的dopu图像数据集。

21、本专利技术步骤(c)中,针对获取得到的dopu数据集,随机抽取总数据集的进行逐帧b-scan的人工标注,将dopu图像中的龋损区域标注出来,得到需要的小批次人工标注数据集。

22、本专利技术步骤(e)中,使用预训练得到的权重,对大批次的总数据集进行预标注,自动获取预标注文件,并对预标注效果进行图像展示。

23、本专利技术步骤(f)中,对大批次的dopu数据集预标注进行人工审查。具体步骤为:

24、第一步:核查dopu预标注是否有龋损遗漏或错误标注龋损。

25、第二步:对遗漏的龋损区域进行补充标注,将错误标注为龋损区域的标签进行删除。

26、第三步:针对检查无误的dopu预标注的数据集进行提交保存。

27、第四步:导出dopu掩模二值图像,获取dopu的真实值图像和龋损区域掩模图像,获取正式训练的大批次数据集。

28、本专利技术步骤(g)中,设定随机种子对龋损数据集进行随机扰乱,保证数据集的充分随机和可复用性。

29、本专利技术步骤(h)中,通过基于平移窗口注意力机制模块改良的u2net网络实现对dopu图像的龋损区域自动分割。具体步骤如下:

30、第一步:设定超参数的值,设置batch-size为4,权重衰减系数为:0.0001,训练的轮数为200,优化器为adam w,学习率为0.001,比较cpu核个数与批处理大小,选取两者中更小的值设定为num_workers(最大不超过8);

31、第二步:将dopu图像输入到我们的模型中,首先裁剪为320*320固定尺寸,再将图像映射为像素矩阵。

32、第三步:像素矩阵依次进入编码器(encoder)进行下采样,如图所示,进行龋病信息特征提取。特征提取完毕后获取到龋损关键信息的特征矩阵。编码器内部采用了残差块结构,最大程度的降低本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法,其特征是,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法,其特征是,步骤b具体如下:

3.根据权利要求1所述的基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法,其特征是,步骤f具体如下:

4.根据权利要求1所述的基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法,其特征是,步骤h具体如下:

5.根据权利要求4所述的基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法,其特征是,步骤h-1具体如下:将批次大小设定为4,权重衰减系数设为0.0001,训练周期为200,使用AdamW优化器,学习率为0.001,在比较CPU核心数和批次大小后,选取两者中的较小值,并将其设定为num_workers。

6.根据权利要求1所述的基于改进卷积神经网络的龋齿PS-OCT病变区域分割提取方法,其特征是,步骤c中,从二维数据集中选取1/10的数据进行人工标注,获得小批次人工标注数据集。

【技术特征摘要】

1.一种基于改进卷积神经网络的龋齿ps-oct病变区域分割提取方法,其特征是,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于改进卷积神经网络的龋齿ps-oct病变区域分割提取方法,其特征是,步骤b具体如下:

3.根据权利要求1所述的基于改进卷积神经网络的龋齿ps-oct病变区域分割提取方法,其特征是,步骤f具体如下:

4.根据权利要求1所述的基于改进卷积神经网络的龋齿ps-oct病变区域分割提取方法,其特征是,步骤h具体如下:

5.根据权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:苏亚钱珍珍姚晓天
申请(专利权)人:河北大学
类型:发明
国别省市:

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