【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，属于油茶分子生物学及遗传育种，具体涉及一种油茶抗炭疽病指数筛选的多态性位点分子标记，同时还涉及该分子标记在油茶抗逆性育种中的应用。
技术介绍
1、油茶（camellia oleifera abel.）是我国最主要的经济树种之一，与油棕、油橄榄和椰子并称为世界四大木本食用油料树种。据初步统计，截至2011年，全国已选育出的油茶新品种共有365个，其中通过国家审定的油茶良种有73个，省级油茶良种292个。品种繁多、良莠不齐，优良品种经过长期嫁接繁殖逐步退化等问题给油茶产业的发展带来了严重的消极影响。因此，不断优中选优，继续培育丰产、稳定的优良新品种，对生产实践具有重要的意义。如何开发新的油茶高效育种技术，加快油茶良种选育的进程，培育高产、优质以及抗病虫害的优良品种，成为油茶产业发展的核心问题。
2、据统计，我国的油茶病害超过 50 种，湖南省油茶产区发生的病害多达 37 种，其中油茶炭疽病（oil-tea camellia anthracnose）是油茶林中最重要的病害，普查分布于各油茶林地，是影响茶油产量和质量的重要因素。炭疽病对茶籽的产量和品质危害极大，各地每年因该病害造成油茶籽实减产 10%-30%, 重病区可减产50%以上，甚至100%。炭疽病抗性鉴定一般分为两种：室内鉴定和大田鉴定，通过分析接种病原菌后的感病率和病斑大小来评价其抗病性，因此抗性评价方法也分为病情指数法、聚类分析法和平均病斑直径法。董传媛等研究表明，高抗品种，炭疽病的发病率仅仅为2.8%，中抗品种，炭疽病的发病率为20%左右，
3、目前，分子标记辅助选择已被广泛应用于油茶育种，常用的辅助育种分子标记分为rflp、rapd、ssr、aflp、caps或dcaps，这些标记的使用需要繁琐的凝胶电泳检测，自动化程度低通量小，检测过程中使用的核酸染料会对环境造成污染，并且产物有时会发生非特异性扩增，人为无法做出准确的判断，导致检测效率降低。
技术实现思路
1、本专利技术旨在克服现有技术的不足，提供一种与油茶抗炭疽病指数相关的snp分子标记及其应用。
2、为了达到上述目的，本专利技术提供的技术方案为：
3、所述与油茶抗炭疽病指数相关的snp分子标记是油茶基因组中的cas900032位点。
4、油茶基因组中的cas900032位点可以作为snp分子标记应用于检测油茶抗炭疽病。
5、油茶基因组中的cas900032位点还可以作为snp分子标记用于制备检测油茶抗炭疽病的试剂盒。
6、优选地，所述试剂盒中含有根据油茶基因组中cas900032位点前后50bp侧翼序列设计的引物，包括2条特异性引物和1条通用引物，所述2条特异性引物的5’端分别连接kasp反应试剂特定的荧光序列。
7、更优选地，所述特异性引物为：
8、primer x：
9、5’- gaaggtgaccaagttcatgctctactcttccacttgttgaggcagata-3’（seq id no.1）；
10、primer y：
11、5’- gaaggtcggagtcaacggattctcttccacttgttgaggcagatt-3’ （seq id no.2）；
12、primer c：
13、5’- gtcaacaccaaaatctggaaaatttc-3’ （seq id no.3）。
14、上述的试剂盒可以单独开发成产品。
15、另外，本专利技术所述油茶基因组中的cas900032位点还可以作为分子标记用于油茶抗逆性育种。
16、下面对本专利技术作进一步说明：
17、本专利技术在对201份油茶种质资源进行基因组重测序的基础上，结合全基因组snp基因型和油茶种质资源抗炭疽病指数数据进行了全基因组关联分析（gwas），定位到与油茶抗炭疽病相关联的snp位点cas900032。提取油茶基因组中该snp位点前后50bp侧翼序列，利用batchprimer3引物设计软件进行引物设计。为测试该snp标记的可行性，我们选取40份油茶种质资源进行标记检测验证。经验证，标记cas900032分型结果完全符合预期。本专利技术的与油茶抗炭疽病指数相关的snp标记cas900032可用于油茶种质材料的炭疽病抗性的早期检测和筛选。
18、本专利技术提供了一个与油茶抗炭疽病指数极显著关联的分子标记，结合kasp检测技术，解决传统分子标记辅助育种中的技术问题，无需琼脂糖凝胶电泳，可快速、准确、高效、高通量的进行油茶抗炭疽病指数早期鉴别，加快品种选育进程。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种与油茶抗炭疽病指数相关的SNP分子标记，其特征在于，所述与油茶抗炭疽病指数相关的SNP分子标记是油茶基因组中的CaS900032位点。
2.油茶基因组中的CaS900032位点作为SNP分子标记在检测油茶抗炭疽病中的应用。
3.油茶基因组中的CaS900032位点作为SNP分子标记在制备检测油茶抗炭疽病试剂盒中的应用。
4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂盒中含有根据油茶基因组中CaS900032位点前后50bp侧翼序列设计的引物，包括2条特异性引物和1条通用引物，所述2条特异性引物的5’端分别连接KASP反应试剂特定的荧光序列。
5.如权利要求4所述的应用，其特征在于，所述特异性引物为：
6.一种检测油茶抗炭疽病的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中含有根据油茶基因组中CaS900032位点前后50bp侧翼序列设计的引物，包括2条特异性引物和1条通用引物，所述2条特异性引物的5’端分别连接KASP反应试剂特定的荧光序列。
7.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述特异性引物为：
<...【技术特征摘要】
1.一种与油茶抗炭疽病指数相关的snp分子标记，其特征在于，所述与油茶抗炭疽病指数相关的snp分子标记是油茶基因组中的cas900032位点。
2.油茶基因组中的cas900032位点作为snp分子标记在检测油茶抗炭疽病中的应用。
3.油茶基因组中的cas900032位点作为snp分子标记在制备检测油茶抗炭疽病试剂盒中的应用。
4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂盒中含有根据油茶基因组中cas900032位点前后50bp侧翼序列设计的引物，包括2条特异性引物和1条通用引物，所述2条特异...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈永忠，王瑞，何之龙，张英，张震，寻成峰，王湘南，
申请(专利权)人：湖南省林业科学院，
类型：发明
国别省市：
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