System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合、芯片、试剂盒及方法技术_技高网

一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合、芯片、试剂盒及方法技术

技术编号:41221497 阅读:5 留言:0更新日期:2024-05-09 23:41
本发明专利技术公开了一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合、芯片、试剂盒及方法,其中,检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合包括SEQ ID No.1‑SEQ ID No.151所示的探针,还公开了利用上述探针组合制备的芯片、试剂盒以及检测方法。本发明专利技术利用全基因组范围内的探针,采用芯片进行杂交,通过对探针组杂交信号的解读,可判断目标长孢藻是否存在,实现对长孢藻进行检测,相对传统检测方法具有分辨率高的优势,并且,检测方法操作简单,数据处理简单便捷,准确性高,该检测方法对水体危害蓝藻污染的长期动态监测具有重要应用价值,可广泛应用于淡水湖泊水体有害藻华爆发风险的监测,为引导藻华控制和水生态修复提供了有力的支持。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物芯片,及微生物检测方法,具体涉及一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合、芯片、试剂盒及方法


技术介绍

1、随着人类工业活动和社会经济的持续发展,湖泊因为富营养化而导致的藻类污染已经成为全球性的重大环境问题。有害的蓝藻水华,通常被称为有害藻华(hab),是一种以特定蓝藻种类在水生态系统中迅速繁殖为特征的现象,其发生受到了升高的温度和养分丰富的条件的影响,尤其是过量的磷和氮。这些水华对环境和公共卫生产生了显著而多方面的影响。特定的蓝藻可以产生毒素,对生态系统内的生物造成直接危害。此外,这些水华通过在分解过程中消耗氧气,导致鱼类死亡并对其他水生生物产生负面影响,从而导致了水质的降低。经济上的后果可能来自因有害水体而关闭对娱乐活动和捕鱼的影响,从而影响到了当地经济。生态平衡也因蓝藻的优势地位而受到破坏,改变了其他生物的数量和多样性。人类健康风险涵盖了通过直接接触或摄入受污染的水和水生生物而引起的皮肤刺激、呼吸问题和胃肠问题。积极主动的监测和全面的管理策略对于应对有害蓝藻水华在环境和社会方面的复杂而相互关联的影响至关重要。

2、长孢藻(dolichospermum)是一类在全球淡水生态系统中具有重要地位的细丝状蓝藻属,展现出复杂而有深远影响的特性。广泛分布于养分丰富的水域,长孢藻以在适宜条件下形成茂密水华的倾向而著称,从而可以改变生态平衡。这个蓝藻属独特之处在于其能够产生多种蓝藻毒素,包括微囊藻毒素和无酶毒素,构成了重要的生态威胁。微囊藻毒素作为一种强效肝毒素,在暴露后已与肝损害有关,而无酶毒素则是对神经系统产生影响的神经毒素。长孢藻的危害不仅仅涉及对水生态系统的干扰,还包括了经济方面的负面影响。比如因有害水华而关闭水域对娱乐活动和渔业的影响对于当地经济产生连锁效应。除了直接的毒性外,长孢藻水华在分解过程中还会导致氧气耗尽,进一步加剧了水生态系统的生存压力。因此针对该种蓝藻进行积极的监测和灵活的管理策略对于控制有害水华爆发和生态修复至关重要。

3、目前长孢藻的检测主要分为两种检测策略。一种是利用质谱仪根据长孢藻毒素特性直接检测水体中长孢藻释放的毒素含量,从而判断水体是否被长孢藻污染。这种检测策略主要的劣势在于,只有当水体中已经被长孢藻严重污染且进入毒素释放阶段之后才能检测出,而早期长孢藻休眠阶段很难检出长孢藻污染。第二种策略是通过对长孢藻特定dna片段扩增测序的方式检测水体中是否含有长孢藻,包括针对长孢藻16s rrna片段和藻毒素功能基因片段的定量pcr检测方法。这种策略具有较好的早期长孢藻预警效果,但是对于长孢藻检出的分辨率不够,通常只能鉴定到属的水平,从而混淆了不同种长孢藻的生理生态特性。

4、基因芯片是一种技术先进的检测工具,它由大量寡核苷酸探针紧密固定在玻片上构成。通过将这些探针与荧光标记的样本dna进行碱基互补配对的杂交,基因芯片能够通过对杂交信号的强弱进行精确判读,从而完成对探针目标序列的高效检测。这种技术以其高通量和高敏感性而在人类病原微生物和其他环境微生物指标检测领域得到广泛应用。然而,值得注意的是,尽管基因芯片技术在各个领域取得了显著的成就,但目前在水体长孢藻的检测方面尚未见相关报道。将基因芯片技术应用于水体长孢藻的检测领域,或许将为我们提供一种新颖而高效的方法,以更全面、迅速地了解水体中长孢藻的分布和种群动态。这一创新应用有望进一步推动水生态系统监测技术的发展,为水质管理和生态保护提供更深入的洞察。


技术实现思路

1、为了解决上述问题中的一种,本专利技术提供了一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合、芯片、试剂盒及方法。

2、为了达到上述目的,本专利技术采用了如下技术手段:

3、本专利技术的第一方面提供了一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合,所述探针组合包括检测dolichospermum circinale awqc310f、dolichospermum circinale cs-1031、dolichospermum circinale cs-539、dolichospermum compactum nies-806、dolichospermum flos-aquae ccap 1403/13f、dolichospermum flos-aquae lege 04289、dolichospermum flos-aquae uhcc 0037、dolichospermum heterosporum tac447、dolichospermum lemmermannii cs-548、dolichospermum planctonicum cs-1226、dolichospermum planctonicum uhcc 0167等11个检测目标的探针,每个检测目标的探针包含10-15条特异检测探针组成的探针组。

4、所述探针组合包括检测dolichospermum circinale awqc310f的探针组,探针组中的11条探针序列如seq id no.1至seq id no.11所示,检测dolichospermum circinalecs-1031的探针组,探针组中的14条探针序列如seq id no.12至seq id no.25所示,检测dolichospermum circinale cs-539的探针组,探针组中的11条探针序列如seq id no.26至seq id no.36所示,检测dolichospermum compactum nies-806的探针组,探针组中的12条探针序列如seq id no.37至seq id no.48所示,检测dolichospermum flos-aquae ccap1403/13f的探针组,探针组中的15条探针序列如seq id no.49至seq id no.63所示,检测dolichospermum flos-aquae lege 04289的探针组,探针组中的15条探针序列如seq idno.64至seq id no.78所示,检测dolichospermum flos-aquae uhcc 0037的探针组,探针组中的15条探针序列如seq id no.79至seq id no.93所示,检测dolichospermumheterosporum tac447的探针组,探针组中的15条探针序列如seq id no.94至seq idno.108所示,检测dolichospermum lemmermannii cs-548的探针组,探针组中的15条探针序列如seq id no.109至seq id no.123所示,检测dolichospermum planctonicum cs-1226的探针组,探针组中的13条探针序列如seq id no.124至seq id no.136所示,检测dolichospermum planctonicum uhcc 0167的探针组,探针组中的15条探针序列如seq idno.137至seq id no.151所示。

5、在本本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合,其特征在于:所述探针组合包括检测Dolichospermum circinale AWQC310F的探针组,序列如SEQ ID No.1至SEQ IDNo.11所示,检测Dolichospermum circinale CS-1031的探针组,序列如SEQ ID No.12至SEQ ID No.25所示,检测Dolichospermum circinale CS-539的探针组,序列如SEQ ID No.26至SEQ IDNo.36所示,检测Dolichospermum compactum NIES-806的探针组,序列如SEQ ID No.37至SEQ ID No.48所示,检测Dolichospermum flos-aquae CCAP 1403/13F的探针组,序列如SEQ ID No.49至SEQ ID No.63所示,检测Dolichospermum flos-aquae LEGE 04289的探针组,序列如SEQ ID No.64至SEQ ID No.78所示,检测Dolichospermum flos-aquae UHCC0037的探针组,序列如SEQ ID No.79至SEQ IDNo.93所示,检测Dolichospermumheterosporum TAC447的探针组,序列如SEQ IDNo.94至SEQ ID No.108所示,检测Dolichospermum lemmermannii CS-548的探针组,序列如SEQ ID No.109至SEQ ID No.123所示,检测Dolichospermum planctonicum CS-1226的探针组,序列如SEQ ID No.124至SEQID No.136所示,检测Dolichospermum planctonicum UHCC 0167的探针组,序列如SEQ IDNo.137至SEQ IDNo.151所示。

2.权利要求1所述的探针组合在制备用于检测有害水华蓝藻长孢藻的芯片或者试剂盒中的应用,其特征在于:所述有害水华蓝藻长孢藻的检测目标包括Dolichospermumcircinale AWQC310F、Dolichospermum circinale CS-1031、Dolichospermum circinaleCS-539、Dolichospermum compactum NIES-806、Dolichospermum flos-aquae CCAP 1403/13F、Dolichospermum flos-aquae LEGE 04289、Dolichospermum flos-aquae UHCC 0037、Dolichospermum heterosporum TAC447、Dolichospermum lemmermannii CS-548、Dolichospermum planctonicum CS-1226、Dolichospermum planctonicum UHCC 0167。

3.一种检测有害水华蓝藻长孢藻的芯片,其特征在于:包括权利要求1所述的探针组合。

4.一种检测有害水华蓝藻长孢藻的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括权利要求1所述的探针组合或者权利要求3所述的芯片。

5.根据权利要求4所述的一种检测有害水华蓝藻长孢藻的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括待测样本DNA提取试剂、DNA纯化试剂以及DNA荧光标记试剂。

6.一种检测有害水华蓝藻长孢藻的方法,其特征在于,包括如下步骤:

7.根据权利要求6所述的一种检测有害水华蓝藻长孢藻的方法,其特征在于,检测结果判定的标准为:当检测目标中某一目标全部的特异探针具有合格信号值的比例大于70%,那么判定该检测目标存在于目标水体中。

...

【技术特征摘要】

1.一种检测有害水华蓝藻长孢藻的探针组合,其特征在于:所述探针组合包括检测dolichospermum circinale awqc310f的探针组,序列如seq id no.1至seq idno.11所示,检测dolichospermum circinale cs-1031的探针组,序列如seq id no.12至seq id no.25所示,检测dolichospermum circinale cs-539的探针组,序列如seq id no.26至seq idno.36所示,检测dolichospermum compactum nies-806的探针组,序列如seq id no.37至seq id no.48所示,检测dolichospermum flos-aquae ccap 1403/13f的探针组,序列如seq id no.49至seq id no.63所示,检测dolichospermum flos-aquae lege 04289的探针组,序列如seq id no.64至seq id no.78所示,检测dolichospermum flos-aquae uhcc0037的探针组,序列如seq id no.79至seq idno.93所示,检测dolichospermumheterosporum tac447的探针组,序列如seq idno.94至seq id no.108所示,检测dolichospermum lemmermannii cs-548的探针组,序列如seq id no.109至seq id no.123所示,检测dolichospermum planctonicum cs-1226的探针组,序列如seq id no.124至seqid no.136所示,检测dolichospermum planctonicum uhcc 0167的探针组,序列如seq idno.137至...

【专利技术属性】
技术研发人员:李华束浩月霍达金桃李仁辉束文圣
申请(专利权)人:中国科学院水生生物研究所
类型:发明
国别省市:

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