一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法技术

本发明专利技术公开了一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法，该方法通过以下步骤实现：S1、收集胰腺癌数据；S2、对收集到的胰腺癌数据，通过R软件进行整合RNA测序数据和临床信息，将所述测序数据值转换为微阵列结果的每千碱基百万(TPM)值的转录本；S3、通过ssGSEA对24种免疫细胞的浸润水平进行量化，并使用GSVA包通过ssGSEA对所述112条代谢相关途径进行量化；S5、免疫反应预测因子的量化；S6、免疫治疗队列分析；S7、列线图构建；S8、使用R‑4.0.4进行统计分。通过采用本发明专利技术风险评分方法，不仅步骤简单，而且准确度更高。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于预后风险评分，具体涉及一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法。

技术介绍

1、胰腺癌是全球恶性程度最高的癌症类型之一。由于大多数患者在初步诊断时已经发生转移，所以胰腺癌患者的预后极差。对于胰腺癌的治疗方面，手术切除是主要治疗方法，同时化疗和放疗代表了替代治疗的有效选择，但近几十年来在改善患者预后方面进展甚微；免疫疗法是一种相对较新的癌症治疗方法，免疫检查点抑制可缓解肿瘤浸润淋巴细胞(tils)的抑制，从而导致tils的激活增强和随后的肿瘤细胞清除。免疫疗法已有效用于多种癌症类型，成千上万的患者已从这种治疗中受益。然而，tils分析不足以表征复杂的肿瘤免疫环境。此外，在til数量较多的患者中也观察到免疫治疗耐药性；已开发出各种指标用于免疫治疗反应预测，包括肿瘤突变负荷(tmb)、pd-l1表达和微卫星不稳定性(msi)，这些有助于临床医生确定适合接受免疫治疗的患者。

2、为了快速增殖并在多种压力下进行增值，肿瘤细胞经历代谢重编程，选择有氧糖酵解和乳酸产生(warburg效应)等途径；tils通常由于肿瘤细胞代谢失调而受到代谢压本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法，其特征在于，该方法通过以下步骤实现：

2.根据权利要求1所述的一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法，其特征在于，所述S4中，所述免疫反应预测因子的量化的具体方法为：肿瘤免疫功能障碍和排斥、免疫表型评分和药物敏感性分析肿瘤免疫功能障碍和排斥算法用于模拟不同的肿瘤免疫逃避机制，较高的肿瘤免疫功能障碍和排斥评分预测免疫逃避和较差的免疫治疗反应；免疫表型评分也被确定用于预测免疫治疗反应；癌症细胞系药物敏感性数据来自癌症治疗反应门户网站和PRISM数据库；这两个数据集都提供了剂量-反应曲线下的面积，作为药物敏感性的测量，AUC值...

【技术特征摘要】

1.一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法，其特征在于，该方法通过以下步骤实现：

2.根据权利要求1所述的一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法，其特征在于，所述s4中，所述免疫反应预测因子的量化的具体方法为：肿瘤免疫功能障碍和排斥、免疫表型评分和药物敏感性分析肿瘤免疫功能障碍和排斥算法用于模拟不同的肿瘤免疫逃避机制，较高的肿瘤免疫功能障碍和排斥评分预测免疫逃避和较差的免疫治疗反应；免疫表型评分也被确定用于预测免疫治疗反应；癌症细胞系药物敏感性数据来自癌症治疗反应门户网站和prism数据库；这两个数据集都提供了剂量-反应曲线下的面积，作为药物敏感性的测量，auc值越低，敏感性越高；应用k-最近邻插补来获得缺失的auc值；排除了数据缺失超过20％的化合物和造血和淋巴组织细胞系；根据基于癌症药物敏感性基因组学数据库的prrophetic软件包量化的ic50值，评估每个pac患者对化疗的敏感性；应用岭回归模型对三个数据集中的每个患者进行药物敏感性估计；人类癌症细胞系的表达谱数据来自broad institute cancer cell line encyclopedia数据库。

3.根据权利要求1所述的一种用于预测胰腺癌患者预后的免疫代谢评估方法，其特征在于，所述s5中，所述免疫疗法包括九个队列，具体包括imvigor210数据集、gse91061、gse78220、gse63557、gse117358、gse148476、gse173839、gse165252和gse168204被纳入分析；imvigor210数据集包括接受阿替佐单抗治疗的癌症转移患者的数据；gse91061和gse78220数据集包括来自抗pd-1治疗的黑色素瘤患者的数据；gse6355...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋扬，郭永东，李俊强，
申请(专利权)人：中国人民解放军空军军医大学，
类型：发明
国别省市：