System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种ncRNA数据库的数据更新方法技术_技高网

一种ncRNA数据库的数据更新方法技术

技术编号:41143092 阅读:4 留言:0更新日期:2024-04-30 18:12
本发明专利技术涉及生物信息学技术领域,公开了一种ncRNA数据库的数据更新方法,包括步骤一:收集新的数据:从多个数据源收集关于ncRNA的新数据,包括实验数据、文献数据和公共数据库数据;步骤二:数据预处理:对收集到的数据进行预处理,包括数据清洗、数据整合和数据标准化;步骤三:数据更新:将预处理后的数据更新到ncRNA数据库中。通过数据清洗、数据整合和数据标准化步骤,在将不同研究团队中提供的数据录入时,去除噪声、重复数据和缺失值,将多个相关数据集合并到一个数据集中,根据优先级或其他规则来解决数据冲突,再将不同来源的数据进行归一化处理,使得数据具有可比性,避免出现数据不统一的情况。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息学,具体为一种ncrna数据库的数据更新方法。


技术介绍

1、ncrna是一类不编码蛋白质的 rna 分子,在细胞内发挥着重要的调控作用,根据长度和功能的不同,ncrna 可以分为多种类型,如小 rna、长非编码 rna、环状 rna等,ncrna 在细胞内的功能非常多样化,包括基因转录调控、mrna 剪接和稳定性调节、蛋白质翻译调节、细胞发育和分化等,ncrna 可以通过与 dna、rna 或蛋白质相互作用来实现其调控功能。

2、随着生物技术的不断发展,越来越多的 ncrna 被发现和研究,ncrna 数据库可以提供关于 ncrna 的序列、结构、功能、表达等信息,帮助研究人员更好地了解 ncrna 的生物学功能和调控机制,现有技术中对数据库进行更新时,由于不同的实验室和研究团队使用不同的实验方法和技术,导致数据库更新的数据出现标准化不统一的问题。


技术实现思路

1、针对现有技术的不足,本专利技术提供了一种ncrna数据库的数据更新方法,解决了现有技术中在对ncrna数据库更新同种数据时会因为录入不同的研究团队的数据,导致数据库更新的数据出现标准化不统一问题。

2、为实现以上目的,本专利技术通过以下技术方案予以实现:一种ncrna数据库的数据更新方法,包括:

3、步骤一:收集新的数据:从多个数据源收集关于 ncrna 的新数据,包括实验数据、文献数据和公共数据库数据;

4、步骤二:数据预处理:对收集到的数据进行预处理,包括数据清洗、数据整合和数据标准化;

5、步骤三:数据更新:将预处理后的数据更新到 ncrna 数据库中,包括插入新数据、修改现有数据和删除过时数据;

6、步骤四:数据验证:对更新后的数据进行验证,确保数据的准确性和完整性;

7、步骤五:数据发布:将更新后的数据发布到 ncrna 数据库中,供用户查询和使用。

8、优选的,所述步骤一中,数据源包括基因组注释数据库、转录组数据库、rna-seq数据和蛋白质组数据库。

9、优选的,所述步骤二中,数据清洗包括:

10、去除重复数据、通过唯一标识字段去除重复的记录;

11、填充缺失值、使用适当的方法填充缺失的数据;

12、纠正数据格式、检查并纠正数据中的格式错误。

13、优选的,所述步骤二中,数据整合是指将来自不同数据源的数据进行合并和整合,以形成一个统一的数据集。

14、优选的,所述步骤二中,数据整合过程中,出现数据冲突的情况时,根据优先级规则来解决冲突。

15、优选的,所述步骤二中,数据标准化是指将不同数据源的数据进行归一化处理,以消除数据之间的单位和尺度差异。

16、优选的,所述步骤三中,插入新数据是指将新收集到的 ncrna 数据插入到数据库中,在插入新数据之前,进行数据清洗、整合和标准化处理,确保数据的质量和一致性。

17、优选的,所述步骤三中,修改现有数据是指对数据库中已有的 ncrna 数据进行更新或修改;所述步骤三中,删除过时数据是指将不再需要或已经过时的数据从数据库中删除。

18、优选的,所述去除重复数据步骤中,唯一标识字段为基因 id,所述填充缺失值步骤中,使用的方法为平均值、众数或 previousvalue。

19、本专利技术提供了一种ncrna数据库的数据更新方法。具备以下有益效果:

20、本专利技术通过数据清洗、数据整合和数据标准化步骤,在将不同研究团队中提供的数据录入时,去除噪声、重复数据和缺失值,将多个相关数据集合并到一个数据集中,根据优先级或其他规则来解决数据冲突,再将不同来源的数据进行归一化处理,使得数据具有可比性,避免出现数据不统一的情况。

21、本专利技术通过数据清洗、整合、标准化和插入新数据等步骤,可以去除数据中的重复、缺失值和错误,可以减少数据的冗余和复杂性,从而提高数据的质量和准确性以及数据管理的效率。

22、本专利技术通过将多个相关数据集整合到一个数据库中,并解决数据冲突,可以使得数据更加完整和一致,从而增强了数据的可用性。

本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤一中,数据源包括基因组注释数据库、转录组数据库、RNA-Seq 数据和蛋白质组数据库。

3.根据权利要求1所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤二中,数据清洗包括:

4.根据权利要求1所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤二中,数据整合是指将来自不同数据源的数据进行合并和整合,以形成一个统一的数据集。

5.根据权利要求1所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤二中,数据整合过程中,出现数据冲突的情况时,根据优先级规则来解决冲突。

6.根据权利要求1所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤二中,数据标准化是指将不同数据源的数据进行归一化处理,以消除数据之间的单位和尺度差异。

7.根据权利要求1所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤三中,插入新数据是指将新收集到的 ncRNA 数据插入到数据库中,在插入新数据之前,进行数据清洗、整合和标准化处理,确保数据的质量和一致性。

8.根据权利要求1所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤三中,修改现有数据是指对数据库中已有的 ncRNA 数据进行更新或修改;所述步骤三中,删除过时数据是指将不再需要或已经过时的数据从数据库中删除。

9.根据权利要求3所述的一种ncRNA数据库的数据更新方法,其特征在于,所述去除重复数据步骤中,唯一标识字段为基因 ID,所述填充缺失值步骤中,使用的方法为平均值、众数或 PreviousValue。

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【技术特征摘要】

1.一种ncrna数据库的数据更新方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种ncrna数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤一中,数据源包括基因组注释数据库、转录组数据库、rna-seq 数据和蛋白质组数据库。

3.根据权利要求1所述的一种ncrna数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤二中,数据清洗包括:

4.根据权利要求1所述的一种ncrna数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤二中,数据整合是指将来自不同数据源的数据进行合并和整合,以形成一个统一的数据集。

5.根据权利要求1所述的一种ncrna数据库的数据更新方法,其特征在于,所述步骤二中,数据整合过程中,出现数据冲突的情况时,根据优先级规则来解决冲突。

6.根据权利要求1所述的一种ncrna数据库的数据更新方法,其特征在于,所...

【专利技术属性】
技术研发人员:李钊孙亮李潇孙洁于兆衍
申请(专利权)人:山东一点基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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