一种ac4C乙酰化修饰调控RNA剪接的方法技术

技术编号:41118226 阅读:135 留言:0更新日期:2024-04-25 14:07
本发明专利技术提供了一种ac4C乙酰化修饰调控RNA剪接的方法,通过构建乙酰化修饰的RNA,设计了标记的特异RNA探针,将RNA探针与待测RNA基因特异性结合,形成双链RNA,杂交双链进行变性聚丙酰胺凝胶电泳,通过磷屏成像系统检测被保护的探针的信号,从而定量分析ac4C修饰对RNA剪接的影响。该方法操作简单,灵敏度高,通过改变乙酰化酶NAT10的表达或者使用ac4C位点突变病毒,能够定量反映ac4C乙酰化修饰调控RNA剪接的水平。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物,具体涉及一种ac4c乙酰化修饰调控rna剪接的方法。


技术介绍

1、rna剪接是在前体mrna中,在核酸内切酶作用下剪切掉内含子,然后再连接酶作用下,将外显子各部分连接起来,生成成熟mrna的过程,rna剪接是基因调控中的一个重要部分。通过rna剪接,可以产生许多具有功能的,带有编码信息的mrna,它对生物的发育及进化至关重要。

2、迄今为止,在rna上已发现了100多种化学修饰,如m6a(n6-methyladenosine),m1a(n1-methyladenosine),m5c(5-methylcytidine),hm5c(5-hydroxylmethylcytidine),i(inosine)以及ψ(pseudouridine)等化学修饰。ac4c乙酰化修饰是众多rna修饰的一种,但目前对ac4c修饰的研究较少。

3、目前的rna修饰影响rna剪接的检测技术主要包括rt-pcr,rt-qpcr以及northernblot等实验方法,以此来检测宿主或病毒的rna剪接水平的变化。在现有的rna剪接检测技术中,本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种ac4C乙酰化修饰调控RNA剪接的方法,其特征在于:包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的ac4C乙酰化修饰调控RNA剪接的方法,其特征在于:所述的待测RNA基因选自:构建乙酰化酶NAT10的敲低或过表达细胞系,病毒感染48h后收取的细胞总RNA,或者使用ac4C位点突变的感染性克隆转染细胞48h后收取的细胞总RNA中的一种。

3.根据权利要求1所述的ac4C乙酰化修饰调控RNA剪接的方法,其特征在于:所述的待测RNA基因选自MVC病毒。

4.根据权利要求1所述的ac4C乙酰化修饰调控RNA剪接的方法,其特征在于:所述特异RNA探针的制备,包...

【技术特征摘要】

1.一种ac4c乙酰化修饰调控rna剪接的方法,其特征在于:包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的ac4c乙酰化修饰调控rna剪接的方法,其特征在于:所述的待测rna基因选自:构建乙酰化酶nat10的敲低或过表达细胞系,病毒感染48h后收取的细胞总rna,或者使用ac4c位点突变的感染性克隆转染细胞48h后收取的细胞总rna中的一种。

3.根据权利要求1所述的ac4c乙酰化修饰调控rna...

【专利技术属性】
技术研发人员:关武祥张雪艳黄方陈珍
申请(专利权)人:中国科学院武汉病毒研究所
类型:发明
国别省市:

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