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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于植物鉴定,具体涉及一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法。
技术介绍
1、菱,是菱科菱属一年生浮水水生草本。浮生叶聚生长于茎顶,成莲座状,叶片菱圆形或三角状菱圆形,表面深亮绿色,无毛,背面灰褐色或绿色。《flora of china》中将菱属植物分为欧菱和细果野菱两种,细果野菱叶片菱形三角形,果高1-2厘米,4刺角细锥状;欧菱叶片正三角形菱形,果高4-6厘米,0-4角。但是在菱属植物的幼苗期,细果野菱和欧菱无法进行区分,给农业生产和商品产业造成很大的困难。
技术实现思路
1、本专利技术提供了一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,旨在解决现有技术中在菱属植物的幼苗期,细果野菱和欧菱无法进行区分的技术问题。
2、为了解决上述技术问题,本专利技术所采用的技术方案为:
3、本专利技术提供了一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,包括:
4、s1、提取细果野菱dna后,设计双端引物对幼苗期的细果野菱dna进行pcr扩增获得细果野菱叶绿体基因上39074-39129dna片段;
5、s2、通过琼脂糖凝胶电泳对获得的叶绿体39074-39129dna片段进行检测,鉴定电泳结果中是否出现410-450bp特异性dna片段的位置条带,若出现该条带,则表明待测菱品种为细果野菱;若不出现该条带,则表明待测菱品种不是细果野菱。
6、优选的方案,所述特异性dna片段的位置条带为432bp。
7、优选的方案,所述特异性dn
8、基于上述方案,经试验证明,所述特异性dna片段的位置条带为432bp左右。
9、优选的方案,所述叶绿体39074-39129dna片段的基因序列为:tgaaatcattgaattcattagaattagataccgatttctatataacctatttatgc。
10、优选的方案,所述双端引物包括primer 1和primer 2,所述primer 1的核苷酸序列为:agcttccgttgagtctctgc,所述primer 2的核苷酸序列为:tgcgagtaagagaggcatgtt。
11、优选的方案,所述琼脂糖凝胶电泳检测dna片段的步骤为:
12、a1、制备琼脂糖凝胶:称取2.5-3.5质量份琼脂糖粉末加入到145-155体积份电泳缓冲液中,微波加热后加入0.01-0.02体积份核酸凝胶染料,摇匀后将溶液倒入制胶槽,插入梳齿,室温冷却凝固30-60min;
13、a2、将冷却好的琼脂糖凝胶拔掉梳子后放入电泳槽中,开始上样,并在两组样品之间点0.01-0.02体积份marker溶液,打开电泳开关,设置电压为150v,电泳时间为55min-65min;
14、a3、电泳结束后,置于250-350nm紫外光激发的uv凝胶成像系统监测;
15、其中,1质量份:1体积份=1g:1ml。
16、基于上述方案,由于琼脂糖中硫酸根含量较琼脂为少,电渗影响减弱,因而使dna分离效果显著提高,而且琼脂糖作为支持体有分辨率高和重复性好的优点,可以实现快速鉴别,且琼脂糖透明而不吸收紫外线。
17、优选的方案,在步骤s1中,所述电泳缓冲液为tbe溶液,所述核酸凝胶染料为ts-gelred。
18、基于上述方案,tbe溶液缓冲能力强,分离效果最好,在琼脂糖凝胶上,迁移速度更快,且适合长时间的电泳实验,分辨率高。ts-gelred溶液作为核酸凝胶染料,具有安全无毒、灵敏度高、染色均匀和定量准确的优点,ts-gelred溶液使正负极染色亮度一致,避免了出现阴阳极染色不均现象。
19、优选的方案,在步骤s1中,所述琼脂糖粉末质量为3质量份,所述电泳缓冲液体积为150体积份,所述核酸凝胶染料体积为0.15体积份。
20、优选的方案,所述细果野菱dna通过高效植物基因组dna提取试剂盒提取,所述高效植物基因组dna提取试剂盒包括rnase a、buffer lp1、buffer lp2、buffer lp3、bufferwb和te buffer。
21、基于上述方案,使用高效植物基因组dna提取试剂盒提取dna可以节省时间,提高效率,减少操作步骤,提高提取效率。且试剂盒提取dna的操作简单,不需要复杂的技术。除此之外,试剂盒提取dna的成本低,可以大大降低成本。
22、优选的方案,所述细果野菱dna的提取方法为:
23、b1、取干燥且处于幼苗期的待测菱植物组织加入液氮研磨成粉末,加入bufferlp1和rnase a充分震荡裂解后,置于60-70℃水浴8-12min,再加入bufferlp2进行震荡、冰浴和离心后获得上清液,向上清液中加入1.5倍上清液体积的buffer lp3得到混合溶液;
24、b2、将所述混合溶液放入吸附柱中,离心后弃废液;向吸附柱中加入bufferwb,离心弃废液,再加入buffer wb,再次离心弃废液后开盖晾干;再向吸附柱中滴加te buffer或灭菌水,室温放置2-5min后进行离心,离心后的沉淀为细果野菱dna。
25、本专利技术的有益效果为:
26、本专利技术通过提取细果野菱dna,并进行琼脂糖凝胶电泳实现对菱属植物短片段dna的高分辨率分离,根据特异性dna410-450bp的片段在凝胶上的迁移距离,从而快速鉴别待测菱品种是否为细果野菱,而且琼脂糖凝胶电泳仪器设备相对简单,无需特殊的高技术操作,成本较低。通过基因条带确认待测菱品种的方法具有快速、准确和灵敏的特点,为菱角产业提供了技术支持,确保种植的菱角品种统一。除此之外,通过对细果野菱基因型的鉴定分析,可以进一步了解细果野菱的遗传背景和品质特征,从而为选育新品种提供科学依据。
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1.一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述特异性DNA片段的位置条带为432bp。
3.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述特异性DNA片段的位置条带为420bp。
4.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述叶绿体39074-39129DNA片段的基因序列为:TGAAATCATT GAATTCATTAGAATTAGATACCGATTTCTATATAACCTATTTATGC。
5.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述双端引物包括Primer 1和Primer 2,所述Primer 1的核苷酸序列为:AGCTTCCGTTGAGTCTCTGC,所述Primer 2的核苷酸序列为:TGCG AGTAAGAGAGGCATGTT。
6.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述琼脂糖
7.根据权利要求6所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,在步骤S1中,所述电泳缓冲液为TBE溶液,所述核酸凝胶染料为TS-GelRed。
8.根据权利要求6所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,在步骤S1中,所述琼脂糖粉末质量为3.0质量份,所述电泳缓冲液体积为150体积份,所述核酸凝胶染料体积为0.15体积份。
9.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述细果野菱DNA通过高效植物基因组DNA提取试剂盒提取,所述高效植物基因组DNA提取试剂盒包括RNase A、Buffer LP1、Buffer LP2、Buffer LP3、Buffer WB和TE Buffer。
10.根据权利要求9所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述细果野菱DNA的提取方法为:
...【技术特征摘要】
1.一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述特异性dna片段的位置条带为432bp。
3.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述特异性dna片段的位置条带为420bp。
4.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述叶绿体39074-39129dna片段的基因序列为:tgaaatcatt gaattcattagaattagataccgatttctatataacctatttatgc。
5.根据权利要求1所述的一种在菱属植物幼苗期鉴别细果野菱的方法,其特征在于,所述双端引物包括primer 1和primer 2,所述primer 1的核苷酸序列为:agcttccgttgagtctctgc,所述primer 2的核苷酸序列为:tgcg agtaagagaggcatgtt。
6.根据权利...
【专利技术属性】
技术研发人员:黄燕,盛威,方明雅,陈阳,陈小央,张心怡,袁晔,石林,王凌云,姚祥坦,邱英雄,郑寨生,
申请(专利权)人:金华市农业科学研究院浙江省农业机械研究院,
类型:发明
国别省市:
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