【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及动物遗传选育，特别涉及肉羊肉质性状相关snp分子标记及其在肉质性状筛选中的应用。
技术介绍
1、羊肉以其肉质细嫩、味道鲜美、营养丰富等特点备受消费者青睐，高品质羊肉产品已成为人们饮食需求的重要组成部分。高档优质肉羊的选育和高品质羊肉的生产受到越来越多生产者和消费者的关注，是当下肉羊产业的工作热点。羊肉品质是一个综合性状，包含感官品质、营养品质等方面的指标。其中，熟肉率是反映肌肉保水性的重要感官指标，熟肉率越高，说明在加工过程中的损耗越小，则营养流失较少，保水性也会更好，肌肉会更嫩，肉品质更佳，且加工后的出品率更高，在保存其营养价值的同时也可带来较高的经济价值。另外，脂肪酸是影响肉品质的重要营养指标，其含量和组成决定了脂肪的质地特性以及肌肉的氧化稳定性，影响肉的风味、嫩度、保质期等，同时脂肪酸是机体的主要能量来源；棕榈油酸属于脂肪酸的一种，是一种十六碳单稀不饱和脂肪酸，非常容易被人体消化和吸收，可以影响多种血糖代谢关键酶类，在控制人体肝脏、肌肉组织的新陈代谢方面，以及在代谢性疾病方面有非常重要的作用，是影响肉羊肉质、营养价值和风味的重要因素。
2、传统的动物育种是基于表型的选择，利用表型数据的统计分析来确定具有优良性状的家畜，然而肉质性状无法从活体中获取，一般只能在屠宰后测定得到，而且存在周期长、效率低下的问题。随着分子生物学、分子遗传学以及生物信息学的发展，通过挖掘肉羊肉质性状相关的候选基因和突变位点，利用分子标记辅助育种技术能够实现具有高熟肉率和棕榈油酸含量的肉羊品种早期选育的目的，该技术较传统育种而
3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性，是基因组中分布较为广泛的遗传标记，也是目前应用最为广泛的分子标记。snp具有遗传稳定性高、位点丰富且分布广泛、检测快速等优点，对于群体样本的性状分析具有较高的适用性，广泛应用于农学、生物以及生物进化等领域。当前已有肉质相关基因突变与脂肪酸组分的关联性snp标记的研究，如脂肪酸结合蛋白4基因(fatty acid binding protein 4，fabp4)g.62827699a>c、脂肪酸合成酶基因(fatty acid synthase，fasn)g.12316076a>c和钙蛋白酶抑制蛋白基因(calpastatin，cast)g.102045276c>t、g.102070394c>t和g.102015758t>c位点等可作为选育具有肉质和脂肪酸组分组合优良的蒙古羊品种的dna分子标记。但这些分子标记都应用在肉质脂肪酸成分调控中，而熟肉率和棕榈油酸含量在肉羊选育的早期选择中很少涉及，往往被忽视，同时也没有很好的方法用于此性状的选择。因此，开发与熟肉率和棕榈油酸含量等肉质性状相关的单核苷酸多态性，对于加快肉羊品质的遗传改良效率和筛选优质肉羊品种具有十分重要的战略意义。
技术实现思路
1、针对现有技术存在的问题，本专利技术提供了一种肉羊肉质性状相关snp分子标记，并提供了用于检测该分子标记的检测引物和检测试剂盒，以及snp分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用。本专利技术通过检测前述肉羊肉质性状相关snp分子标记的基因型，能够在育种过程中的任何时期尤其是肉羊断奶早期根据检测基因型实现肉质性状优良的肉羊选种，具有选育效率高、育种进程短、经济成本低等优势。此外本专利技术的snp分子标记兼顾了高熟肉率和高棕榈油酸两个肉质性状的选择，有利于提高培育或生产的羊肉的保水性和营养品质。
2、本专利技术具体通过以下技术方案实现：
3、本专利技术第一方面提供了一种snp分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，其中，r选自g或a中的一种。
4、进一步地，所述检测引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示，所述下游引物的核苷酸序列如seq id no.3所示。
5、进一步地，所述检测试剂盒包含如上所述的检测引物。
6、进一步地，所述肉质性状包括熟肉率和/或棕榈油酸含量。
7、本专利技术第二方面提供了一种用于检测snp分子标记的检测引物，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，其中，r选自g或a中的一种；所述检测引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示，所述下游引物的核苷酸序列如seq id no.3所示。
8、本专利技术第三方面提供了一种用于检测snp分子标记的检测试剂盒，所述检测试剂盒包含如上所述的检测引物。
9、进一步地，所述检测试剂盒还包括taq master mix。
10、本专利技术第四方面提供了一种肉羊肉质性状筛选的方法，包括以下步骤：
11、s1、提取待检肉羊的基因组dna；
12、s2、利用核苷酸序列如seq id no：2-3所示的检测引物对所述基因组dna进行pcr扩增，检测扩增产物中的snp分子标记，选择基因型为aa的肉羊个体作为候选肉羊品种；所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，其中，r选自g或a中的一种。
13、进一步地，所述pcr扩增的反应体系以20μl计，包括：2×taq master mix 10μl，上游引物0.5μl、下游引物0.5μl，模板dna 1μl和ddh2o 8μl；其中，上游引物和下游引物浓度为0.5μmol/l，模板dna的浓度小于5ng/μl。
14、进一步地，所述pcr扩增的反应程序包括：95℃预变性3min；95℃变性30s，60℃退火30s，72℃延伸30s，进行34个循环；72℃延伸5min。
15、进一步地，检测所述扩增产物中的snp分子标记的方法选自sanger测序法、焦磷酸测序法、合成测序法、连接测序法和离子半导体测序法中的一种。
16、本专利技术的优点及积极效果为：
17、本专利技术研究发现cryab基因第3外显子对应的单核苷酸多态性(snp)位点基因型aa个体，其熟肉率、棕榈油酸含量最大，对应的肉用品质和营养成分更好，而且基因型与表型一致高，因此提供了该snp分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，通过检测该snp分子标记的基因型，能够在育种过程中的任何时期尤其是肉羊断奶早期根据检测基因型实现肉质性状优良的肉羊选种，具有选育效率高、育种进程短、经济成本低等优势。此外本专利技术提供的snp分子标记具有更好的兼顾性，选育的基因型aa个体兼顾了高熟肉率和高棕榈油酸的特性，可以达到以上两个肉质性状兼选的目的，有利于提高培育或生产的羊肉的保本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种SNP分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中，R选自G或A中的一种。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述检测引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
3.根据权利要求1所述的SNP分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述检测试剂盒包含所述检测引物，所述检测引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
4.根据权利要求1所述的SNP分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述肉质性状包括熟肉率和/或棕榈油酸含量。
5.一种用于检测SNP分子标记的检测引物，其特征在于，所述检测引物包括上游引物和下游引物，所述上
6.一种用于检测SNP分子标记的检测试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含如权利要求5所述的检测引物。
7.根据权利要求6所述的用于检测SNP分子标记的检测试剂盒，其特征在于，还包括TaqMaster Mix。
8.一种肉羊肉质性状筛选的方法，其特征在于，包括以下步骤：
9.根据权利要求8所述的肉羊肉质性状筛选的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应体系以20μL计，包括：2×Taq Master Mix 10μL，上游引物0.5μL、下游引物0.5μL，模板DNA1μL和ddH2O 8μL；其中，上游引物和下游引物浓度为0.5μmol/L，模板DNA的浓度小于5ng/μL；
10.根据权利要求8所述的肉羊肉质性状筛选的方法，其特征在于，检测所述扩增产物中的SNP分子标记的方法选自sanger测序法、焦磷酸测序法、合成测序法、连接测序法和离子半导体测序法中的一种。
...【技术特征摘要】
1.一种snp分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，其中，r选自g或a中的一种。
2.根据权利要求1所述的snp分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述检测引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示，所述下游引物的核苷酸序列如seq id no.3所示。
3.根据权利要求1所述的snp分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述检测试剂盒包含所述检测引物，所述检测引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示，所述下游引物的核苷酸序列如seq id no.3所示。
4.根据权利要求1所述的snp分子标记、其检测引物或检测试剂盒在肉羊肉质性状筛选中的应用，其特征在于，所述肉质性状包括熟肉率和/或棕榈油酸含量。
5.一种用于检测snp分子标记的检测引物，其特征在于，所述检测引物...
【专利技术属性】
技术研发人员：曹阳，方文文，刘宇，杨少滢，缪立生，肖成，金海国，
申请(专利权)人：吉林省农业科学院中国农业科技东北创新中心，
类型：发明
国别省市：
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