【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学鉴定的，具体涉及用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的指纹图谱及其ssr引物组和应用。
技术介绍
1、凡纳滨对虾(litopenaeus vannamei)是世界上极具经济价值的甲壳类水产养殖品种，原产于美洲太平洋沿岸热带水域，北纬32°至南纬23°之间，在秘鲁中部沿岸至墨西哥桑诺拉沿海一带，以厄瓜多尔最集中，我国是凡纳滨对虾养殖大国，2021年产量近200万吨，占全世界凡纳滨对虾养殖总产量65％左右。然而，迄今为止，凡纳滨对虾在我国海域还没有形成种群的报道，只在海区中捕获少量个体。为保持我国凡纳滨对虾产业健康可持续发展，亟需解决其品系选育及种苗培育问题。近年来，我国先后选育出“中兴1号、渤海1号、广泰1号、海兴农2号、正金阳1号”等生长快、抗逆性强的凡纳滨对虾新品种，但尚未对这些凡纳滨对虾种质资源进行系统、有效的鉴定和分类。此外，多数凡纳滨对虾品种(系)采用近交的育种方式，亲本种质资源狭窄，经数代养殖后易出现优良性状退化等问题。因此，为了更合理地利用凡纳滨对虾种质资源、高质量开展良种选育工作，开发有效的鉴定方法对凡纳滨对虾新品种(系)培育、推广和知识产权保护等具有重要意义。
2、目前，凡纳滨对虾遗传育种研究苗种来源比较杂乱，仅采用物理和形态标记难以区分不同来源、不同品质的苗种，有必要寻找特异的分子标记，用以明确个体间亲缘关系，建立正确系谱关系，这样既有利于凡纳滨对虾家系的选育和亲本的管理，也有利于优良养殖品种的筛选和推广。目前，利用ssr分子标记对群体进行遗传背景是最为常用的一种方法，ssr分子标记具
技术实现思路
1、针对上述问题，本专利技术的目的在于提供一种用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的指纹图谱及其ssr引物组和应用。
2、本专利技术的
技术实现思路
如下：
3、本专利技术提供了一种用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的ssr引物组，包括ssr位点为lv1017、lv1021、lv1034、lv1065、lv1093、lv1113、lv1143、lv1186、lv1208、lv1237、lv1259、lv1279、lv1340、lv1378、lv1391的引物组；
4、所述lv1017位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.1和seq idno.2所示；
5、所述lv1021位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.3和seq idno.4所示；
6、所述lv1034位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.5和seq idno.6所示；
7、所述lv1065位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.7和seq idno.8所示；
8、所述lv1093位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.9和seq idno.10所示；
9、所述lv1113位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.11和seq idno.12所示；
10、所述lv1143位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.13和seq idno.14所示；
11、所述lv1186位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.15和seq idno.16所示；
12、所述lv1208位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.17和seq idno.18所示；
13、所述lv1237位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.19和seq idno.20所示；
14、所述lv1279位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.21和seq idno.22所示；
15、所述lv1340位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.23和seq idno.24所示；
16、所述lv1279位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.25和seq idno.26所示；
17、所述lv1378位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.27和seq idno.28所示；
18、所述lv1391位点的正向引物和反向引物的序列分别如seq id no.29和seq idno.30所示。
19、本专利技术还提供了上述ssr引物组在凡纳滨对虾家系遗传鉴定的应用。
20、本专利技术还提供了上述用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的ssr引物组应用于指纹图谱的构建。
21、本专利技术还提供了上述用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的指纹图谱的构建方法，包括如下步骤：
22、1)提取凡纳滨对虾的基因组dna；
23、2)以提取的dna为模板，以上述ssr引物组建立pcr反应体系，进行pcr扩增；
24、所述pcr扩增体系为：2×taq pcr master mix 5.0μl、基因组dna(～20ng)1.0μl、上游引物(浓度10pmol/μl)0.5μl、下游引物(浓度10pmol/μl)0.5、ddh2o 3.0μl；
25、所述pcr扩增程序为：95℃预变性5min；95℃变性30s，62～52℃梯度退火30s，72℃延伸30s，运行10个循环；95℃变性30s，52℃退火30s，72℃延伸30s，运行25个循环；72℃延伸20min，最后4℃保存；
26、3)pcr反应结束后，对扩增产物进行荧光毛细管电泳检测，得到上述ssr位点等位基因的片段长度，将不同引物的不同大小片段进行编号，“0”表示引物在某个个体物相应位点无相关大小条带，“1”表示引物在某个个体物相应位点有相关大小条带；
27、4)根据引物排列顺序与扩增片段大小，生成各样本二进制指纹图谱编码，将二进制编码转换成十六进制编码，使用在线条形码生成器，生成识别个体信息的条形码，即构建得到凡纳滨对虾指纹图谱，并获得对应的分子条形码；
28、根据以上ssr引物组绘制15个凡纳滨对虾全同胞家系dna指纹图谱，如图6所示，并获得如下120个指纹图谱编码：
29、6114005004088800000000000000；5134005004088800000000000000；
30、313400500a180800000000000000；5本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的SSR引物组，其特征在于，包括SSR位点为Lv1017、Lv1021、Lv1034、Lv1065、Lv1093、Lv1113、Lv1143、Lv1186、Lv1208、Lv1237、Lv1259、Lv1279、Lv1340、Lv1378、Lv1391的引物组。
2.根据权利要求1所述的用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的SSR引物组，其特征在于，所述Lv1017位点的正向引物和反向引物的序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示；
3.根据权利要求1所述的用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的SSR引物组，其特征在于，所述Lv1113位点的正向引物和反向引物的序列分别如SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示；
4.根据权利要求1所述的用于凡纳滨对虾家系遗传鉴定的SSR引物组，其特征在于，所述Lv1279位点的正向引物和反向引物的序列分别如SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22所示；
5.一种权利要求1～4任一项所述SSR引物组在凡纳滨对虾家系遗传鉴定的应用。
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