一种模型训练方法、抗菌肽预测方法及系统技术方案

技术编号:40986428 阅读:39 留言:0更新日期:2024-04-18 21:30
本申请公开了一种模型训练方法、抗菌肽预测方法及系统,其通过获取抗菌肽样本训练集和抗菌肽测试集,构建基于多头注意力机制的深度学习模型,采用抗菌肽样本训练集对深度学习模型进行数据训练,采用反向传播的方式优化深度学习模型的模型参数,获得优化深度学习模型,根据预设的模型评估指标,采用抗菌肽测试集对优化深度学习模型进行模型评估,获得模型评估结果,根据模型评估结果确定是否调整优化深度学习模型的模型参数,获取待预测多肽序列,将待预测多肽序列输入至优化深度学习模型,输出多肽预测结果。本申请能够使用基于多头注意力机制的深度学习模型,提高抗菌肽预测的准确性,有效挖掘抗菌肽资源,广泛应用于抗菌肽预测领域。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及抗菌肽预测,特别涉及一种模型训练方法、抗菌肽预测方法及系统


技术介绍

1、随着医疗科技的快速进步,人们的生活质量和健康状况已得到了显著改善。尤其是抗生素的发现,为我们治疗各种由微生物引起的疾病提供了强有力的手段。抗生素,作为一种小分子化合物,其主要作用方式是穿越细菌的细胞膜,与细菌内部的蛋白质靶标结合,从而抑制细菌的生长和繁殖。然而,由于抗生素的滥用,许多微生物已逐渐产生了对抗生素的耐药性。这使得原本可以有效治疗的抗生素对于某些耐药菌株无能为力,微生物耐药性的问题已经成为了全球性的挑战。因此,寻找可以替代抗生素的新型治疗方法变得越来越紧迫。

2、抗菌肽是一种有望替代抗生素的治疗手段,其主要作用方式是破坏细菌的细胞膜,使细胞内的物质泄漏出来,从而杀死病菌。例如,在革兰氏阴性菌中,抗菌肽主要是穿透细菌的外膜,破坏其内膜,形成跨膜的离子通道,破坏细胞膜的完整性,导致细胞内物质的泄漏,从而杀死细菌。由于这种作用方式,使得抗菌肽不易产生耐药性。

3、抗菌肽的研究在过去一直受限于各种因素。首先,抗菌肽的数据较少,这就限制了研究者在训本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种模型训练方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的模型训练方法,其特征在于,所述获取抗菌肽样本训练集和抗菌肽测试集这一步骤,具体包括:

3.根据权利要求2所述的模型训练方法,其特征在于,所述深度学习模型包括嵌入层、编码器层和任务提取层,所述构建基于多头注意力机制的深度学习模型,采用所述抗菌肽样本训练集对所述深度学习模型进行数据训练,采用反向传播的方式优化所述深度学习模型的模型参数,获得优化深度学习模型这一步骤,具体包括:

4.根据权利要求3所述的模型训练方法,其特征在于,所述输入所述抗菌肽样本训练集中的各个肽序列至所述嵌...

【技术特征摘要】

1.一种模型训练方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的模型训练方法,其特征在于,所述获取抗菌肽样本训练集和抗菌肽测试集这一步骤,具体包括:

3.根据权利要求2所述的模型训练方法,其特征在于,所述深度学习模型包括嵌入层、编码器层和任务提取层,所述构建基于多头注意力机制的深度学习模型,采用所述抗菌肽样本训练集对所述深度学习模型进行数据训练,采用反向传播的方式优化所述深度学习模型的模型参数,获得优化深度学习模型这一步骤,具体包括:

4.根据权利要求3所述的模型训练方法,其特征在于,所述输入所述抗菌肽样本训练集中的各个肽序列至所述嵌入层中,在所述嵌入层中对所述肽序列进行序列编码处理和嵌入处理,获得各所述肽序列对应的肽向量矩阵这一步骤,具体包括:

5.根据权利要求3所述的模型训练方法,其特征在于,所述编码器层包括多个子编码器层,所述权重矩阵包括第一权重矩阵、第二权重矩阵和第三权重矩阵...

【专利技术属性】
技术研发人员:张豫张志乾江翱吴奕瑞刘丽花陈西朋雷伟戈其珺林厚良何景涛杨敏
申请(专利权)人:态创生物科技广州有限公司
类型:发明
国别省市:

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